分子標記技術在日本對蝦育種中的應用研究
發(fā)布時間:2021-08-16 16:48
日本對蝦是我國重要的對蝦養(yǎng)殖種類,開展其良種選育工作具有重要的經(jīng)濟意義。本文以日本對蝦育種群體為材料,用微衛(wèi)星分子標記對不同選育群體進行遺傳鑒定,并建立了基于微衛(wèi)星信息的遺傳參數(shù)估計方法,為進一步開展日本對蝦分子輔助選育工作奠定了重要的技術基礎。對日本對蝦育種群體進行耐高溫測試,分析高溫耐受性與生長性狀、近交水平的關系;利用SLAF測序法篩選與耐高溫性狀關聯(lián)的SNP標記,為改良日本對蝦高溫耐受性提供分子輔助手段。利用8對微衛(wèi)星引物對日本對蝦養(yǎng)殖群體兩個世代的遺傳結構進行了分析,共計檢測到108個等位基因,等位基因長度為196-528bp,各位點等位基因數(shù)為6-23個。親本和子代群體每個位點平均等位基因數(shù)目分別為8.5個和11.5個,平均觀測雜合度分別為0.7211和0.6319,平均期望雜合度分別為0.7748和0.7635,平均多態(tài)信息含量分別為0.7315和0.7286。根據(jù)標記信息利用最大似然法對兩個世代的個體分別進行系譜結構推斷,親本群體劃分為6個群體,群體間遺傳距離為0.2773-2.356,均值為1.5097;子代群體劃分為17個群體,群體間遺傳距離為0-2.5929,均值...
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1日本對蝦基因組DNA電泳圖
圖2-1 日本對蝦基因組DNA電泳圖Fig. 2-1 Electrophoretogra for Genomes DNA of Masupenaeus japonicas圖2-2 日本對蝦基因組DNA的分光光度計檢測結果圖Fig. 2-2 Map Result of Genomes DNA of Masupenaeus japonicas by Spectrophotometry3.2 8 個微衛(wèi)星位點擴增結果及多態(tài)性本研究通過讀取 8 個微衛(wèi)星位點的峰圖(圖 2-3,圖 2-4 和圖 2-5)來實現(xiàn)基因分型,每個峰簇代表 1 個等位基因。日本對蝦是 2 倍體生物,對 1 個正常個體來說,在每個位點有 1 個(純合子)或 2 個(雜合子)等位基因。對峰型來說,完美的峰型呈現(xiàn)為單一獨立的峰,如圖 2-3 中的兩個位點。但實踐中往往會出現(xiàn)簇狀的峰,如圖 2-4 中藍峰和圖 2-5 中三種顏色的峰
圖 2-3 位點 MpSSR012(藍)和 MpSSR031(綠)的峰圖Fig. 2-3 Visualized Peaks on Locus MpSSR012 (blue) and MpSSR031 (green)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]斑節(jié)對蝦形態(tài)性狀對體質量影響的分析[J]. 孫苗苗,陳百堯,楊其彬,江世貴,周發(fā)林,蘇天鳳,黃建華. 海洋科學. 2013(05)
[2]微衛(wèi)星標記中的無效等位基因[J]. 文亞峰,Kentaro Uchiyama,韓文軍,Saneyoshi Ueno,謝偉東,徐剛標,Yoshihiko Tsumura. 生物多樣性. 2013(01)
[3]脊尾白蝦形態(tài)性狀對體重的相關性及通徑分析[J]. 李洋,劉萍,李健,高保全. 漁業(yè)科學進展. 2012(06)
[4]用微衛(wèi)星標記分析不同形態(tài)變異類型日本囊對蝦的遺傳多樣性[J]. 何永琴,蘇永全,毛勇,王軍. 水產(chǎn)學報. 2012(10)
[5]中國對蝦微衛(wèi)星四重PCR技術的建立及其在模擬放流效果評估方面的應用[J]. 李偉亞,王偉繼,孔杰,金顯仕,阮曉紅,羅坤. 海洋學報(中文版). 2012(05)
[6]利用微衛(wèi)星標記進行6個建鯉家系遺傳結構分析和家系鑒定[J]. 李建林,唐永凱,李紅霞,俞菊華. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2012(04)
[7]篩選雜交鯉親子鑒定的微衛(wèi)星標記(英文)[J]. 武耀,賈智英,李池陶,葛會爭,石連玉. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2012(05)
[8]fSSR分析技術的建立及在大黃魚(Larimichthys crocea)親子鑒定中的應用[J]. 武祥偉,劉賢德,王志勇. 海洋通報. 2011(04)
[9]不同地理群體日本囊對蝦遺傳多樣性微衛(wèi)星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,劉堃. 水產(chǎn)科學. 2011(07)
[10]三個野生群體日本囊對蝦遺傳多樣性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春. 生物技術通報. 2011(03)
博士論文
[1]微衛(wèi)星標記輔助黃金鱸生長性狀數(shù)量遺傳與育種技術研究[D]. 曹小娟.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[2]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構建及生長相關性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學 2010
[3]中國明對蝦和日本囊對蝦遺傳多樣性及對蝦科系統(tǒng)學初步研究[D]. 李玉龍.中國海洋大學 2009
[4]日本囊對蝦基因組串聯(lián)重復序列分析及微衛(wèi)星標記的開發(fā)與應用[D]. 欒生.中國海洋大學 2006
[5]形態(tài)標記與微衛(wèi)星標記在中國對蝦遺傳選育中的應用研究[D]. 董世瑞.中國海洋大學 2006
碩士論文
[1]凡納濱對蝦引進群體分子系譜構建及中國對蝦分子標志家系放流效果評估[D]. 張凱.中國海洋大學 2013
[2]利用分子標記評估中國對蝦放流效果研究[D]. 李偉亞.上海海洋大學 2012
[3]日本囊對蝦遺傳多樣性的AFLP和SSR分析[D]. 郭慧.廣東海洋大學 2011
[4]中國東南沿海日本囊對蝦群體遺傳學的研究[D]. 趙斌麗.集美大學 2008
[5]三個STR基因座熒光標記復合擴增的研究及其法醫(yī)學應用[D]. 劉志勇.四川大學 2006
本文編號:3346039
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1日本對蝦基因組DNA電泳圖
圖2-1 日本對蝦基因組DNA電泳圖Fig. 2-1 Electrophoretogra for Genomes DNA of Masupenaeus japonicas圖2-2 日本對蝦基因組DNA的分光光度計檢測結果圖Fig. 2-2 Map Result of Genomes DNA of Masupenaeus japonicas by Spectrophotometry3.2 8 個微衛(wèi)星位點擴增結果及多態(tài)性本研究通過讀取 8 個微衛(wèi)星位點的峰圖(圖 2-3,圖 2-4 和圖 2-5)來實現(xiàn)基因分型,每個峰簇代表 1 個等位基因。日本對蝦是 2 倍體生物,對 1 個正常個體來說,在每個位點有 1 個(純合子)或 2 個(雜合子)等位基因。對峰型來說,完美的峰型呈現(xiàn)為單一獨立的峰,如圖 2-3 中的兩個位點。但實踐中往往會出現(xiàn)簇狀的峰,如圖 2-4 中藍峰和圖 2-5 中三種顏色的峰
圖 2-3 位點 MpSSR012(藍)和 MpSSR031(綠)的峰圖Fig. 2-3 Visualized Peaks on Locus MpSSR012 (blue) and MpSSR031 (green)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]斑節(jié)對蝦形態(tài)性狀對體質量影響的分析[J]. 孫苗苗,陳百堯,楊其彬,江世貴,周發(fā)林,蘇天鳳,黃建華. 海洋科學. 2013(05)
[2]微衛(wèi)星標記中的無效等位基因[J]. 文亞峰,Kentaro Uchiyama,韓文軍,Saneyoshi Ueno,謝偉東,徐剛標,Yoshihiko Tsumura. 生物多樣性. 2013(01)
[3]脊尾白蝦形態(tài)性狀對體重的相關性及通徑分析[J]. 李洋,劉萍,李健,高保全. 漁業(yè)科學進展. 2012(06)
[4]用微衛(wèi)星標記分析不同形態(tài)變異類型日本囊對蝦的遺傳多樣性[J]. 何永琴,蘇永全,毛勇,王軍. 水產(chǎn)學報. 2012(10)
[5]中國對蝦微衛(wèi)星四重PCR技術的建立及其在模擬放流效果評估方面的應用[J]. 李偉亞,王偉繼,孔杰,金顯仕,阮曉紅,羅坤. 海洋學報(中文版). 2012(05)
[6]利用微衛(wèi)星標記進行6個建鯉家系遺傳結構分析和家系鑒定[J]. 李建林,唐永凱,李紅霞,俞菊華. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2012(04)
[7]篩選雜交鯉親子鑒定的微衛(wèi)星標記(英文)[J]. 武耀,賈智英,李池陶,葛會爭,石連玉. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2012(05)
[8]fSSR分析技術的建立及在大黃魚(Larimichthys crocea)親子鑒定中的應用[J]. 武祥偉,劉賢德,王志勇. 海洋通報. 2011(04)
[9]不同地理群體日本囊對蝦遺傳多樣性微衛(wèi)星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,劉堃. 水產(chǎn)科學. 2011(07)
[10]三個野生群體日本囊對蝦遺傳多樣性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春. 生物技術通報. 2011(03)
博士論文
[1]微衛(wèi)星標記輔助黃金鱸生長性狀數(shù)量遺傳與育種技術研究[D]. 曹小娟.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[2]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構建及生長相關性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學 2010
[3]中國明對蝦和日本囊對蝦遺傳多樣性及對蝦科系統(tǒng)學初步研究[D]. 李玉龍.中國海洋大學 2009
[4]日本囊對蝦基因組串聯(lián)重復序列分析及微衛(wèi)星標記的開發(fā)與應用[D]. 欒生.中國海洋大學 2006
[5]形態(tài)標記與微衛(wèi)星標記在中國對蝦遺傳選育中的應用研究[D]. 董世瑞.中國海洋大學 2006
碩士論文
[1]凡納濱對蝦引進群體分子系譜構建及中國對蝦分子標志家系放流效果評估[D]. 張凱.中國海洋大學 2013
[2]利用分子標記評估中國對蝦放流效果研究[D]. 李偉亞.上海海洋大學 2012
[3]日本囊對蝦遺傳多樣性的AFLP和SSR分析[D]. 郭慧.廣東海洋大學 2011
[4]中國東南沿海日本囊對蝦群體遺傳學的研究[D]. 趙斌麗.集美大學 2008
[5]三個STR基因座熒光標記復合擴增的研究及其法醫(yī)學應用[D]. 劉志勇.四川大學 2006
本文編號:3346039
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