安徽省淮河水系短頜鱭群體遺傳多樣性
發(fā)布時間：2021-09-04 02:45
短頜鱭（Coilia brachygnathus）是一種小型經(jīng)濟魚類,同時也是大型肉食性魚類和江豚（Neophocaena phocaenoides）的餌料,在食物鏈中占據(jù)重要地位,受過度捕撈、環(huán)境污染以及棲息地破壞等多種因素的影響,短頜鱭野生資源面臨嚴重威脅。目前有關淮河短頜鱭遺傳資源的數(shù)據(jù)仍然缺乏。本研究采用微衛(wèi)星分子標記對安徽省淮河水系短頜鱭5個群體進行遺傳多樣性分析。結(jié)果顯示,10個微衛(wèi)星位點在所有短頜鱭樣本中均具有高度多態(tài)性,多態(tài)信息含量（PIC）0.852～0.942;5個短頜鱭群體均顯示出較高的遺傳多樣性水平,期望雜合度He為0.879～0.903,多態(tài)信息含量（PIC）0.851～0.881。分子方差分析（AMOVA）顯示,大多數(shù)遺傳變異存在于群體內(nèi)（97.88%）,群體間的遺傳變異僅為2.12%。5個群體遺傳分化水平較低(Fst <0.05),其中,遺傳分化系數(shù)最小的是澮河和潁河群體(Fst=0.004)且二者間遺傳距離最近（Da=0.161）;遺傳分化系數(shù)最大的是鳳臺和王家...
【文章來源】：動物學雜志. 2020,55(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】：8 頁
【部分圖文】：
安徽省淮河水系5個短頜鱭群體的采樣地點
基于Nei’s遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建5個短頜鱭群體的系統(tǒng)發(fā)育樹，5個群體具有共同的祖先型，宿州澮河和阜陽潁河短頜鱭群體最先聚類為一支，然后分別與懷遠群體和阜南王家壩群體聚類，最后與鳳臺淮河峽山口段短頜鱭聚在一起，表明鳳臺短頜鱭群體與其他4個群體間遺傳距離較遠（圖2）。Structure分析，K=3是比較理想的種群亞型類群數(shù)目，即5個短頜鱭群體最可能劃分為3個不同的組群（圖3），圖中不同顏色分別代表不同的組群，其中澮河群體、懷遠群體、潁河群體及王家壩群體遺傳背景整體趨于一致，而與鳳臺群體遺傳差異較大。
根據(jù)微衛(wèi)星位點的等位基因頻率，基于IAM、TPM和SMM3種不同的假設，對5個短頜鱭群體進行檢驗（表5）。在IAM模型假設下，鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度過剩（P<0.01),Wilcoxon檢驗的雙尾檢測結(jié)果顯示除澮河群體外，其他4個群體均表現(xiàn)出極顯著的雜合度過剩（P<0.01）；在TPM模型假設下，懷遠群體和鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)顯著的雜合度過剩（P<0.05），且Wilcoxon檢驗的雙尾檢測均表現(xiàn)出顯著水平（P<0.05）；在SMM模型假設下，鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度缺失（P<0.01），鳳臺群體和澮河群體在Wilcoxon檢驗的雙尾檢測中均表現(xiàn)出顯著水平（P<0.05）。3 討論
【參考文獻】：
期刊論文
[1]安徽省草魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 汪煥,江河,段國慶,周華興,胡玉婷,凌俊,潘庭雙,陳小雷. 安徽農(nóng)業(yè)大學學報. 2020(01)
[2]湖棲鰭蝦虎魚微衛(wèi)星DNA標記的開發(fā)與群體遺傳多樣性分析[J]. 黃承勤,黃英毅,黃欣,王中鐸,郭昱嵩. 動物學雜志. 2020(01)
[3]基于線粒體ND2基因序列的少鱗鱚遺傳多樣性研究[J]. 鄭德育,郭易佳,楊天燕,高天翔,鄭瑤,袁冬皓,斯舒謹. 南方水產(chǎn)科學. 2019(05)
[4]長江刀鱭選育和野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 于愛清,施永海,鄧平平. 水產(chǎn)科技情報. 2019(03)
[5]基于線粒體Cytb基因和D-loop區(qū)序列的洪澤湖湖鱭遺傳多樣性分析[J]. 李大命,張彤晴,唐晟凱,關浩勇,劉燕山,穆歡,黃越峰,潘建林. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2018(20)
[6]淮河源區(qū)群體遺傳多樣性研究[J]. 方冬冬,顧錢洪,周傳江,孟曉林,李學軍,聶國興. 水產(chǎn)科學. 2018(05)
[7]長江中下游湖泊短頜鱭線粒體控制區(qū)遺傳多樣性分析[J]. 王旭歌,何勇鳳,吳興兵,楊德國. 動物學雜志. 2018(01)
[8]基于耳石微化學的長江靖江段長頜鱭與短頜鱭生境履歷重建[J]. 陳婷婷,姜濤,盧明杰,劉洪波,楊健. 湖泊科學. 2016(01)
[9]長江短頜鱭耳石Sr/Ca值變化特征及其江海洄游履歷[J]. 徐鋼春,顧若波,劉洪波,姜濤,杜富寬,聶志娟,楊健,徐跑. 水產(chǎn)學報. 2014(07)
[10]中國5個矮馬品種的瓶頸效應分析[J]. 楊勝林,徐龍鑫,楊海兵,李愛萍. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(01)
博士論文
[1]淮河水系的形成與演變研究[D]. 吳梅.中國地質(zhì)大學(北京) 2013
本文編號：3382398
【文章來源】：動物學雜志. 2020,55(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】：8 頁
【部分圖文】：
安徽省淮河水系5個短頜鱭群體的采樣地點
基于Nei’s遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建5個短頜鱭群體的系統(tǒng)發(fā)育樹，5個群體具有共同的祖先型，宿州澮河和阜陽潁河短頜鱭群體最先聚類為一支，然后分別與懷遠群體和阜南王家壩群體聚類，最后與鳳臺淮河峽山口段短頜鱭聚在一起，表明鳳臺短頜鱭群體與其他4個群體間遺傳距離較遠（圖2）。Structure分析，K=3是比較理想的種群亞型類群數(shù)目，即5個短頜鱭群體最可能劃分為3個不同的組群（圖3），圖中不同顏色分別代表不同的組群，其中澮河群體、懷遠群體、潁河群體及王家壩群體遺傳背景整體趨于一致，而與鳳臺群體遺傳差異較大。
根據(jù)微衛(wèi)星位點的等位基因頻率，基于IAM、TPM和SMM3種不同的假設，對5個短頜鱭群體進行檢驗（表5）。在IAM模型假設下，鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度過剩（P<0.01),Wilcoxon檢驗的雙尾檢測結(jié)果顯示除澮河群體外，其他4個群體均表現(xiàn)出極顯著的雜合度過剩（P<0.01）；在TPM模型假設下，懷遠群體和鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)顯著的雜合度過剩（P<0.05），且Wilcoxon檢驗的雙尾檢測均表現(xiàn)出顯著水平（P<0.05）；在SMM模型假設下，鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度缺失（P<0.01），鳳臺群體和澮河群體在Wilcoxon檢驗的雙尾檢測中均表現(xiàn)出顯著水平（P<0.05）。3 討論
【參考文獻】：
期刊論文
[1]安徽省草魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 汪煥,江河,段國慶,周華興,胡玉婷,凌俊,潘庭雙,陳小雷. 安徽農(nóng)業(yè)大學學報. 2020(01)
[2]湖棲鰭蝦虎魚微衛(wèi)星DNA標記的開發(fā)與群體遺傳多樣性分析[J]. 黃承勤,黃英毅,黃欣,王中鐸,郭昱嵩. 動物學雜志. 2020(01)
[3]基于線粒體ND2基因序列的少鱗鱚遺傳多樣性研究[J]. 鄭德育,郭易佳,楊天燕,高天翔,鄭瑤,袁冬皓,斯舒謹. 南方水產(chǎn)科學. 2019(05)
[4]長江刀鱭選育和野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 于愛清,施永海,鄧平平. 水產(chǎn)科技情報. 2019(03)
[5]基于線粒體Cytb基因和D-loop區(qū)序列的洪澤湖湖鱭遺傳多樣性分析[J]. 李大命,張彤晴,唐晟凱,關浩勇,劉燕山,穆歡,黃越峰,潘建林. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2018(20)
[6]淮河源區(qū)群體遺傳多樣性研究[J]. 方冬冬,顧錢洪,周傳江,孟曉林,李學軍,聶國興. 水產(chǎn)科學. 2018(05)
[7]長江中下游湖泊短頜鱭線粒體控制區(qū)遺傳多樣性分析[J]. 王旭歌,何勇鳳,吳興兵,楊德國. 動物學雜志. 2018(01)
[8]基于耳石微化學的長江靖江段長頜鱭與短頜鱭生境履歷重建[J]. 陳婷婷,姜濤,盧明杰,劉洪波,楊健. 湖泊科學. 2016(01)
[9]長江短頜鱭耳石Sr/Ca值變化特征及其江海洄游履歷[J]. 徐鋼春,顧若波,劉洪波,姜濤,杜富寬,聶志娟,楊健,徐跑. 水產(chǎn)學報. 2014(07)
[10]中國5個矮馬品種的瓶頸效應分析[J]. 楊勝林,徐龍鑫,楊海兵,李愛萍. 中國畜牧獸醫(yī). 2013(01)
博士論文
[1]淮河水系的形成與演變研究[D]. 吳梅.中國地質(zhì)大學(北京) 2013
本文編號：3382398
本文鏈接：http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3382398.html
最近更新
教材專著
