翹嘴鱖（Siniperca chuatsi）是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)魚類,主要分布于中國(guó)、越南、韓國(guó)等東亞國(guó)家,長(zhǎng)久以來,一直被作為這些地區(qū)的名貴食用魚類。翹嘴鱖在我國(guó)已有二十多年的規(guī)模養(yǎng)殖歷史,近年來隨著養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大,其種質(zhì)退化比較嚴(yán)重,表現(xiàn)為生長(zhǎng)速度減慢、抗病力低、性早熟等生物學(xué)特點(diǎn),尤其該魚傳染性脾腎壞死�。↖SKNV,infectious spleen and kidney necrosis virus）的流行,加大了鱖魚養(yǎng)殖業(yè)的養(yǎng)殖風(fēng)險(xiǎn),給養(yǎng)殖業(yè)帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。本實(shí)驗(yàn)通過SLAF-seq（Specific-Locus Amplied Fragments Sequencing）技術(shù)批量開發(fā) SLAF標(biāo)記,并以此為基礎(chǔ)構(gòu)建了翹嘴鱖高密度遺傳連鎖圖;進(jìn)行了生長(zhǎng)、抗ISKNV和性別決定等經(jīng)濟(jì)性狀的QTL（quantitative trait locus）定位;開展了對(duì)相關(guān)性狀SNP（Single nucleotide polymorphism）分子標(biāo)記的篩選、鑒定以及將遺傳圖譜QTL區(qū)間與全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組DEG文庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果將為翹嘴鱖的分子選育工作提供一定的理論指導(dǎo)。1.... 

【文章來源】：蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：88 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１翹嘴鱖作圖母本測(cè)序質(zhì)量值分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ．??

翅嘴簫髙密度遺傳圖譜的構(gòu)建、經(jīng)濟(jì)性狀ＱＴＬ定位及其相關(guān)分子標(biāo)記的挖掘?試驗(yàn)一??標(biāo)，不同的堿基類型用不同顏色指代，測(cè)序過程中識(shí)別不出的堿基Ｎ以灰色表??示）。??Ｑｕａｌｉｔｙ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?Ｒｅａｄｓ??４〇?－?丨??〇?ＩＩ?－??３０??ｏ??〇??ｆ２〇??１０??０?＾（１（???０?５０?１００?１５０?２００??Ｒｅａｄｓ?Ｐｏｓｉｔｉｏｎ，ｂｐ??圖１－１翹嘴鱖作圖母本測(cè)序質(zhì)量值分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ．??Ｂａｓｅ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?Ｒｅａｄｓ??１００??１—???Ａ???４５?ｒ?Ｎ??Ｔ……??Ｉ３。＿??１５?Ｌ?ｌ?…?１??０??０?５０?１００?１５０?２００??Ｒｅａｄｓ?Ｐｏｓｉｔｉｏｎ，ｂｐ??圖１－２翹嘴鱖作圖母本堿基含量分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－２?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｃｏｄｏｎ?ｃｏｎｔｅｎｔ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ??２１??

翹嘴嫌髙密度遺傳圖譜的構(gòu)建、經(jīng)濟(jì)性狀ＱＴＬ定位及其相關(guān)分子標(biāo)記的挖掘?試驗(yàn)一??個(gè)Ｍａｒｋｅｒ的平均測(cè)序深度為１７３．４６Ｘ，而在母本中其Ｍａｒｋｅｒ的平均測(cè)序深度為??２０５．３Ｘ；?２，２６６個(gè)Ｍａｒｋｅｒ在子代中的測(cè)序深度為３４．９４Ｘ。２，３４４個(gè)Ｍａｒｋｅｒ兩兩??計(jì)算ＭＬＯＤ值并經(jīng)過ＨｉｇｈＭａｐ［１（）７］軟件計(jì)算遺傳距離，被分為２４個(gè)連鎖群??（ＬＧ）且依次排列（圖１－４），其中，最大的ＬＧ是ＬＧ２２，其包含１８４個(gè)標(biāo)記，??圖距長(zhǎng)２２６．２３ｃＭ；最小的ＬＧ是ＬＧ１４，僅包含４０個(gè)標(biāo)記，圖距長(zhǎng)３９．１２ｃＭ。??２４個(gè)ＬＧ中相鄰標(biāo)記間的距離￡５?ｃＭ的比例為７４．０７％－９７．７４％（平均８９．６８％），在??ＬＧ１中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)最大的標(biāo)記間隙為１９．６７ｃＭ。連鎖圖譜中共上圖的ＳＮＰ標(biāo)記??２，９７７個(gè)，不同０３中８燦標(biāo)記的數(shù)量從３９個(gè)（１＾｝１８）到３５２個(gè)（１＾９）不等（表１－３）。??除中性圖圖譜以外，還分別構(gòu)建了雄性圖圖譜以及雌性圖圖譜。雄性圖圖譜包含??１５００個(gè)ＳＬＡＦｓ，總圖距為３１９６．４９ｃＭ，每個(gè)ＬＧ的圖距范圍為３０．９２?ｃＭ??（ＬＧ２０）－４６５．０８?ｃＭ（ＬＧ２２），平均圖距為１３３．１８?ｃＭ。每個(gè)ＬＧ中的標(biāo)記間間隙公ｃＭ??的比例為３３．３３％－９８．３７％。對(duì)應(yīng)的雌性圖圖譜包含１２６９個(gè)ＳＬＡＦｓ，總圖距為??２９０９．５５?ｃＭ，每個(gè)ＬＧ的圖距范圍為０?ｃＭ（ＬＧ６）－２６４．８１?ｃＭ（ＬＧ１０），平均圖距為??１２１．２３ｃＭ。每個(gè)連鎖群的標(biāo)記間間隙公ｃＭ的比例為０％－９８．７％。雌雄性圖譜與??中性圖圖譜的Ｃｉｒｃｏｓ圖見圖１－５，其中圖１－５?（Ａ）和圖１－５

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3355523