商城肥鯢為我國(guó)特有的有尾兩棲動(dòng)物,也是大別山區(qū)的特有種,其分布區(qū)極其狹窄。本研究利用Genebank中的商城肥鯢和新疆北鯢的線粒體基因全序列成功設(shè)計(jì)出擴(kuò)增線粒體基因組控制區(qū)（mtDNA D-loop）的引物,并擴(kuò)增了來(lái)自大別山區(qū)的白馬尖-鷂落坪-明堂山（BYM）、天堂寨-馬鬃嶺（TM）、王寨-黃柏山-九峰尖（KHJ）、金剛臺(tái)周邊地區(qū)（JGT）四個(gè)地理種群175個(gè)商城肥鯢樣品的D-loop序列,分析了它的遺傳多樣性、譜系地理學(xué)模式和保護(hù)遺傳學(xué)等方面,得出如下的一些主要成果：（1）商城肥鯢的遺傳多樣性較低在TM種群中,有10個(gè)單倍型,其單倍型多樣性為0.7853士0.0587,核苷酸多樣性為0.0050士0.0034,都顯示較高的遺傳多樣性；而與它相比,在KHJ種群中,僅有2個(gè)單倍型,其單倍型多樣性為0.1079士0.0680,核苷酸多樣性為0.0001士0.0003,都顯示出很低的遺傳多樣性。綜合來(lái)看,四個(gè)種群的遺傳多樣性中,TM種群的最高,而KHJ種群的最低,其他兩個(gè)種群居中。另外,總體上與其他瀕危動(dòng)物,如大鯢（Andrias davidianus）等相比,商城肥鯢的遺傳多樣性水平相對(duì)... 

【文章來(lái)源】：安徽大學(xué)安徽省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1 譜系地理學(xué)
        1.1 譜系地理學(xué)定義
        1.2 譜系地理學(xué)研究?jī)?nèi)容與進(jìn)展
        1.3 譜系地理學(xué)研究進(jìn)展
    2 保護(hù)遺傳學(xué)
        2.1 保護(hù)遺傳學(xué)的概念和研究?jī)?nèi)容
        2.2 保護(hù)遺傳學(xué)的產(chǎn)生發(fā)展
        2.3 保護(hù)遺傳學(xué)研究領(lǐng)域
            2.3.1 物種保護(hù)相關(guān)單元確定
            2.3.2 遺傳多樣性
            2.3.3 近交、遠(yuǎn)交衰退
    3 分子標(biāo)記的選用
    4 大別山區(qū)簡(jiǎn)介
        4.1 大別山區(qū)地理環(huán)境
        4.2 關(guān)于大別山物種的研究背景
    5 第四紀(jì)冰期綜述
    6 商城肥鯢概況
        6.1 分類歷史簡(jiǎn)介
        6.2 形態(tài)特征、生活習(xí)性與分布
        6.3 資源現(xiàn)狀
第二章 基于控制區(qū)對(duì)商城肥鯢的遺傳多樣性及譜系地理學(xué)研究
    1 材料和方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
        1.2 樣品采集與保存
        1.3 溶液及凝膠配制
        1.4 總DNA提取
        1.5 引物設(shè)計(jì)
        1.6 目標(biāo)片段擴(kuò)增、測(cè)序
        1.7 數(shù)據(jù)整理和分析
            1.7.1 序列拼接與比對(duì)
            1.7.2 遺傳多樣性分析
            1.7.3 遺傳結(jié)構(gòu)與譜系地理學(xué)分析
            1.7.4 種群動(dòng)態(tài)分析
    2 結(jié)果
        2.1 樣品采集情況
        2.2 線粒體基因擴(kuò)增與測(cè)序結(jié)果
        2.3 數(shù)據(jù)的整理和分析結(jié)果
            2.3.1 遺傳多樣性分析
            2.3.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
            2.3.3 譜系地理學(xué)分析
            2.3.4 種群動(dòng)態(tài)分析
    3 討論
        3.1 商城肥鯢的遺傳多樣性
        3.2 商城肥鯢的譜系地理學(xué)研究
        3.3 商城肥鯢種群動(dòng)態(tài)分析
        3.4 商城肥鯢的保護(hù)遺傳學(xué)分析
        3.5 關(guān)于大別山區(qū)物種特異性分析
第三章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間已發(fā)表的論文目錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]金寨天馬國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)鳥類多樣性監(jiān)測(cè)[J]. 蒲發(fā)光.  農(nóng)技服務(wù). 2013(07)
[3]安徽岳西大別山區(qū)爬行動(dòng)物新記錄——平胸龜（Platysternon megacephalum）[J]. 潘濤,汪文革,汪龍春,陳智勇,張保衛(wèi).  安徽大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(04)
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[5]我國(guó)特有的小鯢科動(dòng)物——商城肥鯢[J]. 熊建利,孫平,朱文文,劉秀英.  畜牧與飼料科學(xué). 2009(06)
[6]大別山山地次生林鳥類群落集團(tuán)結(jié)構(gòu)的季節(jié)變化[J]. 劉彬,周立志,汪文革,沈三寶,韓德民.  動(dòng)物學(xué)研究. 2009(03)
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[8]鄂東大別山區(qū)生物多樣性及其保護(hù)對(duì)策[J]. 方元平,蔡三元,項(xiàng)俊,鐘玉林,胡揚(yáng),夏小環(huán).  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(17)
[9]中國(guó)蛙科一新屬——肛刺蛙屬（蛙科:叉舌蛙亞科）[J]. 江建平,陳曉虹,王斌.  安徽師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(05)
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