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基于線粒體D-loop區(qū)序列的中華鱉不同群體遺傳差異分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-18 18:27
  2018年5—11月期間,在太湖流域蘇州太倉(cāng)和武進(jìn)及洪澤湖流域宿遷泗洪地區(qū)采集69尾野生中華鱉Trionyx sinensis三個(gè)群體(太湖花鱉群體、太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體),測(cè)定分析腿部肌肉的線粒體D-loop區(qū)序列。結(jié)果顯示,在獲得的約515 bp堿基序列中,片段的同源性達(dá)到95.76%;存在變異的核苷酸位點(diǎn)共12個(gè),總變異率為2.43%;太湖花鱉群體、太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體的核苷酸多樣性(π)分別為0.0031、0.0014和0.0046,群內(nèi)序列同源性分別為99.23%、99.14%和98.95%;三個(gè)群體間遺傳距離為0.0479,太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體遺傳距離最。0.0165),太湖花鱉群體和洪澤湖鱉群體遺傳距離最大(0.0499)。用MEGA5.1軟件構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹表明,三個(gè)群體明顯分為兩支,太湖花鱉群體單獨(dú)聚類,太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體混合聚類且有一定的分化趨異。太湖花鱉群體與太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體之間遺傳差異已經(jīng)達(dá)到亞種間水平,三個(gè)群體的遺傳多樣性均處于較低水平,需予以重視,保護(hù)其種質(zhì)資源。 

【文章來源】:水產(chǎn)學(xué)雜志. 2020,33(05)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于線粒體D-loop區(qū)序列的中華鱉不同群體遺傳差異分析


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線粒體DNA進(jìn)化速度快,種群間的遺傳差異容易測(cè)出,已成為種內(nèi)和種間鑒定的良好標(biāo)記。群體間的遺傳距離是衡量群體遺傳分化的重要指標(biāo)[13]。根井正利[14]利用遺傳距離數(shù)值定量估計(jì)了物種的不同分類單位間的遺傳分化水平,指出種群間遺傳距離值的范圍是0~0.05,亞種間是0.02~0.2。本研究中,三個(gè)中華鱉群體間的遺傳距離均在0.05以下,說明三個(gè)群體之間的遺傳分化還處于群間水平;而太湖花鱉群體與太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體之間的遺傳距離均高于0.02,表明其群體間的遺產(chǎn)分化已達(dá)亞種間水平。MGEA軟件聚類分析發(fā)現(xiàn),中華鱉三個(gè)群體明顯分為兩支,太湖花鱉群體單獨(dú)聚類,太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體混合聚類,但也發(fā)現(xiàn)太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體有一定的分化趨異。太湖花鱉屬于中華鱉的地方特色品種,與中華鱉常規(guī)品種在形態(tài)上存在較大差異(圖1),本文則是從基因?qū)用鎸?duì)此表型差異,即遺傳分化已經(jīng)達(dá)到亞種間水平予以了揭示。這也與韓曉磊等[15]基于AFLP分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)太湖流域中華鱉花鱉群體和普通群體的研究結(jié)果相一致。當(dāng)然,太湖花鱉群體與太湖鱉群體和洪澤湖鱉群體之間分化水平的確定,還需要更多方面的研究予以論證。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]太湖流域中華鱉不同群體線粒體基因序列比較分析[J]. 韓曉磊,顧益,徐棉棉,沙永良,徐建榮,韓曜平.  常熟理工學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(04)
[2]太湖流域中華鱉不同群體遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 韓曉磊,顧益,潘林煒,沙永良,徐建榮,韓曜平.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(12)
[3]鳡魚群體遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 韓曉磊,徐建榮,李小蕊,伊紀(jì)峰,楊家新,許璞.  南京師大學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(01)
[4]瀕危魚類稀有白甲魚清水江種群mtDNA D-loop序列多態(tài)性[J]. 彭珊,代應(yīng)貴.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2009(02)
[5]三峽水庫(kù)巖原鯉線粒體控制區(qū)遺傳多樣性分析[J]. 朱成科,張其中,袁娟,羅芬.  西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(12)
[6]松江鱸群體遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 徐建榮,韓曉磊,李寧,郁建鋒,許璞,包振民.  大連水產(chǎn)學(xué)院學(xué)報(bào). 2008(06)

碩士論文
[1]姚江水系中華鱉種質(zhì)特征研究[D]. 唐偉.上海海洋大學(xué) 2015



本文編號(hào):3503389

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