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基于線粒體COⅠ的南海北部長棘銀鱸遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2021-11-13 05:14
  為了解中國長棘銀鱸(Gerres filamentosus)的遺傳背景以更好地保護與開發(fā)利用種質資源,測定了南海北部7個群體線粒體COⅠ基因5′端序列,以分析其遺傳多樣性和遺傳結構。結果發(fā)現(xiàn),176尾長棘銀鱸652 bp序列中有25個單倍型,155個變異位點。7個群體整體呈現(xiàn)較高的單倍型多樣性(Hd=0.767±0.018)與較低的核苷酸多樣性(π=0.055 0±0.003 7)。就遺傳多樣性指數而言,碣石群體(Hd=0.606±0.092,π=0.059 2±0.006 6)最高,次高為陽江群體(Hd=0.323±0.102,π=0.027 0±0.010 7);瓊海群體(Hd=0.560±0.125,π=0.001 0±0.000 3)最低,次低為陵水群體(Hd=0.685±0.077,π=0.001 5±0.000 3)。群體遺傳分化系數Fst顯示,碣石、陽江群體與其他群體間存在高度(極顯著)的遺傳分化(Fst=0.517 1... 

【文章來源】:海洋漁業(yè). 2020,42(03)北大核心CSCD

【文章頁數】:9 頁

【部分圖文】:

基于線粒體COⅠ的南海北部長棘銀鱸遺傳多樣性分析


長棘銀鱸單倍型網絡圖

核苷酸,碣石,東興,瓊海


表4 長棘銀鱸中性檢驗和不對稱分析Tab.4 Neutrality tests and mismatch analysisof G. filamentosus 群體Population Tajima’s D Fu’s Fs test SSD Rg JS 3.281 3 21.930 0.464 1*** 0.179 0 YJ -0.442 5 19.719 0.046 5* 0.476 1 QH -0.010 9 -0.072 1 0.024 4 0.191 0 LS -1.518 6* -3.293 6** 0.010 7 0.120 9 DF -2.590 6*** 9.479 7 0.025 0 0.162 1 XY -2.650 4*** 2.255 5 0.006 9 0.078 2 DX -1.429 9 -2.075 5 0.010 1 0.069 3 總體Total -0.765 9 6.849 1 0.084 0 0.182 4 注:JS:碣石;YJ:陽江;QH:瓊海;LS:陵水;DF:東方;XY:新盈;DX:東興。*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01; ***:P<0.001Note:JS:Jieshi;YJ:Yangjiang;QH:Qionghai;LS:Lingshui;DF:Dongfang;XY:Xinying;DX:Dongxing.*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01;***:P<0.0013 討論

【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于COI基因和D-loop區(qū)部分序列比較雷州半島東、西岸湖棲鰭蝦虎魚群體的遺傳多樣性[J]. 廖健,龍水生,賀亮,郭昱嵩,劉楚吾,劉麗,王中鐸.  海洋科學. 2017(02)
[2]淺地層剖面揭示瓊州海峽的形成時代[J]. 倪玉根,夏真,馬勝中.  海洋地質與第四紀地質. 2014(04)
[3]北部灣秋季底層魚類多樣性和優(yōu)勢種數量的變動趨勢[J]. 王雪輝,邱永松,杜飛雁,林昭進,孫典榮,黃碩琳.  生態(tài)學報. 2012(02)
[4]一種高效快速的魚類標本基因組DNA提取方法[J]. 樂小亮,章群,趙爽,范鳳娟.  生物技術通報. 2010(02)
[5]瓊州海峽成因與時代[J]. 趙煥庭,王麗榮,袁家義.  海洋地質與第四紀地質. 2007(02)
[6]北部灣主要經濟魚類資源變動分析及保護對策探討[J]. 孫典榮,林昭進.  熱帶海洋學報. 2004(02)
[7]海南島海岸環(huán)境特征[J]. 王穎.  海洋地質動態(tài). 2002(03)
[8]數值分類法在中國銀鱸屬魚種分類研究中的應用[J]. 劉靜,田明誠.  海洋科學. 1997(01)



本文編號:3492392

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