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基于轉(zhuǎn)錄組測序的中華鱉微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MSTN基因的克隆表達

發(fā)布時間:2021-07-24 23:28
  中華鱉(Pelodiscus Sinensis),隸屬于爬行綱(Reptilia)、龜鱉目(Testudinata)、鱉科(Trionychidae)、鱉屬(Pelodiscus),其肉質(zhì)鮮嫩、風味鮮美獨特,自古以來就是深受消費者喜愛的滋補珍品。近年來隨著生活水平的提高,中華鱉的消費量呈逐年上升趨勢,其養(yǎng)殖規(guī)模也逐年擴大。然而自上世紀九十年代以來,由于大量境外走私鱉涌入我國,加之各養(yǎng)殖場間相互引種、和近親繁殖,導致中華鱉的種質(zhì)性狀出現(xiàn)退化,嚴重影響了中華鱉產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展,因此種質(zhì)保護和良種選育是中華鱉養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)亟待解決的重要課題。為此本文采用轉(zhuǎn)錄組測序技術,開發(fā)了與生長性狀相關的中華鱉EST-SSR標記,分析了與經(jīng)濟性狀關聯(lián)的基因位點,并對中華鱉四個不同養(yǎng)殖群體的遺傳結構和遺傳多樣性進行了分析;開展了中華鱉MSTN (Myostatin)基因的克隆及表達分析,為尋找挖掘中華鱉生長性狀相關基因的分子結構和功能,及其遺傳育種等工作奠定了一定的科學基礎。主要研究結果如下:1基于中華鱉轉(zhuǎn)錄組測序的EST-SSR標記的開發(fā)、驗證根據(jù)中華鱉轉(zhuǎn)錄組測序獲得的文庫序列,通過MSATCOMMANDER來... 

【文章來源】:蘇州大學江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測序的中華鱉微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MSTN基因的克隆表達


RNA-seq的實驗流程

基因,前肽,前體蛋白,成熟區(qū)


圖 2 MSTN 基因和蛋白質(zhì)的結構圖(引自張利媛等,2006)[32]Fig.2 Structure diagram of MSTN genic and protein3.3 MSTN 基因的表達Mostatin 基因在表達時,先合成前體蛋白(52kD),該前體蛋白一般包括信號肽、N-末端前肽區(qū)(26kD)和 C-末端成熟肽結構域(12.5kD)三部分組成,前體蛋白經(jīng)過兩次蛋白酶水解后,生成 C-末端成熟區(qū)和 N - 端前肽,生成的 26 ku 的成熟糖蛋白被分泌至胞外,而 N - 端前肽在在 RSRR 區(qū)被切除掉大部分(266 個氨基酸),剩余的成熟區(qū)(109 個氨基酸)通過其中的 9 個半胱氨酸形成二硫鍵形成的二聚體與 N-端前肽形成復合物,再與細胞膜上的受體發(fā)生相互作用引發(fā)磷酸化,觸發(fā) TGF-β 等一系列信號傳導途徑,通過 3 種 SMAD 蛋白的介導將信號傳人細胞核,作用于靶基因的調(diào)控區(qū)。在哺乳動物中,MSTN 在骨骼肌中高度表達[31]后來的一系列研究發(fā)現(xiàn),然而不同物種中的表達又有所差異。Sbarma 等[33]在研究牛

細胞周期進程,肌細胞,蛋白激酶,磷酸化


圖3 . MSTN對成肌細胞的細胞周期進程調(diào)控Fig.3 Regulation of MSTN on cell cycle of myoblast3.4.2 MSTN 對 Smads 的調(diào)控目前,對于MSTN的信號傳導途徑,一致認為的是MSTN - ActRⅡ B 型受體(蛋白激酶受體) - Smad蛋白信號傳導通路。其中Smads蛋白可以通過磷酸化和與蛋白質(zhì)間的相互作用進行信號的傳遞,與轉(zhuǎn)錄因子結合進而調(diào)節(jié)靶基因的表達水平,目前鑒定出Smads蛋白是TGF-β信號通路中的唯一底物。在此信號傳導途徑中,具體的過程是MSTN先與成肌細胞膜上的A ctRⅡ B型受體結合后形成復合物,活化Ⅱ型受體蛋白激酶后,Ⅱ型受體將Ⅰ型受體的GS區(qū)域磷酸化,從而激活Ⅰ型受體蛋白激酶,獲得活性的Ⅰ型受體蛋白激酶再將Smad3蛋白磷酸化,上述兩此磷酸化是介導TGF- β家族信號傳遞非常關鍵,最后再通過胞質(zhì)內(nèi)一系列受體的活化過程,

【參考文獻】:
期刊論文
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[2]中華鱉的體重與形態(tài)特征的關聯(lián)分析[J]. 馬曉,王曉清,杜海波,熊鋼,王璐明,夏建海.  湖南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2013(02)
[3]中華鱉表達序列標簽資源中的微衛(wèi)星信息分析[J]. 許曉軍,張海琪,張超,何中央.  經(jīng)濟動物學報. 2013(01)
[4]De-novo characterization of the soft-shelled turtle Pelodiscus sinensis transcriptome using Illumina RNA-Seq technology[J]. Wei WANG 1,Cai-yan LI 1,Chu-tian GE 1,Lei LEI 2,You-ling GAO 1,Guo-ying QIAN 1(1 Zhejiang Provincial Top Key Discipline of Modern Microbiology and Application,College of Biological and Environmental Sciences,Zhejiang Wanli University,Ningbo 315100,China)(2 Henan Provincial Bureau of Animal Husbandry,Zhengzhou 450008,China).  Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2013(01)
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博士論文
[1]泥蚶高通量轉(zhuǎn)錄組分析及生長相關基因的克隆與表達研究[D]. 董迎輝.中國海洋大學 2012
[2]豬肌生成抑制素cDNA的克隆、表達及其組織器官表達譜的研究[D]. 李慎濤.中國人民解放軍軍需大學 2001



本文編號:3301646

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