性別逆轉(zhuǎn)（sex reversal）是一種廣泛存在于昆蟲、兩棲動物、爬行動物和魚類等物種中復(fù)雜的生物學(xué)現(xiàn)象,在性別逆轉(zhuǎn)使生物群體的性別比例發(fā)生改變,增加育種難度。半滑舌鰨是我國黃海區(qū)和渤海區(qū)重要的海水養(yǎng)殖品種之一,因其具有肉質(zhì)鮮嫩可口,養(yǎng)殖周期短,經(jīng)濟(jì)價值高等優(yōu)點(diǎn)受到人們的歡迎。半滑舌鰨為ZW型性染色體類型,兩性差異明顯,雌魚的生長速度大約是雄魚的2～4倍,在其生長發(fā)育到50-120日齡時,部分遺傳雌魚完全逆轉(zhuǎn)成生理雄魚,即偽雄魚,且此逆轉(zhuǎn)過程單向不可逆。導(dǎo)致群體中雌性率降低,增加了苗種成本和管理成本。本研究通過將轉(zhuǎn)錄組和蛋白組相結(jié)合的多組學(xué)分析方法對半滑舌鰨雌魚和偽雄魚性腺組織中基因和蛋白的表達(dá)進(jìn)行詳細(xì)功能分析,目的是揭示與性別逆轉(zhuǎn)相關(guān)的基因及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。主要分析結(jié)果如下:1)轉(zhuǎn)錄組研究:采用Illumina Hi Seq Xten測序方法對雌魚和偽雄魚性腺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。測序結(jié)果共得到46,317個轉(zhuǎn)錄本和25,761個基因,本研究將log2FC≥2和pvalue<0.05作為篩選差異表達(dá)基因的條件,共篩選出差異表達(dá)基因1893個。在1893個差異表達(dá)基因中透明帶上的精子結(jié)合... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

半滑舌鰨遺傳性別鑒定Fig.3-1Geneticsexidentificationofhalf-smoothtonguesole

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文23第三章結(jié)果3.1性別鑒定結(jié)果3.1.1遺傳性別鑒定結(jié)果使用半滑舌鰨特異微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行遺傳性別鑒定，2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測并根據(jù)條帶情況判定遺傳性別。出現(xiàn)169bp和134bp兩條帶的為遺傳雌魚，只出現(xiàn)一條169bp條帶的，其遺傳性別為雄魚（見圖3-1）。遺傳雌魚48尾，雄魚47尾。圖3-1半滑舌鰨遺傳性別鑒定Fig.3-1Geneticsexidentificationofhalf-smoothtonguesole3.1.2生理性別鑒定結(jié)果及組織切片驗(yàn)證根據(jù)Jiang和Li[6]及Cui等[10]的方法測序驗(yàn)證Cyn_Z_6676874和Cyn_Z_8564889兩個位點(diǎn)的基因型。個體性腺切片圖：圖3-2半滑舌鰨性腺組織切片圖注：a:雌魚性腺切片；b:偽雄魚性腺切片圖Fig.3-2Geneticsexidentificationofhalf-smoothtonguesole

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文25圖3-3RNA-Seq數(shù)據(jù)富集分析FPKM作為基因的表達(dá)量進(jìn)行富集分析，fm:雌魚，pm:偽雄魚Fig.3-3ClusteranalysisofRNA-Seqdatasets.FPKMwastakenastheexpressionlevelofgenes.fm:female,pm:pseudomale.3.2.3生物信息分析結(jié)果GO富集分析表明雌魚和偽雄魚差異表達(dá)基因顯著富集到49個GOterm（p<0.05）。其中，雌魚高表達(dá)的785個基因富集到32個GOterm上（圖3-4a），偽雄魚高表達(dá)的1108個基因富集到17個GOterm上（圖3-5a）。雌魚中高表達(dá)基因富集到的32個GOterm中，DNA復(fù)制起始富集顯著性最高。另外，在基因參與的生物學(xué)過程中還富集到wnt信號傳導(dǎo)途徑，細(xì)胞發(fā)育和卵母細(xì)胞成熟3個term中。細(xì)胞組分類別中細(xì)胞外空間富集到的差異基因數(shù)目最多。在分子功能類別中，轉(zhuǎn)化生長因子β受體結(jié)合富集最顯著，此外，富集顯著性最高的3個term是生長因子活性，甲基轉(zhuǎn)移酶活性和細(xì)胞因子活性。偽雄魚中高表達(dá)基因富集到的17個GOterm中，自噬富集最顯著，而細(xì)胞質(zhì)組分富集的差異基因最多。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3455206