翹嘴鱖（Siniperca chuatsi）是我國重要的淡水經濟魚類,主要分布于中國、越南、韓國等東亞國家,長久以來,一直被作為這些地區(qū)的名貴食用魚類。翹嘴鱖在我國已有二十多年的規(guī)模養(yǎng)殖歷史,近年來隨著養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大,其種質退化比較嚴重,表現(xiàn)為生長速度減慢、抗病力低、性早熟等生物學特點,尤其該魚傳染性脾腎壞死�。↖SKNV,infectious spleen and kidney necrosis virus）的流行,加大了鱖魚養(yǎng)殖業(yè)的養(yǎng)殖風險,給養(yǎng)殖業(yè)帶來了巨大的經濟損失。本實驗通過SLAF-seq（Specific-Locus Amplied Fragments Sequencing）技術批量開發(fā) SLAF標記,并以此為基礎構建了翹嘴鱖高密度遺傳連鎖圖;進行了生長、抗ISKNV和性別決定等經濟性狀的QTL（quantitative trait locus）定位;開展了對相關性狀SNP（Single nucleotide polymorphism）分子標記的篩選、鑒定以及將遺傳圖譜QTL區(qū)間與全長轉錄組DEG文庫進行比對。本實驗結果將為翹嘴鱖的分子選育工作提供一定的理論指導。1.... 

【文章來源】：蘇州大學江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：88 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１翹嘴鱖作圖母本測序質量值分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ．??

翅嘴簫髙密度遺傳圖譜的構建、經濟性狀ＱＴＬ定位及其相關分子標記的挖掘?試驗一??標，不同的堿基類型用不同顏色指代，測序過程中識別不出的堿基Ｎ以灰色表??示）。??Ｑｕａｌｉｔｙ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?Ｒｅａｄｓ??４〇?－?丨??〇?ＩＩ?－??３０??ｏ??〇??ｆ２〇??１０??０?＾（１（???０?５０?１００?１５０?２００??Ｒｅａｄｓ?Ｐｏｓｉｔｉｏｎ，ｂｐ??圖１－１翹嘴鱖作圖母本測序質量值分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ．??Ｂａｓｅ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?Ｒｅａｄｓ??１００??１—???Ａ???４５?ｒ?Ｎ??Ｔ……??Ｉ３。＿??１５?Ｌ?ｌ?…?１??０??０?５０?１００?１５０?２００??Ｒｅａｄｓ?Ｐｏｓｉｔｉｏｎ，ｂｐ??圖１－２翹嘴鱖作圖母本堿基含量分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－２?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｔｅｒｎａｌ?ｃｏｄｏｎ?ｃｏｎｔｅｎｔ?ｏｆ?Ｓ．?ｃｈｕａｔｓｉ??２１??

翹嘴嫌髙密度遺傳圖譜的構建、經濟性狀ＱＴＬ定位及其相關分子標記的挖掘?試驗一??個Ｍａｒｋｅｒ的平均測序深度為１７３．４６Ｘ，而在母本中其Ｍａｒｋｅｒ的平均測序深度為??２０５．３Ｘ；?２，２６６個Ｍａｒｋｅｒ在子代中的測序深度為３４．９４Ｘ。２，３４４個Ｍａｒｋｅｒ兩兩??計算ＭＬＯＤ值并經過ＨｉｇｈＭａｐ［１（）７］軟件計算遺傳距離，被分為２４個連鎖群??（ＬＧ）且依次排列（圖１－４），其中，最大的ＬＧ是ＬＧ２２，其包含１８４個標記，??圖距長２２６．２３ｃＭ；最小的ＬＧ是ＬＧ１４，僅包含４０個標記，圖距長３９．１２ｃＭ。??２４個ＬＧ中相鄰標記間的距離￡５?ｃＭ的比例為７４．０７％－９７．７４％（平均８９．６８％），在??ＬＧ１中發(fā)現(xiàn)了一個最大的標記間隙為１９．６７ｃＭ。連鎖圖譜中共上圖的ＳＮＰ標記??２，９７７個，不同０３中８燦標記的數(shù)量從３９個（１＾｝１８）到３５２個（１＾９）不等（表１－３）。??除中性圖圖譜以外，還分別構建了雄性圖圖譜以及雌性圖圖譜。雄性圖圖譜包含??１５００個ＳＬＡＦｓ，總圖距為３１９６．４９ｃＭ，每個ＬＧ的圖距范圍為３０．９２?ｃＭ??（ＬＧ２０）－４６５．０８?ｃＭ（ＬＧ２２），平均圖距為１３３．１８?ｃＭ。每個ＬＧ中的標記間間隙公ｃＭ??的比例為３３．３３％－９８．３７％。對應的雌性圖圖譜包含１２６９個ＳＬＡＦｓ，總圖距為??２９０９．５５?ｃＭ，每個ＬＧ的圖距范圍為０?ｃＭ（ＬＧ６）－２６４．８１?ｃＭ（ＬＧ１０），平均圖距為??１２１．２３ｃＭ。每個連鎖群的標記間間隙公ｃＭ的比例為０％－９８．７％。雌雄性圖譜與??中性圖圖譜的Ｃｉｒｃｏｓ圖見圖１－５，其中圖１－５?（Ａ）和圖１－５

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[2]草魚SNP標記開發(fā)及與生長性狀關聯(lián)分析[D]. 張猛.上海海洋大學 2016
[3]基于轉錄組測序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達[D]. 袁文成.蘇州大學 2015
[4]傳染性脾腎壞死病毒（ISKNV）的侵染途徑[D]. 吳燕燕.中山大學 2010
[5]黃顙魚（Pelteobagrus fulvidraco）SRAP遺傳圖譜的構建[D]. 辛文婷.東北林業(yè)大學 2009



本文編號：3355523