高氨氮、低pH應(yīng)激下日本囊對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組分析及MjChi4基因的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-29 16:17
日本囊對(duì)蝦(Marsupenaeus japonicus)是最具養(yǎng)殖價(jià)值的對(duì)蝦品種之一。高氨氮、低pH是影響其養(yǎng)殖效果的重要環(huán)境因子,由于工廠化養(yǎng)殖模式下餌料及排泄物的積累、人類活動(dòng)及氣候變暖致使水環(huán)境不斷惡化,高氨氮和低pH脅迫對(duì)日本囊對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)造成的影響日趨嚴(yán)重。因此提高日本囊對(duì)蝦的高氨氮、低pH抗性,選育對(duì)氨氮、pH脅迫具有較強(qiáng)抗性的新品種勢(shì)在必行。但傳統(tǒng)的育種方法成本高、周期長(zhǎng),對(duì)低遺傳力性狀改良效果不明顯。所以本研究采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法,分析日本囊對(duì)蝦響應(yīng)高氨氮、低pH脅迫的分子機(jī)制,挖掘相關(guān)應(yīng)激響應(yīng)基因;克隆獲得應(yīng)激響應(yīng)基因幾丁質(zhì)酶4(MjChi4)全長(zhǎng)c DNA,利用qRT-PCR和RNA干擾分析,進(jìn)一步驗(yàn)證其可能參與對(duì)蝦抗高氨氮和抗低pH功能。本研究對(duì)加快日本囊對(duì)蝦抗高氨氮、低pH新品種選育具有重要意義。主要研究結(jié)果如下:(1)高氨氮應(yīng)激下日本囊對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組分析采用RNA-seq方法對(duì)高氨氮脅迫下日本囊對(duì)蝦的肝胰腺進(jìn)行分析,從10個(gè)轉(zhuǎn)錄本中獲得44,735,330–56,680,154個(gè)clean reads,有80.20%–82.38%的reads被映射到參考轉(zhuǎn)錄本。鑒定...
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
注釋基因的GO條目分類Fig2-1TheGOentriesclassificationofannotatedgenes
廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-2注釋基因的KOG功能分類Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes圖2-3注釋基因的KEGG通路分類Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA為細(xì)胞過程;B為環(huán)境信息處理;C為遺傳信息處理;D為代謝;E為有機(jī)系統(tǒng)。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-2注釋基因的KOG功能分類Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes圖2-3注釋基因的KEGG通路分類Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA為細(xì)胞過程;B為環(huán)境信息處理;C為遺傳信息處理;D為代謝;E為有機(jī)系統(tǒng)。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑節(jié)對(duì)蝦耐氨氮和淡水應(yīng)激性狀的遺傳參數(shù)估計(jì)[J]. 周發(fā)林,楊其彬,黃建華,姜松,楊麗詩(shī),張湯生,江世貴. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(05)
[2]pH對(duì)日本囊對(duì)蝦的急性毒性初步研究[J]. 梁彩鳳,劉建勇. 漁業(yè)現(xiàn)代化. 2019(01)
[3]日本沼蝦幾丁質(zhì)酶1C(MnCht1C)基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 張文宜,張世勇,陳校輝,喬慧,蔣速飛,熊貽偉,金舒博,龔永生,傅洪拓. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(02)
[4]日本囊對(duì)蝦(Marsupenaeus japonicus)秋繁同生群仔蝦不同耐寒性能群體間的形態(tài)表型差異[J]. 王志錚,張曉霞,任夙藝,蔣宏雷,劉偉健,Donatha Kajuna,Msumenji Phiri. 海洋與湖沼. 2018(01)
[5]海洋酸化對(duì)海水青鳉性別分化的影響[J]. 宋露露,王曉杰,宋佳坤. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[6]pH值、溫度和鹽度對(duì)墨吉明對(duì)蝦蛋白酶和淀粉酶活力的影響[J]. 郭文浚,楊世平,劉慧玲,王成桂,孫成波. 飼料工業(yè). 2017(24)
[7]凡納濱對(duì)蝦氨氮急性脅迫應(yīng)激敏感群體和耐受群體對(duì)WSSV敏感性的差異分析[J]. 盧霞,欒生,曹寶祥,郝登春,孟憲紅,曹家旺,代平,羅坤,孔杰. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2018(01)
[8]水生甲殼類幾丁質(zhì)酶類基因家族功能與表達(dá)調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 李旭光,周剛,周軍,林海,李躍華,陸全平,付龍龍,張?jiān)瀑F. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2017(04)
[9]不同放養(yǎng)密度對(duì)日本囊對(duì)蝦生長(zhǎng)性能的影響[J]. 林星,邱金海. 養(yǎng)殖與飼料. 2017(02)
[10]低pH脅迫對(duì)克氏原螯蝦鰓和肝胰腺酶活力及組織結(jié)構(gòu)的影響[J]. 陶易凡,強(qiáng)俊,王輝,徐跑,馬昕羽,趙文強(qiáng). 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(06)
博士論文
[1]凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)和抗病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析與基因組選擇育種研究[D]. 王全超.中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所) 2017
[2]凡納濱對(duì)蝦分子標(biāo)記的開發(fā)及其在遺傳育種中的應(yīng)用[D]. 于洋.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2014
[3]pH、氨氮脅迫對(duì)中國(guó)對(duì)蝦細(xì)胞凋亡和抗氧化系統(tǒng)影響機(jī)理的研究[D]. 王蕓.上海海洋大學(xué) 2011
碩士論文
[1]pH脅迫對(duì)中華絨螯蟹幼蟹生長(zhǎng)的影響及其營(yíng)養(yǎng)干預(yù)研究[D]. 黃志鵬.華東師范大學(xué) 2018
[2]柑橘全爪螨幾丁質(zhì)酶基因RNAi載體構(gòu)建及其在柑橘中的轉(zhuǎn)化研究[D]. 李俊麗.西南大學(xué) 2013
[3]pH脅迫對(duì)三種養(yǎng)殖對(duì)蝦生理生化指標(biāo)的影響[D]. 趙先銀.上海海洋大學(xué) 2011
[4]不同鹽度和pH對(duì)中國(guó)對(duì)蝦幼蝦的影響[D]. 陳麗.河北大學(xué) 2001
本文編號(hào):3309645
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
注釋基因的GO條目分類Fig2-1TheGOentriesclassificationofannotatedgenes
廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-2注釋基因的KOG功能分類Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes圖2-3注釋基因的KEGG通路分類Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA為細(xì)胞過程;B為環(huán)境信息處理;C為遺傳信息處理;D為代謝;E為有機(jī)系統(tǒng)。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-2注釋基因的KOG功能分類Fig2-2TheKOGfunctionclassificationofannotatedgenes圖2-3注釋基因的KEGG通路分類Fig2-3TheKEGGpathwayclassificationofannotatedgenesA為細(xì)胞過程;B為環(huán)境信息處理;C為遺傳信息處理;D為代謝;E為有機(jī)系統(tǒng)。Ameanscellularprocesses;Bmeansenvironmentalinformationprocessing;Cmeansgeneticinformationprocessing;Dmeansmetabolism;Emeansorganismalsystems.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑節(jié)對(duì)蝦耐氨氮和淡水應(yīng)激性狀的遺傳參數(shù)估計(jì)[J]. 周發(fā)林,楊其彬,黃建華,姜松,楊麗詩(shī),張湯生,江世貴. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(05)
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[4]日本囊對(duì)蝦(Marsupenaeus japonicus)秋繁同生群仔蝦不同耐寒性能群體間的形態(tài)表型差異[J]. 王志錚,張曉霞,任夙藝,蔣宏雷,劉偉健,Donatha Kajuna,Msumenji Phiri. 海洋與湖沼. 2018(01)
[5]海洋酸化對(duì)海水青鳉性別分化的影響[J]. 宋露露,王曉杰,宋佳坤. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[6]pH值、溫度和鹽度對(duì)墨吉明對(duì)蝦蛋白酶和淀粉酶活力的影響[J]. 郭文浚,楊世平,劉慧玲,王成桂,孫成波. 飼料工業(yè). 2017(24)
[7]凡納濱對(duì)蝦氨氮急性脅迫應(yīng)激敏感群體和耐受群體對(duì)WSSV敏感性的差異分析[J]. 盧霞,欒生,曹寶祥,郝登春,孟憲紅,曹家旺,代平,羅坤,孔杰. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2018(01)
[8]水生甲殼類幾丁質(zhì)酶類基因家族功能與表達(dá)調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 李旭光,周剛,周軍,林海,李躍華,陸全平,付龍龍,張?jiān)瀑F. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2017(04)
[9]不同放養(yǎng)密度對(duì)日本囊對(duì)蝦生長(zhǎng)性能的影響[J]. 林星,邱金海. 養(yǎng)殖與飼料. 2017(02)
[10]低pH脅迫對(duì)克氏原螯蝦鰓和肝胰腺酶活力及組織結(jié)構(gòu)的影響[J]. 陶易凡,強(qiáng)俊,王輝,徐跑,馬昕羽,趙文強(qiáng). 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(06)
博士論文
[1]凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)和抗病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析與基因組選擇育種研究[D]. 王全超.中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所) 2017
[2]凡納濱對(duì)蝦分子標(biāo)記的開發(fā)及其在遺傳育種中的應(yīng)用[D]. 于洋.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2014
[3]pH、氨氮脅迫對(duì)中國(guó)對(duì)蝦細(xì)胞凋亡和抗氧化系統(tǒng)影響機(jī)理的研究[D]. 王蕓.上海海洋大學(xué) 2011
碩士論文
[1]pH脅迫對(duì)中華絨螯蟹幼蟹生長(zhǎng)的影響及其營(yíng)養(yǎng)干預(yù)研究[D]. 黃志鵬.華東師范大學(xué) 2018
[2]柑橘全爪螨幾丁質(zhì)酶基因RNAi載體構(gòu)建及其在柑橘中的轉(zhuǎn)化研究[D]. 李俊麗.西南大學(xué) 2013
[3]pH脅迫對(duì)三種養(yǎng)殖對(duì)蝦生理生化指標(biāo)的影響[D]. 趙先銀.上海海洋大學(xué) 2011
[4]不同鹽度和pH對(duì)中國(guó)對(duì)蝦幼蝦的影響[D]. 陳麗.河北大學(xué) 2001
本文編號(hào):3309645
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