新疆額爾齊斯河貝加爾雅羅魚(yú)線粒體基因組分析和遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-08 22:25
貝加爾雅羅魚(yú)(Leuciscus baicalensis)屬于硬骨魚(yú)綱(Osteichthyes)幅鰭亞綱(Subclass Neopterygii)骨鰾總目鯉形目(Cypriniformes)鯉科(Cyprinidae)雅羅魚(yú)亞科雅羅魚(yú)屬(Leuciscus)。本文以貝加爾雅羅魚(yú)為研究對(duì)象,研究了其線粒體基因組,此外,運(yùn)用DNA條形碼技術(shù)對(duì)不同地點(diǎn)的貝加爾雅羅魚(yú)線粒體DNA的D-Loop進(jìn)行了遺傳分析,分析了它們的多樣性。主要結(jié)果如下:1.線粒體全基因組研究貝加爾雅羅魚(yú)線粒體基因組全長(zhǎng)16606bp,主要包括37個(gè)基因(13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,2個(gè)rRNA基因,22個(gè)tRNA基因)和1個(gè)非編碼控制區(qū)。幾乎所有的蛋白質(zhì)編碼都是以ATG開(kāi)頭,除了COX1是以GTG起始的。而終止密碼子比較多變,有TAA、TA、T和TAG。全序列的測(cè)定為貝加爾雅羅魚(yú)的分類鑒定和遺傳學(xué)研究提供了理論基礎(chǔ)。此外,本文利用貝加爾雅羅魚(yú)和其他共歐美地區(qū)、拉丁美洲地區(qū)、東亞地區(qū)的20種雅羅魚(yú)亞科物種的11個(gè)蛋白質(zhì)編碼序列,構(gòu)建了20種雅羅魚(yú)亞科物種的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。2.額爾齊斯河貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性研究運(yùn)用線粒體控制區(qū)序...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1. 額爾齊斯河的自然概況
1.1 地理位置
1.2 水系特征
1.3 額爾齊斯河土著魚(yú)類
2. 雅羅魚(yú)概述
2.1 資源量方面研究
2.2 生物學(xué)特性研究進(jìn)展
2.3 遺傳學(xué)方面研究
2.4 系統(tǒng)發(fā)育地位
3. 線粒體基因組的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
3.1 大小
3.2 線粒體遺傳系統(tǒng)
3.3 線粒體結(jié)構(gòu)
3.4 進(jìn)化速率
4. 遺傳多樣性
4.1 遺傳多樣性的內(nèi)涵
4.2 遺傳多樣性的研究方法
5. 選題的目的與意義
第二章 貝加爾雅羅魚(yú)線粒體全基因組序列
1. 材料與方法
1.1 材料
1.2 DNA提取
1.3 總DNA檢測(cè)
1.4 引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增
1.5 序列拼接和提交
1.6 線粒體基因組組成分析
1.7 雅羅魚(yú)亞科魚(yú)類系統(tǒng)學(xué)分析
2 結(jié)果與討論
2.1 PCR結(jié)果
2.2 貝加爾雅羅魚(yú)線粒體基因組全序列
2.3 貝加爾雅羅魚(yú)蛋白質(zhì)編碼基因特點(diǎn)
2.4 貝加爾雅羅魚(yú)tRNA基因特點(diǎn)
2.5 貝加爾雅羅魚(yú)rRNA基因特點(diǎn)
2.6 貝加爾雅羅魚(yú)D-Loop區(qū)特點(diǎn)
2.7 雅羅魚(yú)亞科系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
第三章 額爾齊斯河貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性研究
1. 采樣與方法
1.1 材料
1.2 方法
2. 結(jié)果
2.1 貝加爾雅羅魚(yú)D-Loop序列
2.2 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性分析
2.3 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4 貝加爾雅羅魚(yú)種群歷史動(dòng)態(tài)
2.5 貝加爾雅羅魚(yú)群體遺傳變異分析
3. 討論
3.1 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
3.2 貝加爾雅羅魚(yú)種群歷史動(dòng)態(tài)
3.3 貝加爾雅羅魚(yú)群體多樣性信息在自然保護(hù)中的作用
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]加拿大–西北大西洋地區(qū)掌形藻的種群遺傳結(jié)構(gòu)與動(dòng)態(tài)變化[J]. 李晶晶,張杰,胡自民,段德麟. 生物多樣性. 2013(03)
[2]銅魚(yú)線粒體控制區(qū)的序列變異和遺傳多樣性[J]. 袁娟,張其中,李飛,朱成科,羅芬. 水生生物學(xué)報(bào). 2010(01)
[3]新疆3種雅羅魚(yú)生長(zhǎng)模型的比較研究[J]. 霍堂斌,馬波,唐富江,姜作發(fā),蔡林鋼,阿達(dá)克白克·可爾江,劉立志. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2008(02)
[4]新疆額爾齊斯河漁業(yè)資源保護(hù)與管理的探討[J]. 朱新英,李政,周波,艾山江. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2008(01)
[5]7種重要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類的ISSR擴(kuò)增結(jié)果分析[J]. 吳興兵,許璞,張偉明,戴衛(wèi)平,林建華,許廣平,楊家新. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(03)
[6]長(zhǎng)江口鄰近水域刀鱭的線粒體控制區(qū)序列變異與遺傳多樣性[J]. 楊金權(quán),胡雪蓮,唐文喬,林弘都. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2008(01)
[7]閩江和漓江暗鱖mtDNA控制區(qū)序列差異分析[J]. 趙麗麗,趙金良,曹陽(yáng). 動(dòng)物學(xué)雜志. 2007(01)
[8]鯉科25種魚(yú)類線粒體COⅡ基因序列差異及其系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系[J]. 凌去非,李思發(fā). 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2006(06)
[9]青海湖裸鯉繁殖群體線粒體基因組D-loop區(qū)序列多態(tài)性[J]. 陳大慶,張春霖,魯成,張信. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2006(05)
[10]我國(guó)額爾齊斯河流域魚(yú)類資源衰退的原因與對(duì)策[J]. 李盡梅. 中國(guó)水產(chǎn). 2006(09)
博士論文
[1]海帶線粒體及部分核基因組結(jié)構(gòu)特征研究[D]. 張靜.中國(guó)海洋大學(xué) 2011
[2]長(zhǎng)江流域幾種重要魚(yú)類的分子標(biāo)記篩選開(kāi)發(fā)及群體遺傳分析[D]. 廖小林.中國(guó)科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
本文編號(hào):3425083
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1. 額爾齊斯河的自然概況
1.1 地理位置
1.2 水系特征
1.3 額爾齊斯河土著魚(yú)類
2. 雅羅魚(yú)概述
2.1 資源量方面研究
2.2 生物學(xué)特性研究進(jìn)展
2.3 遺傳學(xué)方面研究
2.4 系統(tǒng)發(fā)育地位
3. 線粒體基因組的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
3.1 大小
3.2 線粒體遺傳系統(tǒng)
3.3 線粒體結(jié)構(gòu)
3.4 進(jìn)化速率
4. 遺傳多樣性
4.1 遺傳多樣性的內(nèi)涵
4.2 遺傳多樣性的研究方法
5. 選題的目的與意義
第二章 貝加爾雅羅魚(yú)線粒體全基因組序列
1. 材料與方法
1.1 材料
1.2 DNA提取
1.3 總DNA檢測(cè)
1.4 引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增
1.5 序列拼接和提交
1.6 線粒體基因組組成分析
1.7 雅羅魚(yú)亞科魚(yú)類系統(tǒng)學(xué)分析
2 結(jié)果與討論
2.1 PCR結(jié)果
2.2 貝加爾雅羅魚(yú)線粒體基因組全序列
2.3 貝加爾雅羅魚(yú)蛋白質(zhì)編碼基因特點(diǎn)
2.4 貝加爾雅羅魚(yú)tRNA基因特點(diǎn)
2.5 貝加爾雅羅魚(yú)rRNA基因特點(diǎn)
2.6 貝加爾雅羅魚(yú)D-Loop區(qū)特點(diǎn)
2.7 雅羅魚(yú)亞科系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
第三章 額爾齊斯河貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性研究
1. 采樣與方法
1.1 材料
1.2 方法
2. 結(jié)果
2.1 貝加爾雅羅魚(yú)D-Loop序列
2.2 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性分析
2.3 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4 貝加爾雅羅魚(yú)種群歷史動(dòng)態(tài)
2.5 貝加爾雅羅魚(yú)群體遺傳變異分析
3. 討論
3.1 貝加爾雅羅魚(yú)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
3.2 貝加爾雅羅魚(yú)種群歷史動(dòng)態(tài)
3.3 貝加爾雅羅魚(yú)群體多樣性信息在自然保護(hù)中的作用
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]加拿大–西北大西洋地區(qū)掌形藻的種群遺傳結(jié)構(gòu)與動(dòng)態(tài)變化[J]. 李晶晶,張杰,胡自民,段德麟. 生物多樣性. 2013(03)
[2]銅魚(yú)線粒體控制區(qū)的序列變異和遺傳多樣性[J]. 袁娟,張其中,李飛,朱成科,羅芬. 水生生物學(xué)報(bào). 2010(01)
[3]新疆3種雅羅魚(yú)生長(zhǎng)模型的比較研究[J]. 霍堂斌,馬波,唐富江,姜作發(fā),蔡林鋼,阿達(dá)克白克·可爾江,劉立志. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2008(02)
[4]新疆額爾齊斯河漁業(yè)資源保護(hù)與管理的探討[J]. 朱新英,李政,周波,艾山江. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2008(01)
[5]7種重要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類的ISSR擴(kuò)增結(jié)果分析[J]. 吳興兵,許璞,張偉明,戴衛(wèi)平,林建華,許廣平,楊家新. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(03)
[6]長(zhǎng)江口鄰近水域刀鱭的線粒體控制區(qū)序列變異與遺傳多樣性[J]. 楊金權(quán),胡雪蓮,唐文喬,林弘都. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2008(01)
[7]閩江和漓江暗鱖mtDNA控制區(qū)序列差異分析[J]. 趙麗麗,趙金良,曹陽(yáng). 動(dòng)物學(xué)雜志. 2007(01)
[8]鯉科25種魚(yú)類線粒體COⅡ基因序列差異及其系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系[J]. 凌去非,李思發(fā). 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2006(06)
[9]青海湖裸鯉繁殖群體線粒體基因組D-loop區(qū)序列多態(tài)性[J]. 陳大慶,張春霖,魯成,張信. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2006(05)
[10]我國(guó)額爾齊斯河流域魚(yú)類資源衰退的原因與對(duì)策[J]. 李盡梅. 中國(guó)水產(chǎn). 2006(09)
博士論文
[1]海帶線粒體及部分核基因組結(jié)構(gòu)特征研究[D]. 張靜.中國(guó)海洋大學(xué) 2011
[2]長(zhǎng)江流域幾種重要魚(yú)類的分子標(biāo)記篩選開(kāi)發(fā)及群體遺傳分析[D]. 廖小林.中國(guó)科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
本文編號(hào):3425083
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