發(fā)布時(shí)間：2021-08-27 23:11

　　為探究�；撬釋t鰭東方鲀的熱應(yīng)激調(diào)控的影響,以初始體重為（32.28±0.20）g的紅鰭東方鲀（Takifugurubripes）作為研究對象,實(shí)驗(yàn)隨機(jī)分為3組,每組設(shè)置3個重復(fù),通過在低魚粉飼料中分別添加3個水平的�；撬醄0%（T1,對照）、1.0%（T2）和5.0%（T3）],配制3組實(shí)驗(yàn)飼料。養(yǎng)殖56 d后,水溫（28±0.3）℃,急性熱應(yīng)激30 min,取肝臟。使用RNA-Seq測序技術(shù)對3組紅鰭東方鲀肝臟轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,并分別對3個轉(zhuǎn)錄組測序文庫進(jìn)行兩兩比較,設(shè)置顯著差異基因篩選條件為P<0.05,共獲得167個差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因111個,下調(diào)基因56個。GO功能分析發(fā)現(xiàn),在T3vs T1組中,差異表達(dá)基因（DEGs）顯著富集在蛋白質(zhì)分解過程、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、絲氨酸型肽酶活性、絲氨酸水解酶活性、內(nèi)肽酶活性、L-氨基酸肽的肽酶活性和肽酶活性。KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),T2vs T1組中,這些DEGs主要參與細(xì)胞黏附分子、神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路;而T3vs T1組中,這些DEGs主要參與神經(jīng)活性配體受體相互作用和代謝途徑。選取3個顯著差異表達(dá)基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光... 

【文章來源】：中國水產(chǎn)科學(xué). 2020,27(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

RT-q PCR與RNA-seq檢測基因差異倍數(shù)比較圖

如圖1所示,在急性熱應(yīng)激后,T2 vs T1組共得到13個差異表達(dá)基因,其中包括11個上調(diào)表達(dá)基因,2個下調(diào)表達(dá)基因;T3 vs T1組共得到154個差異表達(dá)基因,其中包括100個上調(diào)表達(dá)基因,54個下調(diào)表達(dá)基因。對所有基因進(jìn)行FPKM層次聚類分析,得到結(jié)果如圖2所示。以log2(ratios)值進(jìn)行聚類,圖中紅色代表基因高表達(dá),藍(lán)色代表基因低表達(dá),從紅到藍(lán)表明log2(ratios)值從大到小,即基因表達(dá)量從高到低。圖2 差異表達(dá)基因聚類圖

差異表達(dá)基因聚類圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[2]饑餓提高斑馬魚（Danio rerio）冷應(yīng)激耐受的機(jī)制探究[D]. 魯棟梁.華東師范大學(xué) 2019
[3]基于RNA-seq的熱應(yīng)激條件下虹鱒肝臟和頭腎轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 李永娟.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]暗紋東方鲀耐受鹽度能力的環(huán)境因子效應(yīng)及其在轉(zhuǎn)錄組學(xué)水平上的差異[D]. 王駿.南京師范大學(xué) 2018

碩士論文
[1]大菱鲆熱脅迫相關(guān)功能基因分析及耐高溫性狀QTL區(qū)間內(nèi)共享標(biāo)記篩選[D]. 楊凱.上海海洋大學(xué) 2019
[2]花斑裸鯉低氧脅迫轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其主要差異基因表達(dá)調(diào)控研究[D]. 趙永麗.青海大學(xué) 2018
[3]基于轉(zhuǎn)錄組技術(shù)揭示紅鰭東方鲀的滲透壓調(diào)節(jié)機(jī)制[D]. 孫夢蕾.大連海洋大學(xué) 2017
[4]大黃魚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及密集脅迫前后皮膚轉(zhuǎn)錄組變化[D]. 韓兆方.集美大學(xué) 2016



本文編號：3367283