發(fā)布時(shí)間：2021-08-26 14:35

　　玉筋魚（Ammodytes personatus）是西北太平洋重要的餌料與經(jīng)濟(jì)魚類，在分布范圍內(nèi)存在分化較大的南、北兩個(gè)世系，與同屬的太平洋玉筋魚（Ammodyteshexapterus）在形態(tài)特征上極為相似。赤魟（Dasyatis akajei）為西北太平洋的一種暖溫性底層軟骨魚類，在廣西淡水水系中亦有分布。本研究對兩種玉筋魚的線粒體基因組結(jié)構(gòu)和組成進(jìn)行了分析與比較，并在線粒體基因組水平上探討了玉筋魚南、北世系的分化程度。綜合運(yùn)用線粒體DNA控制區(qū)序列、AFLP和微衛(wèi)星標(biāo)記，系統(tǒng)開展了赤魟的遺傳多樣性、群體遺傳結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)地理格局研究，同時(shí)分析了5種魟屬魚類的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。主要結(jié)果如下：1．玉筋魚和太平洋玉筋魚線粒體基因組特征分析本研究擴(kuò)增得到太平洋玉筋魚和玉筋魚南、北世系線粒體基因組全序列，全長分別為16,527bp,16,537bp和16,527bp，玉筋魚北方世系和太平洋玉筋魚的各序列片段長度一致，與玉筋魚南方世系僅在16S rRNA和控制區(qū)上分別存在2bp、8bp的插入缺失。三者線粒體基因組包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、22個(gè)tRNA基因、2個(gè)rRNA基因和2個(gè)非編碼區(qū)（控制區(qū)和O... 

【文章來源】：中國海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：185 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 魚類線粒體基因組研究概述
        1.1.1 魚類線粒體基因組的結(jié)構(gòu)與組成
        1.1.2 魚類線粒體基因組的遺傳特征
        1.1.3 魚類線粒體基因組的進(jìn)化特點(diǎn)
        1.1.4 魚類線粒體基因組的應(yīng)用
    1.2 分子系統(tǒng)地理學(xué)在海洋魚類中的研究進(jìn)展
        1.2.1 分子系統(tǒng)地理學(xué)簡介
        1.2.2 分子系統(tǒng)地理學(xué)常用的分子標(biāo)記
        1.2.3 海洋魚類系統(tǒng)地理格局的影響因素
        1.2.4 海洋魚類分子系統(tǒng)地理學(xué)的應(yīng)用
第二章 玉筋魚和太平洋玉筋魚線粒體基因組特征分析
    2.1 前言
    2.2 材料與方法
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 結(jié)構(gòu)與組成
        2.3.2 堿基組成
        2.3.3 蛋白質(zhì)編碼基因
        2.3.4 非同義替代和同義替代
        2.3.5 rRNA 基因和 tRNA 基因
        2.3.6 非編碼區(qū)
    2.4 討論
        2.4.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)
        2.4.2 線粒體基因組堿基組成
        2.4.3 線粒體基因組蛋白質(zhì)編碼基因分析
        2.4.4 線粒體基因組其他片段分析
第三章 基于線粒體基因組全序列的玉筋魚南、北世系遺傳分化
    3.1 前言
    3.2 材料與方法
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 序列多態(tài)分析
        3.3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.3.3 分化時(shí)間估算
    3.4 討論
第四章 赤魟的分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
    4.1 赤魟的研究概況
        4.1.1 赤魟形態(tài)學(xué)特征與生態(tài)習(xí)性
        4.1.2 赤魟的研究進(jìn)展
    4.2 基于線粒體 DNA 控制區(qū)的赤魟分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
        4.2.1 前言
        4.2.2 材料與方法
        4.2.3 結(jié)果與分析
        4.2.4 討論
    4.3 基于 AFLP 標(biāo)記的赤魟分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
        4.3.1 前言
        4.3.2 材料與方法
        4.3.3 結(jié)果與分析
        4.3.4 討論
    4.4 赤魟微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)和分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
        4.4.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記開發(fā)方法及研究進(jìn)展
        4.4.2 赤魟微衛(wèi)星分子標(biāo)記開發(fā)
        4.4.3 赤魟種群的微衛(wèi)星分析
        4.4.4 結(jié)果與分析
        4.4.5 討論
第五章 魟屬魚類系統(tǒng)發(fā)育研究
    5.1 魟屬魚類線粒體 DNA 控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析
        5.1.1 前言
        5.1.2 材料與方法
        5.1.3 結(jié)果與分析
        5.1.4 討論
    5.2 基于線粒體 DNA 序列片段的魟屬魚類系統(tǒng)發(fā)育分析
        5.2.1 前言
        5.2.2 材料與方法
        5.2.3 結(jié)果與分析
        5.2.4 討論
第六章 總結(jié)
    1 玉筋魚和太平洋玉筋魚的線粒體基因組結(jié)構(gòu)
    2 玉筋魚南、北世系線粒體基因組的遺傳分化
    3 赤魟的種群遺傳結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)地理格局
    4 5種魟屬魚類的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
    5 線粒體 DNA、微衛(wèi)星與 AFLP 三種標(biāo)記的比較
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡歷
在學(xué)期間的學(xué)術(shù)成果


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[6]半滑舌鰨微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)、應(yīng)用及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 苗貴東.中國海洋大學(xué) 2010
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碩士論文
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[2]鯪微衛(wèi)星分子標(biāo)記的篩選及遺傳多樣性分析[D]. 劉佳瑤.上海海洋大學(xué) 2012
[3]中、日斑鰶耳石形態(tài)及線粒體基因組研究[D]. 潘曉哲.中國海洋大學(xué) 2012
[4]大瀧六線魚（Hexagrammos otakii）生物學(xué)特征與遺傳多樣性研究[D]. 劉奇.中國海洋大學(xué) 2010
[5]中、日白姑魚的形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)研究[D]. 李昂.中國海洋大學(xué) 2010
[6]斜帶石斑魚和赤點(diǎn)石斑魚線粒體基因組全序列研究[D]. 莊軒.廈門大學(xué) 2007



本文編號：3364423