波紋巴非蛤（Paphia undulata）是中國(guó)和東南亞地區(qū)的重要海水養(yǎng)殖貝類,國(guó)內(nèi)有關(guān)波紋巴非蛤的研究主要集中在人工育苗及營(yíng)養(yǎng)分析方面,關(guān)于波紋巴非蛤的遺傳學(xué)研究較少。本研究測(cè)序了波紋巴非蛤的轉(zhuǎn)錄組,并在此基礎(chǔ)上發(fā)掘免疫相關(guān)基因以及開發(fā)微衛(wèi)星標(biāo)記。主要取得了如下結(jié)果:1、采用Illumina Hiseq^TM 2000測(cè)序平臺(tái)對(duì)巴非蛤斧足組織進(jìn)行高通量測(cè)序,獲得26,173,215條reads,總長(zhǎng)度為5,286,668,078 bp。組裝獲得60,201條Unigenes,平均長(zhǎng)度為875 bp。其中N50的長(zhǎng)度為1478 bp,長(zhǎng)度大于0.5 kb的Unigenes有23,296個(gè),大于1kb的Unigenes有10,434個(gè),在Nr、Nt、Swiss-Prot、TrEMBL、COG和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)所有Unigenes進(jìn)行注釋,共注釋了22,260個(gè)Unigenes,其中有6,718個(gè)Unigenes被富集到KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中的237個(gè)通路上,5,786和15,017個(gè)Unigenes分別被注釋到COG數(shù)據(jù)庫(kù)和GO數(shù)據(jù)庫(kù)中。2、通過對(duì)波紋巴非蛤轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)... 

【文章來源】：集美大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

波紋非蛤Unigenes長(zhǎng)nscriptomesequ巴非蛤轉(zhuǎn)錄組長(zhǎng)度分布(B)

2.2.6.2NF括 P105結(jié)果發(fā)現(xiàn)和 DorUnigene2.2.6.3本5、7、9(Unigen(Mytilus2 NF-κBF-κB 蛋白5，P100，果現(xiàn)，分別有rsal 蛋白的基es 和 IKK 復(fù)3 MAPK 信實(shí)驗(yàn)中共識(shí)、13 B 和ne 3162)、和s galloprovFigure 2-信號(hào)通路是一個(gè)大家果蠅 Relish。有 2 個(gè)、1 個(gè)基因具有同復(fù)合物的具信號(hào)通路識(shí)別了 24 個(gè)MLT，三和 917 (Univincialis)體圖 2-4 c4 Schematic路家族，主要。后者通常個(gè)、1 個(gè)和同源性。我們具有同源性。個(gè)編碼 MKK三個(gè)基因編碼igene 13629內(nèi)的轉(zhuǎn)錄生complement 途representatio要包括兩大類常包括 RelC和 2 個(gè) Unig們還發(fā)現(xiàn)了。KK 同系物碼蛋白的氨9)。通過序生長(zhǎng)因子激途徑示意圖on of complem類：NF-κB、RelB、Regenes 被鑒定了 11 個(gè) Uni物的 Unigene氨基酸數(shù)目分列相似性比酶，矛尾魚ment pathway蛋白和 RelA、果蠅 D定是和 p10igenes 與 Ies。他們分分別 672 (U比對(duì)發(fā)現(xiàn)它魚(LatimeriayRel 蛋白。前Dorsal 和0、 p105、κB 蛋白相分為同型異構(gòu)Unigene 74它們分別和地a chalumna前者一般包Dif 蛋白。Relish、相似、12 個(gè)構(gòu)體 2、4、472)、 837地中海貽貝ae) 體內(nèi)的包7的

2.3 討2.3.1外源調(diào)理作用定了幾類[106-108]，巴非蛤水化合物集素和別領(lǐng)域有討論波紋巴非源凝集素（用和在免疫類凝結(jié)素，并且他們的轉(zhuǎn)錄組中物識(shí)別領(lǐng)域甘露聚糖凝有保留，并Figure 2-5非蛤免疫相（Lectins）是疫過程中吞諸如 C 類們的生物學(xué)功中，雖然比對(duì)域（CRDs）凝集素（M并普遍分布圖 2-5Schematic re相關(guān)基因是由碳水化噬作用起著類型外援凝集功能和應(yīng)對(duì)對(duì)到部分 C有重要作用BL）都是這在多細(xì)胞生TLR 信號(hào)通epresentation因發(fā)掘與分合物識(shí)別蛋著重要作用集素、半乳對(duì)寄生蟲和細(xì)型凝集素用。實(shí)際上這個(gè)家族的生物體中，通路示意圖of TLR sign分析蛋白組成的[105]。到目前乳凝素、乳糖細(xì)菌的表達(dá)素，它們大多上，C 類型凝的[110]，此外在與 β 半乳alling pathwa超級(jí)家族，前為止，在糖、甘露糖達(dá)過程也被研多是鈣化碳凝集素是一外，半乳凝集乳糖苷綁定ay.在異己識(shí)別在雙殼類物種糖或唾液酸綁研究過[87,10碳水化的凝集一個(gè)超級(jí)家族集素在碳水定過程有重要?jiǎng)e、凝集、種中已經(jīng)確綁定凝集素9]。在波紋集素，在碳族，膠原凝水化合物識(shí)要作用[111]。確素紋碳凝識(shí)

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3324943