C型凝集素作為凝集素家族中的主要成員之一,在識(shí)別外來(lái)微生物表面的碳水化合物基團(tuán)和激活體液中免疫因子等方面具有重要作用。本論文中采用分子生物學(xué)、生物信息學(xué)和免疫學(xué)等多種技術(shù),對(duì)菲律賓蛤仔C型凝集素RpCTL進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能的研究,以及LPS注射、低溫因子脅迫對(duì)C型凝集素的影響,探討其在菲律賓蛤仔免疫系統(tǒng)中的作用。利用生物學(xué)分析6個(gè)菲律賓蛤仔C型凝集素基因（CTL-1、CTL-2、CTL-3、CTL-4、CTL-5和CTL-6）,并檢測(cè)其在健康蛤仔的不同組織中表達(dá)分布和低溫脅迫下的蛤仔的肝胰腺中的時(shí)空表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明,6個(gè)C型凝集素基因開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度分別為588bp、408bp、462bp、1017bp、840bp和471bp,且預(yù)測(cè)分子量范圍為15.47-39.28kDa,PI在4.33-6.17之間,推測(cè)出這些序列由4-6個(gè)外顯子、3-6個(gè)內(nèi)含子組成。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)得出這些C型凝集素由3-9個(gè)α螺旋、3-9個(gè)β鏈、3-8個(gè)線圈組成。對(duì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè)后發(fā)現(xiàn),除CTL-2和CTL-3外,在CTL-1、CTL-4、CTL-5和CTL-6中鑒定出了信號(hào)肽。另外,這些凝集素開(kāi)放閱讀... 

【文章來(lái)源】：大連海洋大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

菲律賓蛤仔C型凝集素的結(jié)構(gòu)比較

11：使用 Psipred 預(yù)測(cè) CTL 的二級(jí)結(jié)構(gòu)。粉紅色圓柱表示 α 螺旋; 黃色直箭頭表示 β 鏈; 直線表示線圈。右側(cè)SWISS-MODEL 預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)后 CTL 的三級(jí)結(jié)構(gòu)。2-3 The secondary structures of CTLs were predicted using Psipred. The pink cylinders demoted alpha helixes; the traight arrows indicated beta strands; the straight lines indicate coils. The tertiary structures of CTLs followed aftersecondary structures were predicted by SWISS-MODEL.

.2 C 型凝集素基因的同源序列比對(duì)及進(jìn)化分析雖然 CTL 基因的基因組結(jié)構(gòu)非常不同，如除 CTL-2 和 CTL-3 外，在 CTL-1、CTLL-5 和 CTL-6 中鑒定出了信號(hào)肽，但是他們都被預(yù)測(cè)出僅具有一個(gè)單一的 CRD。而集素家族的幾個(gè)重要特征在CRD內(nèi)與其它物種一致。另外CTL-1和CTL-2與其他構(gòu)一致，都含有 6 個(gè)保守半胱氨酸殘基，其中四個(gè)完全保守的半胱氨酸殘基參與硫化物的形成，兩個(gè) Ca2+依賴的碳水化合物結(jié)合基序 EPN 和 WND 也在結(jié)構(gòu)中發(fā)其他物種相同(圖 2-4）。

【參考文獻(xiàn)】：
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