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分子標(biāo)記技術(shù)在日本對蝦育種中的應(yīng)用研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-16 16:48
  日本對蝦是我國重要的對蝦養(yǎng)殖種類,開展其良種選育工作具有重要的經(jīng)濟(jì)意義。本文以日本對蝦育種群體為材料,用微衛(wèi)星分子標(biāo)記對不同選育群體進(jìn)行遺傳鑒定,并建立了基于微衛(wèi)星信息的遺傳參數(shù)估計(jì)方法,為進(jìn)一步開展日本對蝦分子輔助選育工作奠定了重要的技術(shù)基礎(chǔ)。對日本對蝦育種群體進(jìn)行耐高溫測試,分析高溫耐受性與生長性狀、近交水平的關(guān)系;利用SLAF測序法篩選與耐高溫性狀關(guān)聯(lián)的SNP標(biāo)記,為改良日本對蝦高溫耐受性提供分子輔助手段。利用8對微衛(wèi)星引物對日本對蝦養(yǎng)殖群體兩個(gè)世代的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,共計(jì)檢測到108個(gè)等位基因,等位基因長度為196-528bp,各位點(diǎn)等位基因數(shù)為6-23個(gè)。親本和子代群體每個(gè)位點(diǎn)平均等位基因數(shù)目分別為8.5個(gè)和11.5個(gè),平均觀測雜合度分別為0.7211和0.6319,平均期望雜合度分別為0.7748和0.7635,平均多態(tài)信息含量分別為0.7315和0.7286。根據(jù)標(biāo)記信息利用最大似然法對兩個(gè)世代的個(gè)體分別進(jìn)行系譜結(jié)構(gòu)推斷,親本群體劃分為6個(gè)群體,群體間遺傳距離為0.2773-2.356,均值為1.5097;子代群體劃分為17個(gè)群體,群體間遺傳距離為0-2.5929,均值... 

【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

分子標(biāo)記技術(shù)在日本對蝦育種中的應(yīng)用研究


圖2-1日本對蝦基因組DNA電泳圖

電泳圖,日本對蝦,分光光度計(jì),基因組DNA


圖2-1 日本對蝦基因組DNA電泳圖Fig. 2-1 Electrophoretogra for Genomes DNA of Masupenaeus japonicas圖2-2 日本對蝦基因組DNA的分光光度計(jì)檢測結(jié)果圖Fig. 2-2 Map Result of Genomes DNA of Masupenaeus japonicas by Spectrophotometry3.2 8 個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增結(jié)果及多態(tài)性本研究通過讀取 8 個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的峰圖(圖 2-3,圖 2-4 和圖 2-5)來實(shí)現(xiàn)基因分型,每個(gè)峰簇代表 1 個(gè)等位基因。日本對蝦是 2 倍體生物,對 1 個(gè)正常個(gè)體來說,在每個(gè)位點(diǎn)有 1 個(gè)(純合子)或 2 個(gè)(雜合子)等位基因。對峰型來說,完美的峰型呈現(xiàn)為單一獨(dú)立的峰,如圖 2-3 中的兩個(gè)位點(diǎn)。但實(shí)踐中往往會(huì)出現(xiàn)簇狀的峰,如圖 2-4 中藍(lán)峰和圖 2-5 中三種顏色的峰

位點(diǎn)


圖 2-3 位點(diǎn) MpSSR012(藍(lán))和 MpSSR031(綠)的峰圖Fig. 2-3 Visualized Peaks on Locus MpSSR012 (blue) and MpSSR031 (green)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑節(jié)對蝦形態(tài)性狀對體質(zhì)量影響的分析[J]. 孫苗苗,陳百堯,楊其彬,江世貴,周發(fā)林,蘇天鳳,黃建華.  海洋科學(xué). 2013(05)
[2]微衛(wèi)星標(biāo)記中的無效等位基因[J]. 文亞峰,Kentaro Uchiyama,韓文軍,Saneyoshi Ueno,謝偉東,徐剛標(biāo),Yoshihiko Tsumura.  生物多樣性. 2013(01)
[3]脊尾白蝦形態(tài)性狀對體重的相關(guān)性及通徑分析[J]. 李洋,劉萍,李健,高保全.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2012(06)
[4]用微衛(wèi)星標(biāo)記分析不同形態(tài)變異類型日本囊對蝦的遺傳多樣性[J]. 何永琴,蘇永全,毛勇,王軍.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(10)
[5]中國對蝦微衛(wèi)星四重PCR技術(shù)的建立及其在模擬放流效果評估方面的應(yīng)用[J]. 李偉亞,王偉繼,孔杰,金顯仕,阮曉紅,羅坤.  海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2012(05)
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[8]fSSR分析技術(shù)的建立及在大黃魚(Larimichthys crocea)親子鑒定中的應(yīng)用[J]. 武祥偉,劉賢德,王志勇.  海洋通報(bào). 2011(04)
[9]不同地理群體日本囊對蝦遺傳多樣性微衛(wèi)星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,劉堃.  水產(chǎn)科學(xué). 2011(07)
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博士論文
[1]微衛(wèi)星標(biāo)記輔助黃金鱸生長性狀數(shù)量遺傳與育種技術(shù)研究[D]. 曹小娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及生長相關(guān)性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]中國明對蝦和日本囊對蝦遺傳多樣性及對蝦科系統(tǒng)學(xué)初步研究[D]. 李玉龍.中國海洋大學(xué) 2009
[4]日本囊對蝦基因組串聯(lián)重復(fù)序列分析及微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D]. 欒生.中國海洋大學(xué) 2006
[5]形態(tài)標(biāo)記與微衛(wèi)星標(biāo)記在中國對蝦遺傳選育中的應(yīng)用研究[D]. 董世瑞.中國海洋大學(xué) 2006

碩士論文
[1]凡納濱對蝦引進(jìn)群體分子系譜構(gòu)建及中國對蝦分子標(biāo)志家系放流效果評估[D]. 張凱.中國海洋大學(xué) 2013
[2]利用分子標(biāo)記評估中國對蝦放流效果研究[D]. 李偉亞.上海海洋大學(xué) 2012
[3]日本囊對蝦遺傳多樣性的AFLP和SSR分析[D]. 郭慧.廣東海洋大學(xué) 2011
[4]中國東南沿海日本囊對蝦群體遺傳學(xué)的研究[D]. 趙斌麗.集美大學(xué) 2008
[5]三個(gè)STR基因座熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增的研究及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[D]. 劉志勇.四川大學(xué) 2006



本文編號:3346039

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