瘤背石磺（Onchidium reevesii）是生活于灘涂濕地的半咸水兩棲性生物是一種具有很高的食用和藥用價(jià)值的貝類^[1,2]。其生活分布區(qū)域常見淡水與海水交匯處的高潮帶,其溫度適應(yīng)能力十分強(qiáng)、分布范圍廣闊、野生資源量非常豐富,江蘇鹽城,上海崇明、浙江溫州、福建福安等地一直以來均有銷售,被認(rèn)為是有助治料風(fēng)濕病、哮喘病,產(chǎn)后大補(bǔ)身體的很有特色的水產(chǎn)品。從形態(tài)角度觀察瘤背石磺并未進(jìn)化出完整的心血管系統(tǒng),僅在皮膚組織內(nèi)部存有少量的血竇,使其通過皮膚呼吸來獲取氧氣的能力不足,因而瘤背石磺進(jìn)化出“肺囊”來作為身體獲取氧氣的主要器官。行為學(xué)上,瘤背石磺也表現(xiàn)出長期且精確的“歸家行為”,高潮期生活在巢穴、洞穴和巖縫中,低潮時段出來攝取暴露在潮間帶灘涂泥土表面物上的腐殖質(zhì)和藻類等食物,從不同巢穴中出來的石磺在潮水再次漲起來1小時前能同時回家,推測可能是因?yàn)槠鋬?nèi)在的位置記憶能力,體現(xiàn)出此過程的高度精確性和復(fù)雜性,分析可能由外部環(huán)境授時因子（光線強(qiáng)弱、海風(fēng)大小、濕度變化和潮水聲浪等）或者生物體內(nèi)節(jié)律性分子機(jī)制的精確運(yùn)轉(zhuǎn)等因素的相互影響該歸巢行為的產(chǎn)生。本研究旨在構(gòu)建第一個瘤背石磺全... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：118 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

瘤背石磺神經(jīng)環(huán)組織的高通量測序分析流程圖

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文21圖2-1瘤背石磺神經(jīng)環(huán)組織全長轉(zhuǎn)錄組序列的GO注釋分類圖Fig2-1GOclassificationchartofthefull-lengthtranscriptsequenceoftheO.reevesiineuralring注：縱坐標(biāo)為GO三個大類的下一層級的GOterm，橫坐標(biāo)表示為有多少條轉(zhuǎn)錄本被注釋到該term下（包括該term的子term）。不同顏色的分類表示Goterm的三種基本分類（最上方的紅色柱形為生物學(xué)過程，中間位置的藍(lán)色柱形為細(xì)胞成分，最下方的綠色柱形是分子功能）。Note:TheordinateistheGOtermbelowthethreemajorcategoriesofGO,andtheabscissaisthenumberoftranscriptsthatareannotatedundertheterm(includingthesub-termsoftheterm).3differentclassificationsrepresentthethreebasicclassificationsofGoterm(Thetopredbaristhebiologicalprocess,thebluebarinthemiddleisthecellcomponent,andthebottomgreenbaristhemolecularfunction.).

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文22全長轉(zhuǎn)錄本序列經(jīng)KOG數(shù)據(jù)庫注釋之后的分類結(jié)果如圖2-2所示。結(jié)果顯示出，在KOG數(shù)據(jù)庫所有的26個分組中注釋到信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制分類下的轉(zhuǎn)錄本序列是最多，超過了3,500條序列，除去未命名的蛋白，本轉(zhuǎn)錄本參與度最低的是細(xì)胞運(yùn)動。圖2-2瘤背石磺神經(jīng)環(huán)組織全長轉(zhuǎn)錄組序列的KOG注釋分類圖Fig2-2KOGclassificationchartofthefull-lengthtranscriptsequenceoftheO.reevesiineuralring注：橫坐標(biāo)為KOG的26個group，縱坐標(biāo)為注釋到該group下的轉(zhuǎn)錄本個數(shù)。Note:Theabscissaisthe26groupsofKOG,andtheordinateisthenumberoftranscriptscommentedtothisgroup.對瘤背石磺神經(jīng)環(huán)的全長轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行KO注釋之后，再依據(jù)轉(zhuǎn)錄本序列所參與到的KEGG代謝通路進(jìn)行分類結(jié)果如圖2-3所示。如圖所示，注釋到KEGG上分類最多的信號通路是信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路，在該通路上共富集有4,731個轉(zhuǎn)錄本序列，該通路屬于環(huán)境信息處理過程。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3332924