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安徽省淮河水系短頜鱭群體遺傳多樣性

發(fā)布時間:2021-09-04 02:45
  短頜鱭(Coilia brachygnathus)是一種小型經(jīng)濟魚類,同時也是大型肉食性魚類和江豚(Neophocaena phocaenoides)的餌料,在食物鏈中占據(jù)重要地位,受過度捕撈、環(huán)境污染以及棲息地破壞等多種因素的影響,短頜鱭野生資源面臨嚴(yán)重威脅。目前有關(guān)淮河短頜鱭遺傳資源的數(shù)據(jù)仍然缺乏。本研究采用微衛(wèi)星分子標(biāo)記對安徽省淮河水系短頜鱭5個群體進行遺傳多樣性分析。結(jié)果顯示,10個微衛(wèi)星位點在所有短頜鱭樣本中均具有高度多態(tài)性,多態(tài)信息含量(PIC)0.852~0.942;5個短頜鱭群體均顯示出較高的遺傳多樣性水平,期望雜合度He為0.879~0.903,多態(tài)信息含量(PIC)0.851~0.881。分子方差分析(AMOVA)顯示,大多數(shù)遺傳變異存在于群體內(nèi)(97.88%),群體間的遺傳變異僅為2.12%。5個群體遺傳分化水平較低(Fst <0.05),其中,遺傳分化系數(shù)最小的是澮河和潁河群體(Fst=0.004)且二者間遺傳距離最近(Da=0.161);遺傳分化系數(shù)最大的是鳳臺和王家... 

【文章來源】:動物學(xué)雜志. 2020,55(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

安徽省淮河水系短頜鱭群體遺傳多樣性


安徽省淮河水系5個短頜鱭群體的采樣地點

水系圖,群體,淮河,遺傳距離


基于Nei’s遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建5個短頜鱭群體的系統(tǒng)發(fā)育樹,5個群體具有共同的祖先型,宿州澮河和阜陽潁河短頜鱭群體最先聚類為一支,然后分別與懷遠(yuǎn)群體和阜南王家壩群體聚類,最后與鳳臺淮河峽山口段短頜鱭聚在一起,表明鳳臺短頜鱭群體與其他4個群體間遺傳距離較遠(yuǎn)(圖2)。Structure分析,K=3是比較理想的種群亞型類群數(shù)目,即5個短頜鱭群體最可能劃分為3個不同的組群(圖3),圖中不同顏色分別代表不同的組群,其中澮河群體、懷遠(yuǎn)群體、潁河群體及王家壩群體遺傳背景整體趨于一致,而與鳳臺群體遺傳差異較大。

水系圖,群體遺傳結(jié)構(gòu),群體,淮河


根據(jù)微衛(wèi)星位點的等位基因頻率,基于IAM、TPM和SMM3種不同的假設(shè),對5個短頜鱭群體進行檢驗(表5)。在IAM模型假設(shè)下,鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度過剩(P<0.01),Wilcoxon檢驗的雙尾檢測結(jié)果顯示除澮河群體外,其他4個群體均表現(xiàn)出極顯著的雜合度過剩(P<0.01);在TPM模型假設(shè)下,懷遠(yuǎn)群體和鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)顯著的雜合度過剩(P<0.05),且Wilcoxon檢驗的雙尾檢測均表現(xiàn)出顯著水平(P<0.05);在SMM模型假設(shè)下,鳳臺群體在Sign檢驗中呈現(xiàn)極顯著的雜合度缺失(P<0.01),鳳臺群體和澮河群體在Wilcoxon檢驗的雙尾檢測中均表現(xiàn)出顯著水平(P<0.05)。3 討論

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]淮河水系的形成與演變研究[D]. 吳梅.中國地質(zhì)大學(xué)(北京) 2013



本文編號:3382398

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