副地衣芽孢桿菌（Bacillus paralicheniformis）FA6是一株從草魚腸道內(nèi)分離出來的細(xì)菌,其具有淀粉酶和纖維素酶等多種碳水化合物酶活性。為深入研究副地衣芽孢桿菌FA6可能的益生機(jī)制,研究通過三代測序技術(shù)測定了副地衣芽孢桿菌FA6的全基因組序列,運(yùn)用生物信息學(xué)方法進(jìn)行基因組組裝、基因預(yù)測和功能注釋。同時(shí)通過比較基因組學(xué)方法,比較分析了副地衣芽孢桿菌FA6與4株基因組序列已經(jīng)發(fā)表的芽孢桿菌基因組結(jié)構(gòu)和功能的差異。結(jié)果發(fā)現(xiàn)副地衣芽孢桿菌FA6全基因組由1條環(huán)狀染色體組成,大小為4450579 bp,GC含量為45.9%。副地衣芽孢桿菌FA6基因組中含有128個(gè)蛋白酶基因, 32個(gè)脂肪酶基因和72個(gè)糖苷水解酶基因,這些基因與食物降解相關(guān);此外,細(xì)菌基因組中還含有7個(gè)編碼羊毛硫抗生素相關(guān)的基因。比較基因組結(jié)果顯示,副地衣芽孢桿菌FA6與其他4株芽孢桿菌的基因組共線性關(guān)系較好,但是與地衣芽孢桿菌菌株相比,菌株FA6基因組特征更接近于副地衣芽孢桿菌菌株。副地衣芽孢桿菌FA6基因組中編碼纖維素酶、半纖維素酶和淀粉酶的基因數(shù)量分別為5、7和5個(gè),多于其他菌株,能夠更好地降解植物多糖。... 

【文章來源】：水生生物學(xué)報(bào). 2020,44(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]草魚腸道黏膜厭氧細(xì)菌的分離與鑒定[J]. 豐文雯,吳山功,郝耀彤,李文祥,李明,鄒紅,王桂堂.  水生生物學(xué)報(bào). 2018(01)



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