魚類腸道微生物在魚類營養(yǎng)以及健康方面具有重要的作用,腸道微生物不僅能促使魚類腸道的正常消化、吸收,還能抑制有害菌的入侵,提高巨噬細胞活性,增強機體免疫功能。本文研究不同環(huán)境下養(yǎng)殖和野生鱧腸道微生物群落結構特征、以及添加乳酸菌對鱧腸道微生物和生長的影響,為鱧的健康養(yǎng)殖和全雄雜交鱧良種良法推廣提供基礎。1. 不同環(huán)境下鱧的腸道微生物群落結構研究。采用Illumina Hi Seq 2500對不同養(yǎng)殖環(huán)境中成熟健康雜交鱧以及野生鱧腸道內(nèi)容物微生物進行測序及信息分析。結果表明:不同環(huán)境（分別為珠海斗門、佛山南海、佛山順德杏壇、陽江四個地點）鱧腸道內(nèi)容物樣品間OTU個數(shù)具有一定的差別,表明了不同環(huán)境下鱧腸道內(nèi)容物中微生物多樣性具有差異;研究樣品中優(yōu)勢菌群主要是:紅球菌屬Rhodococcus、梭菌屬Clostridium、微桿菌Microbacterium、弧菌屬Vibrio、氣單胞菌屬Aeromonas、鄰單胞菌屬Plesiomonas等,梭菌屬、紅球菌屬在所有樣品中都存在,但不同環(huán)境下所占的比例不同;熱圖分析發(fā)現(xiàn),鱧腸道微生物群落中還包含了變形桿菌屬Proteus、乳桿菌屬Lactobaci... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

各樣品OTU個數(shù)分布圖

上海海洋大學碩士學位論文11圖1-3樣品稀釋曲線Figure1-3sampledilutioncurve1.2.2.2腸道微生物Alpha多樣性如表1-2：每個樣品的Coverage均達到了99%，說明了每個樣品序列幾乎全被檢測出且達到飽和狀態(tài)，OTU覆蓋率數(shù)值越高，樣本物種檢測概率越高。Coverage指數(shù)反映此次樣品中腸道微生物菌群結構組成以及多樣性的真實性，每個樣品的Coverage值都接近百分百，證實了此次試驗數(shù)據(jù)的可靠性。Chao1和Ace指數(shù)衡量物種豐富度，Shannon和Simpson指數(shù)衡量物種多樣性[70]。比較31個樣品，發(fā)現(xiàn)CA50的Chao1值最大，高達364.1818，說明這個樣品里的微生物菌群豐富度最大；CA44的Simpson值最小，為0.0185；Shannon值最大，為4.5222，說明此樣品的腸道微生物群落多樣性最大。

上海海洋大學碩士學位論文14勢菌群主要有腸球菌屬Enterococcus、乳桿菌屬Lactobacillus、擬桿菌屬Bacteroides、Prevotella(屬于擬桿菌屬)、Bosea(屬于變形桿菌屬Proteus)、Phreatobacter(屬于變形桿菌屬)、Rhodobacter(屬于變形桿菌屬)等；而佛山南海池塘養(yǎng)殖鱧腸道中的優(yōu)勢菌群則為：棒桿菌屬Corynebacterium、短桿菌屬Brevibacterium、Cloacibacterium(屬于擬桿菌屬)、梭菌屬、Massilia(屬于變形桿菌屬)、羅斯氏菌屬Rothia等；珠海斗門養(yǎng)殖鱧腸道微生物優(yōu)勢菌群相對集中，只有弧菌屬和梭菌屬；佛山順德杏壇養(yǎng)殖鱧腸道的優(yōu)勢菌群有假單胞菌屬Pseudomonas、泛菌屬Pantoea、短波單胞菌屬Brevundimonas等；在陽江采集的野生鱧腸道內(nèi)容物中，優(yōu)勢菌群有葡萄球菌Staphylococcus、梭菌屬、氣單胞菌屬等。圖1-4物種豐度聚類熱圖Figure1-4speciesabundanceclusteringheatmap注：顏色代表物種豐度程度，橫向聚類為樣品信息，縱向聚類為微生物物種信息，最左側為微生物物種聚類樹，最上方為樣品聚類樹。Note:Colorrepresentsthedegreeofspeciesabundance,horizontalclusteringissampleinformation,


本文編號：3298349