盲蝦Rimicaris exoculata是大西洋中脊熱液口特有物種。2011年南大西洋SMAR01站位大規(guī)模盲蝦種群的發(fā)現(xiàn),表明該種在跨度達(dá)9000多公里的大西洋中脊上形成幾個大種群。因此,其種群間時間和空間的聯(lián)系一直吸引著海洋生態(tài)學(xué)家的關(guān)注。之前盲蝦種群聯(lián)系的研究集中于北大西洋中脊的種群（只涉及到極少數(shù)的赤道以南的盲蝦個體）,而且赤道附近巨大的Romanche轉(zhuǎn)換斷層被認(rèn)為是熱液口底棲生物遷移的阻限。本研究首次結(jié)合mtCOI基因和11個微衛(wèi)星位點,運(yùn)用系統(tǒng)發(fā)育分析、譜系生物地理學(xué)以及遺傳變異參數(shù)的方法對南大西洋中脊盲蝦種群進(jìn)行較大規(guī)模的種群遺傳分析。結(jié)果顯示：（1）共獲得SMAR01種群34個個體的mtCOI基因片段序列和32個個體的微衛(wèi)星位點多態(tài)性數(shù)據(jù),其中共獲得mtCOI單倍型12個,包含1個優(yōu)勢單倍型（Hap₅）；在11個微衛(wèi)星位點共檢測到130個等位基因。（2） SMAR01種群整體表現(xiàn)為高的單倍型多樣性（0.754）和低的核苷酸多樣性（0.0024）,mtCOI單倍型網(wǎng)絡(luò)分布圖顯示為星狀結(jié)構(gòu),優(yōu)勢單倍型位于拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的中心,錯配分布表明其群口歷史符合突... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：138 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
引言
    1.1 熱液口生物群落組成
    1.2 熱液口種群聯(lián)系的研究進(jìn)展
        1.2.1 大西洋中脊
        1.2.2 太平洋東部
        1.2.3 影響種群遷移的因素
    1.3 甲殼動物中microRNA的研究進(jìn)展
    1.4 次級代謝產(chǎn)物在海洋無脊椎動物抗病原侵染中的作用
    1.5 本研究的目的和意義
材料與方法
    2.1 材料
        2.1.1 試驗用樣品
        2.1.2 主要試劑和培養(yǎng)基
        2.1.3 主要分析軟件
        2.1.4 主要儀器設(shè)備
    2.2 方法
結(jié)果與分析
    3.1 大西洋中脊熱液口盲蝦種群遺傳分析
        3.1.1 大西洋中脊熱液口盲蝦樣品采集及數(shù)據(jù)收集
        3.1.2 SMAR01站位基于mtCOI基因片段的遺傳多樣性分析
        3.1.3 SMAR01種群基于微衛(wèi)星計算的遺傳多樣性
        3.1.4 Rimicaris exoculata跨越赤道阻限的遷移
    3.2 盲蝦Rimicaris exoculata microRNA的分析
        3.2.1 RNA提取質(zhì)量檢測
        3.2.2 microRNA測序結(jié)果總覽
        3.2.3 保守的microRNA
        3.2.4 R.exoculata特有的microRNA
        3.2.5 microRNA臂的選擇
        3.2.6 microRNA異構(gòu)體(3’或5’添加,替換等)
    3.3 日本對蝦Marsupenaeus japonicas抗病毒小分子的篩選
        3.3.1 日本對蝦WSSV病毒感染
        3.3.2 次級代謝產(chǎn)物篩選
        3.3.3 次級代謝產(chǎn)物的抗病毒作用
討論
    4.1 大西洋中脊盲蝦的種群遺傳
    4.2 盲蝦保守的microRNA
    4.3 日本對蝦活性物質(zhì)篩選
小結(jié)與展望
    小結(jié)
    展望
參考文獻(xiàn)
附錄 待發(fā)表的文章
個人簡歷
致謝



本文編號：3463809