基于DArT技術(shù)的大黃魚生長相關(guān)分子標(biāo)記篩選
發(fā)布時間:2021-08-29 22:58
大黃魚(Larimichthys crocea,Large yellow croaker)是我國主要的海產(chǎn)經(jīng)濟(jì)魚類。主要產(chǎn)于我國浙江、福建、廣東沿海。近二十年來,由于過度捕撈,野生大黃魚在我國頻臨絕跡。為了保護(hù)大黃魚魚種質(zhì)資源和滿足消費者需求,大黃魚人工養(yǎng)殖活動逐漸展開。因多年未加選育的累代養(yǎng)殖,養(yǎng)殖大黃魚生長緩慢,性早熟、免疫力低下,等,因此急需對養(yǎng)殖大黃魚進(jìn)行遺傳改良。然而,大黃魚經(jīng)濟(jì)性狀,如生長、性別決定、抗病力、和抗逆性等大多數(shù)表現(xiàn)為數(shù)量性狀。傳統(tǒng)選育方法是依據(jù)表型進(jìn)行選擇,周期長、效率低,因此需利用分子標(biāo)記技術(shù)從基因型層面,篩選與經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)分子標(biāo)記,輔助選育,以提高育種效率。其中生長作為重要的經(jīng)濟(jì)性狀之一,可直接降低養(yǎng)殖成本和勞動力投入,有助于經(jīng)濟(jì)效益的提高。本研究構(gòu)建了大黃魚基因組文庫,并采用分離群體分組分析法結(jié)合DArT技術(shù)篩選生長相關(guān)的特異性標(biāo)記。主要研究結(jié)果如下:以“東海1號”為實驗材料,測量了199個個體的體長,最大值為16.30cm、最小值為11.50cm,均值為13.45cm,標(biāo)準(zhǔn)偏差1.3367,峰度為0.192,偏度為-0.210,Shapiro-Will...
【文章來源】:寧波大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大黃魚體長正態(tài)分布頻率直方圖
x816 12.00 x827 16.302.2 大黃魚基因組 DNA 提取CTAB法提取的大黃魚基因組DNA的1%瓊脂糖電泳檢測結(jié)果見圖2.1。結(jié)果顯示基因組DNA大小在10kb以上,無拖尾現(xiàn)象,DNA未降解且無蛋白質(zhì)與RNA殘留。使用紫外分光光度計檢測,所提取的基因組DNA的OD260/OD280約在1.79~2.12之間,由此說明DNA質(zhì)量較高,符合后續(xù)實驗要求。圖2.1 基因組DNA 電泳圖Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DNAM:1kb Marker;1~3:極端大群體 DNA;4~6:極端小群體 DNAM:1Kb Marker; 1 3:extreme big group DNA; 4~ 6:extreme small group DNA2.3 大黃魚基因組 DNA 的酶切大黃魚混合的基因組DNA,7種降低基因組復(fù)雜性方法(PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI)的酶切帶型見圖2.2,各組酶切均未出現(xiàn)條帶酶切效果較完全。其分子量在0.25-10kb之間。圖2.2 基因組酶切圖Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:
2.3 大黃魚基因組 DNA 的酶切大黃魚混合的基因組DNA,7種降低基因組復(fù)雜性方法(PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI)的酶切帶型見圖2.2,各組酶切均未出現(xiàn)條帶酶切效果較完全。其分子量在0.25-10kb之間。圖2.2 基因組酶切圖Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:PstI/BanII;3:PstI/Bsp1286I;4:PstI/BstNI;5:PstI/HaeIII ;6:PstI/RsaI;7:PstI/TaqIM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:PstI/BanII;3:PstI/Bsp1286I;4:PstI/BstNI;5:PstI/HaeIII ;6:PstI/RsaI;7:PstI/TaqI
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大黃魚快長相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選與驗證[J]. 劉賢德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物學(xué)報. 2013(06)
[2]非編碼DNA序列的功能及其鑒定[J]. 秦丹,徐存拴. 遺傳. 2013(11)
[3]大黃魚(Larimichthys crocea)Ⅰ型干擾素基因的特征與表達(dá)分析[J]. 李嬋,姚翠鸞. 海洋與湖沼. 2013(02)
[4]黃姑魚♀與大黃魚♂雜交試驗與AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,劉穎,王志勇. 集美大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(04)
[5]水產(chǎn)動物重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子基礎(chǔ)及其遺傳改良[J]. 桂建芳,朱作言. 科學(xué)通報. 2012(19)
[6]Molecular basis and genetic improvement of economically important traits in aquaculture animals[J]. GUI JianFang* & ZHU ZuoYan State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China. Chinese Science Bulletin. 2012(15)
[7]大黃魚(Larimichthys crocea)IGF-Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. ?姑,鄭孝亮,劉慧慧,張建設(shè),吳常文. 海洋與湖沼. 2012(01)
[8]中國重要海洋動物遺傳多樣性的研究進(jìn)展[J]. 崔朝霞,張峘,宋林生,尤鋒. 生物多樣性. 2011(06)
[9]全基因組關(guān)聯(lián)研究中的交互作用研究現(xiàn)狀[J]. 李放歌,王志鵬,戶國,李輝. 遺傳. 2011(09)
[10]大黃魚性腺線性化cDNA文庫的構(gòu)建及生殖免疫相關(guān)基因的篩選[J]. 陳蕓,周鵬,張子平,王藝?yán)? 生物技術(shù)通報. 2011(07)
博士論文
[1]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及生長相關(guān)性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]基于生物芯片標(biāo)記技術(shù)的五種瀕危冷杉保護(hù)遺傳學(xué)研究[D]. 饒龍兵.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2009
碩士論文
[1]大黃魚三種胃腸肽基因的克隆及表達(dá)特性研究[D]. 崔文濤.浙江海洋學(xué)院 2013
[2]大黃魚Follisatin基因克隆及表達(dá)分析[D]. 劉小飛.寧波大學(xué) 2012
[3]白菜類作物DArT標(biāo)記體系的建立[D]. 馮艷麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[4]大黃魚遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 寧岳.集美大學(xué) 2007
本文編號:3371535
【文章來源】:寧波大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大黃魚體長正態(tài)分布頻率直方圖
x816 12.00 x827 16.302.2 大黃魚基因組 DNA 提取CTAB法提取的大黃魚基因組DNA的1%瓊脂糖電泳檢測結(jié)果見圖2.1。結(jié)果顯示基因組DNA大小在10kb以上,無拖尾現(xiàn)象,DNA未降解且無蛋白質(zhì)與RNA殘留。使用紫外分光光度計檢測,所提取的基因組DNA的OD260/OD280約在1.79~2.12之間,由此說明DNA質(zhì)量較高,符合后續(xù)實驗要求。圖2.1 基因組DNA 電泳圖Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DNAM:1kb Marker;1~3:極端大群體 DNA;4~6:極端小群體 DNAM:1Kb Marker; 1 3:extreme big group DNA; 4~ 6:extreme small group DNA2.3 大黃魚基因組 DNA 的酶切大黃魚混合的基因組DNA,7種降低基因組復(fù)雜性方法(PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI)的酶切帶型見圖2.2,各組酶切均未出現(xiàn)條帶酶切效果較完全。其分子量在0.25-10kb之間。圖2.2 基因組酶切圖Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:
2.3 大黃魚基因組 DNA 的酶切大黃魚混合的基因組DNA,7種降低基因組復(fù)雜性方法(PstI/AluI、PstI/BanII、PstI/Bsp1286I、PstI/BstNI、PstI/HaeIII、PstI/RsaI、PstI/TaqI)的酶切帶型見圖2.2,各組酶切均未出現(xiàn)條帶酶切效果較完全。其分子量在0.25-10kb之間。圖2.2 基因組酶切圖Fig 2.2 Agarose electrophoresis of genomic restrictionM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:PstI/BanII;3:PstI/Bsp1286I;4:PstI/BstNI;5:PstI/HaeIII ;6:PstI/RsaI;7:PstI/TaqIM:1kb Marker;1:PstI/AluI;2:PstI/BanII;3:PstI/Bsp1286I;4:PstI/BstNI;5:PstI/HaeIII ;6:PstI/RsaI;7:PstI/TaqI
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大黃魚快長相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選與驗證[J]. 劉賢德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物學(xué)報. 2013(06)
[2]非編碼DNA序列的功能及其鑒定[J]. 秦丹,徐存拴. 遺傳. 2013(11)
[3]大黃魚(Larimichthys crocea)Ⅰ型干擾素基因的特征與表達(dá)分析[J]. 李嬋,姚翠鸞. 海洋與湖沼. 2013(02)
[4]黃姑魚♀與大黃魚♂雜交試驗與AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,劉穎,王志勇. 集美大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(04)
[5]水產(chǎn)動物重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子基礎(chǔ)及其遺傳改良[J]. 桂建芳,朱作言. 科學(xué)通報. 2012(19)
[6]Molecular basis and genetic improvement of economically important traits in aquaculture animals[J]. GUI JianFang* & ZHU ZuoYan State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China. Chinese Science Bulletin. 2012(15)
[7]大黃魚(Larimichthys crocea)IGF-Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. ?姑,鄭孝亮,劉慧慧,張建設(shè),吳常文. 海洋與湖沼. 2012(01)
[8]中國重要海洋動物遺傳多樣性的研究進(jìn)展[J]. 崔朝霞,張峘,宋林生,尤鋒. 生物多樣性. 2011(06)
[9]全基因組關(guān)聯(lián)研究中的交互作用研究現(xiàn)狀[J]. 李放歌,王志鵬,戶國,李輝. 遺傳. 2011(09)
[10]大黃魚性腺線性化cDNA文庫的構(gòu)建及生殖免疫相關(guān)基因的篩選[J]. 陳蕓,周鵬,張子平,王藝?yán)? 生物技術(shù)通報. 2011(07)
博士論文
[1]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及生長相關(guān)性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]基于生物芯片標(biāo)記技術(shù)的五種瀕危冷杉保護(hù)遺傳學(xué)研究[D]. 饒龍兵.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2009
碩士論文
[1]大黃魚三種胃腸肽基因的克隆及表達(dá)特性研究[D]. 崔文濤.浙江海洋學(xué)院 2013
[2]大黃魚Follisatin基因克隆及表達(dá)分析[D]. 劉小飛.寧波大學(xué) 2012
[3]白菜類作物DArT標(biāo)記體系的建立[D]. 馮艷麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[4]大黃魚遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 寧岳.集美大學(xué) 2007
本文編號:3371535
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