雄性半滑舌鰨GH//IGF-I軸相關(guān)基因SNP和DNA甲基化與生長(zhǎng)的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-17 23:08
本文以人工養(yǎng)殖的雄性半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)個(gè)體為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,首次分析了GHR基因突變位點(diǎn)及其甲基化狀態(tài)對(duì)激素、生長(zhǎng)性狀及基因表達(dá)的影響機(jī)理;并對(duì)GH基因的編碼區(qū)及其啟動(dòng)子區(qū)域的多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性進(jìn)行了研究和分析。1雄性半滑舌鰨GHR基因多態(tài)性及與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析GHR是一種細(xì)胞表面受體,對(duì)GH功能的發(fā)揮具有必不可少的作用。本文的目的是檢測(cè)GHR基因的多態(tài)性并分析其與激素水平和生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性。結(jié)果顯示:在GHR基因檢測(cè)到兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性:SNP1[c.G1357A(p. Val376Ile)]位于外顯子8,稱為L(zhǎng)1位點(diǎn);SNP2(c.G1479A)位于外顯子9,稱為L(zhǎng)2位點(diǎn)。單因素方差分析顯示只有L1與性腺重(P≤0.05)、體重(P<0.01)和激素水平(P≤0.05)呈相關(guān)性。通過(guò)多重比較顯示,AA和AG基因型個(gè)體的體重和T3水平顯著高于GG基因型個(gè)體;AA和AG基因型個(gè)體的性腺重顯著低于GG基因型個(gè)體。這表明GHR基因編碼區(qū)突變進(jìn)可能影響雄性半滑舌鰨的生長(zhǎng)狀態(tài),并且L1位點(diǎn)可以作為半滑舌鰨的一個(gè)遺傳標(biāo)記。2雄性半滑舌鰨肝臟GHR基因甲...
【文章來(lái)源】:中國(guó)海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
酚-芳法提取的基因組DNA的電泳分析圖
圖 2-1 酚-芳法提取的基因組 DNA 的電泳分析圖Fig. 2-1 Agrose gel electrophoresis of genomic DNA by phenolchloroform method2.2 GHR 基因外顯子的多態(tài)性2.2.1 GHR 外顯子的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果RCR 擴(kuò)增每個(gè)外顯子片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)如圖 2,擴(kuò)增片段的條帶單一,且無(wú)雜帶和二聚體。
圖 2-3 GHR 基因型和測(cè)序分析。(A)外顯子 8 SSCP 圖及基因分型;(B)外顯子 9 SSCP 圖及基因分型;(C)外顯子 8 GG 型測(cè)序圖;(D)外顯子 8 AA 型測(cè)序圖;(E)外顯子 9 GG 型測(cè)序圖;(F)外顯子 9 AA型測(cè)序圖。Fig. 2-3. GHR gene genotyping and sequencing confirmation. (A) Band pattern for genotypes (GG and AA ) ofL1 locus in exon 8; (B) Band pattern for genotypes (GG and AA ) of L2 locus in exon 9. The chromatogramsshow sequences of the two SNPs (c. G1357A and c.G1479A): the number indicates the position of mutation site;(C) sequence of GG genotype in exon 8; (D) equence of AA genotype in exon 8; (E) equence of GG genotype inexon 9; (F) equence of AA genotype in exon 9.2.3 兩個(gè) SNP 位點(diǎn)與所測(cè)性狀的相關(guān)性分析統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表 2 所示,L1 位點(diǎn)與雄性半滑舌鰨 T3水平、性腺重和體重呈顯著相關(guān),而 L2 位點(diǎn)與所測(cè)性狀無(wú)顯著相關(guān)。此外,多重比較顯示:L1 位點(diǎn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州小香雞GH基因SNP與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性分析[J]. 黃波,劉若余,艾蓉,田海蓉. 中國(guó)家禽. 2012(03)
[2]牙鲆GH基因第1外顯子區(qū)微衛(wèi)星標(biāo)記與幼魚(yú)生長(zhǎng)性狀的相關(guān)分析[J]. 倪靜,尤鋒,劉思思,吳志昊,徐冬冬,文愛(ài)韻,徐永立,張培軍. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2011(05)
[3]建鯉GHR基因多態(tài)性及與增重相關(guān)的SNP位點(diǎn)的篩選[J]. 陶文靜,馬龍俊,阮瑞霞,俞菊華. 水生生物學(xué)報(bào). 2011(04)
[4]吉富羅非魚(yú)兩種生長(zhǎng)激素受體基因的分離及與增重相關(guān)的SNPs位點(diǎn)[J]. 阮瑞霞,俞菊華,李紅霞,李建林,唐永凱,魏可鵬. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2011(03)
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[6]五指山豬GH、IGFBP3基因SNPs檢測(cè)及與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯冠彧,曾鴻普,周漢林,王東勁,管松,馬月輝. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(03)
[7]大口黑鱸肌肉生長(zhǎng)抑制素基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的篩選及其與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性分析[J]. 于凌云,白俊杰,樊佳佳,李小慧,葉星. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(06)
[8]羅非魚(yú)MC4R基因克隆及與其生長(zhǎng)相關(guān)的SNPs位點(diǎn)[J]. 劉福平,白俊杰,葉星,李勝杰,李小慧,于凌云. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2009(06)
[9]小型豬生長(zhǎng)激素基因啟動(dòng)子區(qū)SNPs分析[J]. 鄭茂恩,潘登科,馮書(shū)堂,劉曉,葉紹輝,浦亞斌,何曉紅,趙倩君,關(guān)偉軍,馬月輝. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[10]半滑舌鰨生物學(xué)特性與養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 頡曉勇,李加兒,李純厚,區(qū)又君,陳利雄. 水產(chǎn)科技. 2009(02)
碩士論文
[1]牙鲆三種細(xì)胞色素P450酶基因SNP與繁殖內(nèi)分泌相關(guān)性分析[D]. 馬瑞芹.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
本文編號(hào):3501801
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酚-芳法提取的基因組DNA的電泳分析圖
圖 2-1 酚-芳法提取的基因組 DNA 的電泳分析圖Fig. 2-1 Agrose gel electrophoresis of genomic DNA by phenolchloroform method2.2 GHR 基因外顯子的多態(tài)性2.2.1 GHR 外顯子的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果RCR 擴(kuò)增每個(gè)外顯子片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)如圖 2,擴(kuò)增片段的條帶單一,且無(wú)雜帶和二聚體。
圖 2-3 GHR 基因型和測(cè)序分析。(A)外顯子 8 SSCP 圖及基因分型;(B)外顯子 9 SSCP 圖及基因分型;(C)外顯子 8 GG 型測(cè)序圖;(D)外顯子 8 AA 型測(cè)序圖;(E)外顯子 9 GG 型測(cè)序圖;(F)外顯子 9 AA型測(cè)序圖。Fig. 2-3. GHR gene genotyping and sequencing confirmation. (A) Band pattern for genotypes (GG and AA ) ofL1 locus in exon 8; (B) Band pattern for genotypes (GG and AA ) of L2 locus in exon 9. The chromatogramsshow sequences of the two SNPs (c. G1357A and c.G1479A): the number indicates the position of mutation site;(C) sequence of GG genotype in exon 8; (D) equence of AA genotype in exon 8; (E) equence of GG genotype inexon 9; (F) equence of AA genotype in exon 9.2.3 兩個(gè) SNP 位點(diǎn)與所測(cè)性狀的相關(guān)性分析統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表 2 所示,L1 位點(diǎn)與雄性半滑舌鰨 T3水平、性腺重和體重呈顯著相關(guān),而 L2 位點(diǎn)與所測(cè)性狀無(wú)顯著相關(guān)。此外,多重比較顯示:L1 位點(diǎn)
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期刊論文
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[4]吉富羅非魚(yú)兩種生長(zhǎng)激素受體基因的分離及與增重相關(guān)的SNPs位點(diǎn)[J]. 阮瑞霞,俞菊華,李紅霞,李建林,唐永凱,魏可鵬. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2011(03)
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[6]五指山豬GH、IGFBP3基因SNPs檢測(cè)及與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯冠彧,曾鴻普,周漢林,王東勁,管松,馬月輝. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(03)
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[9]小型豬生長(zhǎng)激素基因啟動(dòng)子區(qū)SNPs分析[J]. 鄭茂恩,潘登科,馮書(shū)堂,劉曉,葉紹輝,浦亞斌,何曉紅,趙倩君,關(guān)偉軍,馬月輝. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[10]半滑舌鰨生物學(xué)特性與養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 頡曉勇,李加兒,李純厚,區(qū)又君,陳利雄. 水產(chǎn)科技. 2009(02)
碩士論文
[1]牙鲆三種細(xì)胞色素P450酶基因SNP與繁殖內(nèi)分泌相關(guān)性分析[D]. 馬瑞芹.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
本文編號(hào):3501801
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