縊蟶（Sinonovacula constricta）是國(guó)內(nèi)重要的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖貝類。但是隨著養(yǎng)殖面積的擴(kuò)大和養(yǎng)殖密度的增加,養(yǎng)殖環(huán)境不斷惡化,縊蟶養(yǎng)殖過程中死亡現(xiàn)象日趨嚴(yán)重。與其它無(wú)脊椎動(dòng)物一樣,貝類缺乏免疫球蛋白,僅依靠先天免疫機(jī)制識(shí)別微生物病原體,其中包括細(xì)胞和體液免疫。生產(chǎn)中遇到的問題促使研究人員對(duì)貝類先天免疫的研究。有報(bào)道生物先天免疫通過相關(guān)受體（pattern recognition receptors,PRRs）識(shí)別微生物獨(dú)有病原相關(guān)分子模式（pathogen-associated molecular patterns,PAMPs）,來激活免疫應(yīng)答。近年來,有許多報(bào)道稱半乳糖凝集素作為模式識(shí)別受體參與先天免疫,并且逐漸發(fā)現(xiàn)了生物體中的各種作用。在這項(xiàng)研究中,克隆了兩個(gè)來自縊蟶中的半乳糖凝集素基因,這些基因參與識(shí)別和清理入侵微生物,在貝類免疫中起關(guān)鍵作用。1.兩個(gè)半乳糖凝集素的cDNA全長(zhǎng)克隆及序列分析從本實(shí)驗(yàn)室之前的縊蟶轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得了2個(gè)半乳糖凝集素基因ScGal-1和ScGal-2的不完整片段,驗(yàn)證其準(zhǔn)確性后通過cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)（rapid amplificati... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：76 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Galectin在脊椎動(dòng)物（A）和水生軟體動(dòng)物（B）中的分子構(gòu)型示意圖

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文糖結(jié)合口袋殘基圖中以黃色三角形標(biāo)出。Fig.2-1 Detection of putative conserved domains of Sinonovacula constricta ScGal using the NCBIconserved domain database (CDD). The C-terminus (residues 48-174) is a carbohydrate recognitiondomain (CRD). Residues in the dimerisation interface and sugar binding pocket are indicated bytriangles.通過 NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù) Blast 比對(duì)顯示，ScGal-1 基因與泥蚶（Tegillarca granosa）半乳糖凝集素基因的相似度最高，為 48%；其次是太平洋牡蠣（Crassostreagigas）和牡蠣（Crassostreavirginica）分別是 47%和 46%。多重序列比對(duì)結(jié)果如圖 2-2 所示，其二聚化殘基以及結(jié)構(gòu)域在不同物種間具有較高的保守性。

的 ScGal-1 基因進(jìn)行多重序列比對(duì)。圖中保守氨基酸殘基用深灰色陰影表示，類似氨基酸為淺灰色陰影。 二聚化界面相關(guān)殘基紅色框標(biāo)出，CRD 區(qū)域用黑色框圈出。Fig. 2-2 Multiple sequence alignment ScGal from Sinonovacula constricta and related proteins fromvarious species using sequences obtained from the NCBI database. Conserved amino acid residues areshaded dark grey, and similar amino acids are shaded light grey. Residues involved in the dimerisationinterface are in red boxes, and the CRD is in a black box.通過 SWISS-MODEL 預(yù)測(cè) ScGal-1 的蛋白空間結(jié)構(gòu)，預(yù)測(cè)顯示與人 galectin-4有著 40.15%的相似度�？臻g結(jié)構(gòu)由兩個(gè)反向平行的 β-折疊束構(gòu)成的反相平行夾心結(jié)構(gòu)，其中 β 鏈 F1-F5 形成與分泌相關(guān)的 β-夾心結(jié)構(gòu)的凸側(cè)（圖 2-3A），β 鏈 S1-S6 構(gòu)成夾心結(jié)構(gòu)的凹側(cè)并含有碳水化合物結(jié)合位點(diǎn)（圖 2-3B）。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3415452