基于DNA條形碼的長江上游江津段魚類早期資源種類鑒定
發(fā)布時間:2021-11-04 04:30
準確鑒定魚卵的種類是開展魚類早期資源研究和評估魚類資源年際補充量重要的前提。本研究采用DNA條形碼技術(shù),選擇Cyt b基因作為標記基因,使用合適的通用引物對其PCR擴增,經(jīng)過測序和序列分析,對長江上游江津江段所采集到的漂流性卵和人工魚巢上的粘性卵進行種類鑒定,以期為魚類早期資源種類鑒定建立一種快速、準確的分子鑒定方法。其主要研究結(jié)果如下:1.基于DNA條形碼魚類早期資源種類鑒定技術(shù)的建立DNA條形碼技術(shù)鑒定魚卵種類的關(guān)鍵在于魚卵DNA的提取、通用引物的篩選以及PCR擴增。本研究比較了3種單枚魚卵DNA提取方式,3對通用引物的擴增效果和測序結(jié)果的準確度。最后選擇快速提取魚卵DNA法作為單枚魚卵DNA的提取方法,通用引物對1 H15149/L14735作為擴增魚類Cyt b基因上長度為464bp的DNA片段。再將未經(jīng)純化的PCR產(chǎn)物送至測序,將測序所得的序列處理后在NCBI數(shù)據(jù)庫中利用自帶的blast軟件進行序列比對和物種鑒定。堿基相似度在98%之上的即可認為是同一種魚。2.2014年長江上游江津段人工魚巢上的粘性卵種類鑒定2014年4月29日、5月11日選取了長江上游江津段順江、朱楊和龍...
【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 魚類早期資源調(diào)查
1.2 魚類物種鑒定方法
1.2.1 形態(tài)學鑒定方法
1.2.2 分子生物學鑒定方法
1.3 DNA條形碼和Cyt b基因在物種鑒定中的應用
1.4 長江上游江津段產(chǎn)卵場概況
第二章 引言
2.1 選題意義
2.2 研究目標
2.3 研究內(nèi)容
2.4 技術(shù)路線
第三章 基于DNA條形碼魚卵種類鑒定技術(shù)的建立
3.1 材料與試劑
3.1.1 實驗材料
3.1.2 實驗試劑
3.1.3 實驗儀器與設備
3.2 實驗方法
3.2.1 單枚魚卵DNA提取方法
3.2.2 三對通用引物擴增體系
3.2.3 瓊脂糖凝膠電泳
3.2.4 DNA序列分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 單枚魚卵DNA提取方法的比較
3.3.2 三對通用引物擴增效果的比較
3.4 討論
第四章 基于DNA條形碼的長江重慶江津段粘性卵種類鑒定
4.1 材料與方法
4.1.1 采樣點設置
4.1.2 魚類早期資源的采集
4.1.3 魚類早期資源的種類鑒定
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 2014年人工魚巢采樣點魚類早期資源種類鑒定結(jié)果
4.2.2 2015年人工魚巢采樣點魚類早期資源種類鑒定結(jié)果
4.3 討論
第五章 基于DNA條形碼的長江上游江津段漂流性卵種類鑒定
5.1 材料與方法
5.1.1 采樣點設置
5.1.2 魚類早期資源的采集
5.1.3 魚類早期資源的種類鑒定
5.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
第六章 長江重慶江津段人工魚巢產(chǎn)卵場水生生物和水質(zhì)環(huán)境調(diào)查
6.1 材料與方法
6.1.1 水體基本理化性質(zhì)測定
6.1.2 浮游生物樣本采集、種類鑒定及計數(shù)
6.1.3 水質(zhì)環(huán)境評價方法
6.2 結(jié)果與討論
6.2.1 水體基本理化性質(zhì)分析
6.2.2 浮游生物種類組成及多樣性
6.3 討論
第七章 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文及參與科研項目
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文
參與科研項目
【參考文獻】:
期刊論文
[1]長江上游宜賓江段漁業(yè)資源現(xiàn)狀研究[J]. 熊飛,劉紅艷,段辛斌,劉紹平,陳大慶. 西南大學學報(自然科學版). 2015(11)
[2]金沙江一期工程蓄水前長江上游產(chǎn)漂流性卵魚類產(chǎn)卵場現(xiàn)狀[J]. 段辛斌,田輝伍,高天珩,劉紹平,王珂,陳大慶. 長江流域資源與環(huán)境. 2015(08)
[3]長江上游江津和宜賓江段圓口銅魚資源量估算[J]. 熊飛,劉紅艷,段辛斌,劉紹平,陳大慶. 動物學雜志. 2014(06)
[4]磁縣“四電六動”工作機制助力農(nóng)技推廣——記河北省磁縣基層農(nóng)技推廣體系改革與建設[J]. 李樹洋,王明海. 基層農(nóng)技推廣. 2014(10)
[5]人工魚巢在固化河堤河道中提升魚的繁殖能力的作用[J]. 吳宗耀. 基層農(nóng)技推廣. 2014(10)
[6]大茶湖浮游藻類調(diào)查與水質(zhì)初步評價[J]. 王亞尼,周序協(xié),張桂蓉,魏開建,阮宜兵. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
[7]南海海域紅斑后海螯蝦(Metanephrops thomsoni)的分子識別與群體遺傳分化[J]. 范艷波,王中鐸,郭昱嵩,顏云榕,劉楚吾. 海洋與湖沼. 2013(01)
[8]我國32種鳥類DNA條形碼分析[J]. 馬明義,閆穎,王譯偉,李靜,蔡延森,李佳凌. 四川動物. 2012(05)
[9]基于Cytb基因的魚類加工產(chǎn)品的魚種鑒定[J]. 張洪沂,柴平海,梅艷巧,鄧恬寧. 華北農(nóng)學報. 2011(S2)
[10]聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性和芯片生物分析技術(shù)用于渤海地區(qū)魚種鑒定[J]. 李瀟,曲焱焱,張丕喬,張津,張麗華,黃大亮,張玉奎. 色譜. 2011(07)
博士論文
[1]長江魚類早期形態(tài)發(fā)育與種類鑒別[D]. 喬曄.中國科學院研究生院(水生生物研究所) 2005
碩士論文
[1]長江上游江津江段魚類早期資源研究[D]. 唐錫良.西南大學 2010
[2]長江上游魚類資源現(xiàn)狀及早期資源調(diào)查研究[D]. 段辛斌.華中農(nóng)業(yè)大學 2008
本文編號:3475007
【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 魚類早期資源調(diào)查
1.2 魚類物種鑒定方法
1.2.1 形態(tài)學鑒定方法
1.2.2 分子生物學鑒定方法
1.3 DNA條形碼和Cyt b基因在物種鑒定中的應用
1.4 長江上游江津段產(chǎn)卵場概況
第二章 引言
2.1 選題意義
2.2 研究目標
2.3 研究內(nèi)容
2.4 技術(shù)路線
第三章 基于DNA條形碼魚卵種類鑒定技術(shù)的建立
3.1 材料與試劑
3.1.1 實驗材料
3.1.2 實驗試劑
3.1.3 實驗儀器與設備
3.2 實驗方法
3.2.1 單枚魚卵DNA提取方法
3.2.2 三對通用引物擴增體系
3.2.3 瓊脂糖凝膠電泳
3.2.4 DNA序列分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 單枚魚卵DNA提取方法的比較
3.3.2 三對通用引物擴增效果的比較
3.4 討論
第四章 基于DNA條形碼的長江重慶江津段粘性卵種類鑒定
4.1 材料與方法
4.1.1 采樣點設置
4.1.2 魚類早期資源的采集
4.1.3 魚類早期資源的種類鑒定
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 2014年人工魚巢采樣點魚類早期資源種類鑒定結(jié)果
4.2.2 2015年人工魚巢采樣點魚類早期資源種類鑒定結(jié)果
4.3 討論
第五章 基于DNA條形碼的長江上游江津段漂流性卵種類鑒定
5.1 材料與方法
5.1.1 采樣點設置
5.1.2 魚類早期資源的采集
5.1.3 魚類早期資源的種類鑒定
5.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
第六章 長江重慶江津段人工魚巢產(chǎn)卵場水生生物和水質(zhì)環(huán)境調(diào)查
6.1 材料與方法
6.1.1 水體基本理化性質(zhì)測定
6.1.2 浮游生物樣本采集、種類鑒定及計數(shù)
6.1.3 水質(zhì)環(huán)境評價方法
6.2 結(jié)果與討論
6.2.1 水體基本理化性質(zhì)分析
6.2.2 浮游生物種類組成及多樣性
6.3 討論
第七章 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文及參與科研項目
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文
參與科研項目
【參考文獻】:
期刊論文
[1]長江上游宜賓江段漁業(yè)資源現(xiàn)狀研究[J]. 熊飛,劉紅艷,段辛斌,劉紹平,陳大慶. 西南大學學報(自然科學版). 2015(11)
[2]金沙江一期工程蓄水前長江上游產(chǎn)漂流性卵魚類產(chǎn)卵場現(xiàn)狀[J]. 段辛斌,田輝伍,高天珩,劉紹平,王珂,陳大慶. 長江流域資源與環(huán)境. 2015(08)
[3]長江上游江津和宜賓江段圓口銅魚資源量估算[J]. 熊飛,劉紅艷,段辛斌,劉紹平,陳大慶. 動物學雜志. 2014(06)
[4]磁縣“四電六動”工作機制助力農(nóng)技推廣——記河北省磁縣基層農(nóng)技推廣體系改革與建設[J]. 李樹洋,王明海. 基層農(nóng)技推廣. 2014(10)
[5]人工魚巢在固化河堤河道中提升魚的繁殖能力的作用[J]. 吳宗耀. 基層農(nóng)技推廣. 2014(10)
[6]大茶湖浮游藻類調(diào)查與水質(zhì)初步評價[J]. 王亞尼,周序協(xié),張桂蓉,魏開建,阮宜兵. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
[7]南海海域紅斑后海螯蝦(Metanephrops thomsoni)的分子識別與群體遺傳分化[J]. 范艷波,王中鐸,郭昱嵩,顏云榕,劉楚吾. 海洋與湖沼. 2013(01)
[8]我國32種鳥類DNA條形碼分析[J]. 馬明義,閆穎,王譯偉,李靜,蔡延森,李佳凌. 四川動物. 2012(05)
[9]基于Cytb基因的魚類加工產(chǎn)品的魚種鑒定[J]. 張洪沂,柴平海,梅艷巧,鄧恬寧. 華北農(nóng)學報. 2011(S2)
[10]聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性和芯片生物分析技術(shù)用于渤海地區(qū)魚種鑒定[J]. 李瀟,曲焱焱,張丕喬,張津,張麗華,黃大亮,張玉奎. 色譜. 2011(07)
博士論文
[1]長江魚類早期形態(tài)發(fā)育與種類鑒別[D]. 喬曄.中國科學院研究生院(水生生物研究所) 2005
碩士論文
[1]長江上游江津江段魚類早期資源研究[D]. 唐錫良.西南大學 2010
[2]長江上游魚類資源現(xiàn)狀及早期資源調(diào)查研究[D]. 段辛斌.華中農(nóng)業(yè)大學 2008
本文編號:3475007
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3475007.html
最近更新
教材專著