海南鹿角珊瑚屬DNA條形碼和系統(tǒng)進(jìn)化研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-03 04:38
鹿角珊瑚屬(Acropora)是印度-太平洋區(qū)系的第一大造礁石珊瑚屬,種類最多,變異大,僅依靠傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)很難鑒定。本次實(shí)驗(yàn)利用兩種核DNA (PaxC內(nèi)含子和ITS)和兩種線粒體DNA (CR和COI)分子標(biāo)記對(duì)海南周邊海域7種鹿角珊瑚進(jìn)行DNA條形碼篩選和系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果顯示:1)本研究的7種鹿角珊瑚的核DNA分子序列的遺傳多樣性和遺傳距離均高于線粒體基因,其中ITS序列的遺傳多樣性和遺傳距離都相對(duì)高于其他分子標(biāo)記;诤薉NA分子標(biāo)記的鼻形鹿角珊瑚(Acropora nasuta)和石松鹿角珊瑚(Acropora selago)的種間遺傳距離都是最小的,且二者形態(tài)學(xué)特征也相似,說(shuō)明兩種鹿角珊瑚種間親緣關(guān)系較近。2)兩種核DNA分子標(biāo)記(PaxC內(nèi)含子和ITS)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)都能將7種鹿角珊瑚分成樹(shù)枝類、密簇類、密簇傘房類和傘房類。PaxC能將傘房鹿角珊瑚(Acropora corymosa)、多孔鹿角珊瑚(Acropora millepora)、細(xì)枝鹿角珊瑚(Acropora nana)和寬片鹿角珊瑚(Acropora lutkeni)鑒定到種,而ITS只能將寬片鹿角珊瑚鑒定到...
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1樣品采集點(diǎn)圖
舉值大于50。??進(jìn)化樹(shù)顯示,本實(shí)驗(yàn)所獲的7種鹿角珊瑚PoxC?序列聚成4個(gè)可靠分支(見(jiàn)??圖3):?I)樹(shù)枝類(寬片鹿角珊瑚),II)密簇和密簇傘房類(鼻形鹿角珊瑚、強(qiáng)??壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚),III)細(xì)枝鹿角珊瑚、IV)傘房類(傘房鹿角珊瑚??和多孔鹿角珊瑚)。其中傘房鹿角珊瑚、多孔鹿角珊瑚、細(xì)枝鹿角珊瑚、寬片鹿??角珊瑚均單獨(dú)聚集在一起,成功分類到種階元。??在進(jìn)化支II內(nèi),密簇類的鼻形鹿角珊瑚和密簇傘房類的石松鹿角珊瑚、強(qiáng)??壯鹿角珊瑚聚在一起,盡管強(qiáng)壯鹿角珊瑚與其它兩種珊瑚的八序列有著微小??程度的重疊,但大部分的強(qiáng)壯鹿角珊瑚樣品明顯聚成一個(gè)亞支,與其它兩種鹿角??珊瑚分離。鼻形鹿角珊瑚、強(qiáng)壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚群體形態(tài)極其相似,在??進(jìn)化樹(shù)上也混聚在一個(gè)分支上,因此很難對(duì)其進(jìn)行種的劃分。??分支IV包含多孔鹿角珊瑚和傘房鹿角珊瑚兩個(gè)種的
20圖4ITS貝葉斯進(jìn)化樹(shù)??注:不同顏色代表不同種,顏色代表同PoxC??Fig.?4?Bayesian?inference?tree?of?the?ITS??
本文編號(hào):3473061
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1樣品采集點(diǎn)圖
舉值大于50。??進(jìn)化樹(shù)顯示,本實(shí)驗(yàn)所獲的7種鹿角珊瑚PoxC?序列聚成4個(gè)可靠分支(見(jiàn)??圖3):?I)樹(shù)枝類(寬片鹿角珊瑚),II)密簇和密簇傘房類(鼻形鹿角珊瑚、強(qiáng)??壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚),III)細(xì)枝鹿角珊瑚、IV)傘房類(傘房鹿角珊瑚??和多孔鹿角珊瑚)。其中傘房鹿角珊瑚、多孔鹿角珊瑚、細(xì)枝鹿角珊瑚、寬片鹿??角珊瑚均單獨(dú)聚集在一起,成功分類到種階元。??在進(jìn)化支II內(nèi),密簇類的鼻形鹿角珊瑚和密簇傘房類的石松鹿角珊瑚、強(qiáng)??壯鹿角珊瑚聚在一起,盡管強(qiáng)壯鹿角珊瑚與其它兩種珊瑚的八序列有著微小??程度的重疊,但大部分的強(qiáng)壯鹿角珊瑚樣品明顯聚成一個(gè)亞支,與其它兩種鹿角??珊瑚分離。鼻形鹿角珊瑚、強(qiáng)壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚群體形態(tài)極其相似,在??進(jìn)化樹(shù)上也混聚在一個(gè)分支上,因此很難對(duì)其進(jìn)行種的劃分。??分支IV包含多孔鹿角珊瑚和傘房鹿角珊瑚兩個(gè)種的
20圖4ITS貝葉斯進(jìn)化樹(shù)??注:不同顏色代表不同種,顏色代表同PoxC??Fig.?4?Bayesian?inference?tree?of?the?ITS??
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