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海南鹿角珊瑚屬DNA條形碼和系統(tǒng)進化研究

發(fā)布時間:2021-11-03 04:38
  鹿角珊瑚屬(Acropora)是印度-太平洋區(qū)系的第一大造礁石珊瑚屬,種類最多,變異大,僅依靠傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)很難鑒定。本次實驗利用兩種核DNA (PaxC內(nèi)含子和ITS)和兩種線粒體DNA (CR和COI)分子標(biāo)記對海南周邊海域7種鹿角珊瑚進行DNA條形碼篩選和系統(tǒng)進化分析,結(jié)果顯示:1)本研究的7種鹿角珊瑚的核DNA分子序列的遺傳多樣性和遺傳距離均高于線粒體基因,其中ITS序列的遺傳多樣性和遺傳距離都相對高于其他分子標(biāo)記�;诤薉NA分子標(biāo)記的鼻形鹿角珊瑚(Acropora nasuta)和石松鹿角珊瑚(Acropora selago)的種間遺傳距離都是最小的,且二者形態(tài)學(xué)特征也相似,說明兩種鹿角珊瑚種間親緣關(guān)系較近。2)兩種核DNA分子標(biāo)記(PaxC內(nèi)含子和ITS)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹都能將7種鹿角珊瑚分成樹枝類、密簇類、密簇傘房類和傘房類。PaxC能將傘房鹿角珊瑚(Acropora corymosa)、多孔鹿角珊瑚(Acropora millepora)、細枝鹿角珊瑚(Acropora nana)和寬片鹿角珊瑚(Acropora lutkeni)鑒定到種,而ITS只能將寬片鹿角珊瑚鑒定到... 

【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:53 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

海南鹿角珊瑚屬DNA條形碼和系統(tǒng)進化研究


圖1樣品采集點圖

序列,顏色,石松,細枝


舉值大于50。??進化樹顯示,本實驗所獲的7種鹿角珊瑚PoxC?序列聚成4個可靠分支(見??圖3):?I)樹枝類(寬片鹿角珊瑚),II)密簇和密簇傘房類(鼻形鹿角珊瑚、強??壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚),III)細枝鹿角珊瑚、IV)傘房類(傘房鹿角珊瑚??和多孔鹿角珊瑚)。其中傘房鹿角珊瑚、多孔鹿角珊瑚、細枝鹿角珊瑚、寬片鹿??角珊瑚均單獨聚集在一起,成功分類到種階元。??在進化支II內(nèi),密簇類的鼻形鹿角珊瑚和密簇傘房類的石松鹿角珊瑚、強??壯鹿角珊瑚聚在一起,盡管強壯鹿角珊瑚與其它兩種珊瑚的八序列有著微小??程度的重疊,但大部分的強壯鹿角珊瑚樣品明顯聚成一個亞支,與其它兩種鹿角??珊瑚分離。鼻形鹿角珊瑚、強壯鹿角珊瑚和石松鹿角珊瑚群體形態(tài)極其相似,在??進化樹上也混聚在一個分支上,因此很難對其進行種的劃分。??分支IV包含多孔鹿角珊瑚和傘房鹿角珊瑚兩個種的

顏色,貝葉斯,進化樹


20圖4ITS貝葉斯進化樹??注:不同顏色代表不同種,顏色代表同PoxC??Fig.?4?Bayesian?inference?tree?of?the?ITS??


本文編號:3473061

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