利用MiSeq高通量測序技術測定16S rRNA基因序列,分析比較池塘金邊鯉、稻田金邊鯉、池塘建鯉和稻田建鯉4組鯉魚腸道菌群的結構組成和豐度差異。試驗結果顯示,池塘金邊鯉組、稻田金邊鯉組、池塘建鯉組和稻田建鯉組分別獲得了377、250、367和455個運算分類單元,其中運算分類單元聚類分析發(fā)現,稻田建鯉組與另外3組差異最大;菌群多樣性分析發(fā)現,池塘金邊鯉組的辛普森指數顯著高于其他3組（P<0.05）,而稻田建鯉組及稻田金邊鯉組的香農指數分別為1.56±0.22和2.53±0.82,均高于對應的池塘組,但差異不顯著（P>0.05）;此外,池塘金邊鯉組中變形菌門（89.56%）和氣單胞菌屬（82.68%）在其腸道菌群組成中占有絕對優(yōu)勢（P<0.05）,而另外3組在門分類水平和屬分類水平的菌群結構和相對豐度較為相似,優(yōu)勢菌門均為變形菌門、梭桿菌門和厚壁菌門,主要優(yōu)勢菌屬為鯨桿菌屬、氣單胞菌屬和乳球菌屬;京都基因和基因組百科全書（KEGG）功能預測比較分析發(fā)現,各組樣品的腸道微生物富集到了多個相同的代謝途徑以及部分信號傳導、調節(jié)和修復機制相關信號通路。本研究結果發(fā)現,在稻田和... 

【文章來源】：水產科學. 2020,39(04)北大核心CSCD

【文章頁數】：8 頁

【部分圖文】：

各組樣品優(yōu)勢操作分類單元豐度熱圖

各組樣品前50信號通路維恩圖

在正常的生長環(huán)境下,生物體內的大多數微生物在調節(jié)機體的各種生命功能方面起著積極的作用[11]。大量水產養(yǎng)殖研究表明,由于水生動物生活環(huán)境的特殊性,養(yǎng)殖模式、池塘水質、飼料類型等環(huán)境影響因素以及發(fā)育階段、腸道結構、營養(yǎng)水平和系統(tǒng)發(fā)育地位等變化均可打破微生物與生物之間的平衡,從而影響水生動物消化道中微生物的種類和數量[12-14]。研究證實,微生物環(huán)境可以通過水環(huán)境、飼料等引起草魚(Ctenopharyngodon idellus)腸道菌群結構發(fā)生改變[15-16]。此外,同一養(yǎng)殖環(huán)境下的不同魚類,其腸道微生物群落的組成還可能會受到食性、棲息地和基因型的影響[17-19]。孟曉林等[20]發(fā)現,不同質量濃度的銅可影響鯉魚腸道菌群的多樣性和結構組成,并對鯉魚腸道上皮免疫屏障造成損傷。本研究發(fā)現,不同生長環(huán)境下的金邊鯉和建鯉腸道菌群均存在一定的差異,提示養(yǎng)殖環(huán)境會對鯉魚的腸道微生物群落結構產生不同程度的影響。該結果與李建柱[21]的研究結果基本一致,即在魚菜共生模式下,草魚、鯽魚(Carassius auratus)、鰱魚(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙魚(Aristichthys nobilis)等4種不同的鯉科魚類腸道微生物的菌落組成和優(yōu)勢菌落具有一定的相似性,但是與其他養(yǎng)殖模式中魚類的腸道微生物菌落卻具有差異性[21]。大量研究證實,魚類的腸道菌群受多種因素的影響,但這些因素的獨立或協(xié)同作用機制有待進一步研究。3.2 不同品種鯉魚腸道微生物優(yōu)勢菌群比較分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]2種活菌飼料對金鯽幼魚腸道及水體微生態(tài)的影響[J]. 馬小康,吳小嫚,胡樂琴.  水產科學. 2018(03)
[2]水體銅對鯉腸道菌群結構及免疫力的影響[J]. 孟曉林,朱振祥,李帥,胡文攀,明紅,聶國興.  河南師范大學學報(自然科學版). 2018(03)
[3]海水和淡水養(yǎng)殖凡納濱對蝦腸道和鰓的菌群結構分析[J]. 王元,周俊芳,韋信賢,馬榮榮,趙姝,李新蒼,房文紅.  湖南農業(yè)大學學報(自然科學版). 2018(02)
[4]斑馬魚腸道細菌的16S rDNA分子鑒定及PCR-SSCP分析[J]. 胡秀彩,呂愛軍,孫敬鋒,石洪玥,YEONG Yiksung,裴超,張超,李莉.  大連海洋大學學報. 2018(01)
[5]稻田養(yǎng)魚前景淺析[J]. 張學軍.  南方農業(yè). 2018(02)
[6]腸道菌群與草魚個體大小相關性研究[J]. 王微微,高麗麗,王小敏,徐運娥,周安.  安徽農業(yè)科學. 2017(33)
[7]鹽堿池塘養(yǎng)殖鯉腸道菌群的分子分析[J]. 黃進強,劉哲,王建福,蔡原,馮志云.  農業(yè)生物技術學報. 2013(06)
[8]主養(yǎng)草魚池塘三種混養(yǎng)模式下魚類腸道菌群PCR-DGGE比較[J]. 王琴,熊邦喜,朱玉婷,施培松,余育和.  農業(yè)生物技術學報. 2012(03)

博士論文
[1]鯉魚早期發(fā)育階段腸道菌群的分析及其免疫相關性研究[D]. 王蕾.山東師范大學 2017
[2]幾種水生動物腸道細菌的分子生態(tài)學分析[D]. 李可俊.上海交通大學 2007

碩士論文
[1]四川省兩種養(yǎng)殖模式下大鱗副泥鰍腸道微生物菌群特征、腸道酶活及肌肉氨基酸組分的比較[D]. 段元亮.四川農業(yè)大學 2017
[2]魚菜共生模式中微生物群落結構及多樣性的研究[D]. 李建柱.華中農業(yè)大學 2016
[3]水雍菜浮床養(yǎng)殖模式下黃顙魚腸道及環(huán)境微生物多樣性的研究[D]. 石焱.華中農業(yè)大學 2015



本文編號：3305540