基于線粒體控制區(qū)的商城肥鯢譜系地理學和保護遺傳學研究
發(fā)布時間:2021-10-29 04:22
商城肥鯢為我國特有的有尾兩棲動物,也是大別山區(qū)的特有種,其分布區(qū)極其狹窄。本研究利用Genebank中的商城肥鯢和新疆北鯢的線粒體基因全序列成功設計出擴增線粒體基因組控制區(qū)(mtDNA D-loop)的引物,并擴增了來自大別山區(qū)的白馬尖-鷂落坪-明堂山(BYM)、天堂寨-馬鬃嶺(TM)、王寨-黃柏山-九峰尖(KHJ)、金剛臺周邊地區(qū)(JGT)四個地理種群175個商城肥鯢樣品的D-loop序列,分析了它的遺傳多樣性、譜系地理學模式和保護遺傳學等方面,得出如下的一些主要成果:(1)商城肥鯢的遺傳多樣性較低在TM種群中,有10個單倍型,其單倍型多樣性為0.7853士0.0587,核苷酸多樣性為0.0050士0.0034,都顯示較高的遺傳多樣性;而與它相比,在KHJ種群中,僅有2個單倍型,其單倍型多樣性為0.1079士0.0680,核苷酸多樣性為0.0001士0.0003,都顯示出很低的遺傳多樣性。綜合來看,四個種群的遺傳多樣性中,TM種群的最高,而KHJ種群的最低,其他兩個種群居中。另外,總體上與其他瀕危動物,如大鯢(Andrias davidianus)等相比,商城肥鯢的遺傳多樣性水平相對...
【文章來源】:安徽大學安徽省 211工程院校
【文章頁數】:62 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1 譜系地理學
1.1 譜系地理學定義
1.2 譜系地理學研究內容與進展
1.3 譜系地理學研究進展
2 保護遺傳學
2.1 保護遺傳學的概念和研究內容
2.2 保護遺傳學的產生發(fā)展
2.3 保護遺傳學研究領域
2.3.1 物種保護相關單元確定
2.3.2 遺傳多樣性
2.3.3 近交、遠交衰退
3 分子標記的選用
4 大別山區(qū)簡介
4.1 大別山區(qū)地理環(huán)境
4.2 關于大別山物種的研究背景
5 第四紀冰期綜述
6 商城肥鯢概況
6.1 分類歷史簡介
6.2 形態(tài)特征、生活習性與分布
6.3 資源現狀
第二章 基于控制區(qū)對商城肥鯢的遺傳多樣性及譜系地理學研究
1 材料和方法
1.1 實驗試劑與儀器
1.2 樣品采集與保存
1.3 溶液及凝膠配制
1.4 總DNA提取
1.5 引物設計
1.6 目標片段擴增、測序
1.7 數據整理和分析
1.7.1 序列拼接與比對
1.7.2 遺傳多樣性分析
1.7.3 遺傳結構與譜系地理學分析
1.7.4 種群動態(tài)分析
2 結果
2.1 樣品采集情況
2.2 線粒體基因擴增與測序結果
2.3 數據的整理和分析結果
2.3.1 遺傳多樣性分析
2.3.2 遺傳結構分析
2.3.3 譜系地理學分析
2.3.4 種群動態(tài)分析
3 討論
3.1 商城肥鯢的遺傳多樣性
3.2 商城肥鯢的譜系地理學研究
3.3 商城肥鯢種群動態(tài)分析
3.4 商城肥鯢的保護遺傳學分析
3.5 關于大別山區(qū)物種特異性分析
第三章 總結
參考文獻
致謝
攻讀學位期間已發(fā)表的論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大別山地區(qū)兩棲爬行動物區(qū)系調查[J]. 潘濤,周文良,史文博,趙凱,陳錦云,汪文革,儲俊,蒲發(fā)光,顧長明,張保衛(wèi). 動物學雜志. 2014(02)
[2]金寨天馬國家級自然保護區(qū)鳥類多樣性監(jiān)測[J]. 蒲發(fā)光. 農技服務. 2013(07)
[3]安徽岳西大別山區(qū)爬行動物新記錄——平胸龜(Platysternon megacephalum)[J]. 潘濤,汪文革,汪龍春,陳智勇,張保衛(wèi). 安徽大學學報(自然科學版). 2013(04)
[4]湖北地區(qū)兩棲動物分布與地理區(qū)劃研究[J]. 段海生,楊振瓊,許國權,周世力,文學明,余超波,劉亦仁. 湖北農業(yè)科學. 2010(12)
[5]我國特有的小鯢科動物——商城肥鯢[J]. 熊建利,孫平,朱文文,劉秀英. 畜牧與飼料科學. 2009(06)
[6]大別山山地次生林鳥類群落集團結構的季節(jié)變化[J]. 劉彬,周立志,汪文革,沈三寶,韓德民. 動物學研究. 2009(03)
[7]鷂落坪自然保護區(qū)商城肥鯢的資源分布及生境選擇[J]. 王松,鮑方印,戚永躍,徐景霞. 氨基酸和生物資源. 2009(01)
[8]鄂東大別山區(qū)生物多樣性及其保護對策[J]. 方元平,蔡三元,項俊,鐘玉林,胡揚,夏小環(huán). 安徽農業(yè)科學. 2007(17)
[9]中國蛙科一新屬——肛刺蛙屬(蛙科:叉舌蛙亞科)[J]. 江建平,陳曉虹,王斌. 安徽師范大學學報(自然科學版). 2006(05)
[10]中國大鯢四種群的遺傳結構和地理分化[J]. 陶峰勇,王小明,鄭合勛,方盛國. 動物學研究. 2005(02)
本文編號:3463953
【文章來源】:安徽大學安徽省 211工程院校
【文章頁數】:62 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1 譜系地理學
1.1 譜系地理學定義
1.2 譜系地理學研究內容與進展
1.3 譜系地理學研究進展
2 保護遺傳學
2.1 保護遺傳學的概念和研究內容
2.2 保護遺傳學的產生發(fā)展
2.3 保護遺傳學研究領域
2.3.1 物種保護相關單元確定
2.3.2 遺傳多樣性
2.3.3 近交、遠交衰退
3 分子標記的選用
4 大別山區(qū)簡介
4.1 大別山區(qū)地理環(huán)境
4.2 關于大別山物種的研究背景
5 第四紀冰期綜述
6 商城肥鯢概況
6.1 分類歷史簡介
6.2 形態(tài)特征、生活習性與分布
6.3 資源現狀
第二章 基于控制區(qū)對商城肥鯢的遺傳多樣性及譜系地理學研究
1 材料和方法
1.1 實驗試劑與儀器
1.2 樣品采集與保存
1.3 溶液及凝膠配制
1.4 總DNA提取
1.5 引物設計
1.6 目標片段擴增、測序
1.7 數據整理和分析
1.7.1 序列拼接與比對
1.7.2 遺傳多樣性分析
1.7.3 遺傳結構與譜系地理學分析
1.7.4 種群動態(tài)分析
2 結果
2.1 樣品采集情況
2.2 線粒體基因擴增與測序結果
2.3 數據的整理和分析結果
2.3.1 遺傳多樣性分析
2.3.2 遺傳結構分析
2.3.3 譜系地理學分析
2.3.4 種群動態(tài)分析
3 討論
3.1 商城肥鯢的遺傳多樣性
3.2 商城肥鯢的譜系地理學研究
3.3 商城肥鯢種群動態(tài)分析
3.4 商城肥鯢的保護遺傳學分析
3.5 關于大別山區(qū)物種特異性分析
第三章 總結
參考文獻
致謝
攻讀學位期間已發(fā)表的論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大別山地區(qū)兩棲爬行動物區(qū)系調查[J]. 潘濤,周文良,史文博,趙凱,陳錦云,汪文革,儲俊,蒲發(fā)光,顧長明,張保衛(wèi). 動物學雜志. 2014(02)
[2]金寨天馬國家級自然保護區(qū)鳥類多樣性監(jiān)測[J]. 蒲發(fā)光. 農技服務. 2013(07)
[3]安徽岳西大別山區(qū)爬行動物新記錄——平胸龜(Platysternon megacephalum)[J]. 潘濤,汪文革,汪龍春,陳智勇,張保衛(wèi). 安徽大學學報(自然科學版). 2013(04)
[4]湖北地區(qū)兩棲動物分布與地理區(qū)劃研究[J]. 段海生,楊振瓊,許國權,周世力,文學明,余超波,劉亦仁. 湖北農業(yè)科學. 2010(12)
[5]我國特有的小鯢科動物——商城肥鯢[J]. 熊建利,孫平,朱文文,劉秀英. 畜牧與飼料科學. 2009(06)
[6]大別山山地次生林鳥類群落集團結構的季節(jié)變化[J]. 劉彬,周立志,汪文革,沈三寶,韓德民. 動物學研究. 2009(03)
[7]鷂落坪自然保護區(qū)商城肥鯢的資源分布及生境選擇[J]. 王松,鮑方印,戚永躍,徐景霞. 氨基酸和生物資源. 2009(01)
[8]鄂東大別山區(qū)生物多樣性及其保護對策[J]. 方元平,蔡三元,項俊,鐘玉林,胡揚,夏小環(huán). 安徽農業(yè)科學. 2007(17)
[9]中國蛙科一新屬——肛刺蛙屬(蛙科:叉舌蛙亞科)[J]. 江建平,陳曉虹,王斌. 安徽師范大學學報(自然科學版). 2006(05)
[10]中國大鯢四種群的遺傳結構和地理分化[J]. 陶峰勇,王小明,鄭合勛,方盛國. 動物學研究. 2005(02)
本文編號:3463953
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