尼羅羅非魚γ-干擾素基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-07-21 04:39
尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)隸屬于鱸形目(Percifomes)、麗魚科(Cichlidae),為聯(lián)合國糧農(nóng)組織向世界各國推薦的養(yǎng)殖對(duì)象,現(xiàn)已成為中國重要的養(yǎng)殖魚類品種。但近年來養(yǎng)殖羅非魚暴發(fā)了鏈球菌病,導(dǎo)致羅非魚的大量死亡,威脅著我國羅非魚養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展,因此很有必要開展羅非魚免疫防御機(jī)制的研究。γ-干擾素是調(diào)控天然免疫和細(xì)胞免疫的一種重要的細(xì)胞因子,除了具有抗病毒作用外,干擾素還參與到其他重要的生理反應(yīng)中,如調(diào)節(jié)細(xì)胞的生長、分化、凋亡及免疫反應(yīng)等,近年的研究發(fā)現(xiàn)干擾素中的γ-干擾素還具有顯著的抗菌作用。本研究克隆了尼羅羅非魚γ-干擾素基因,實(shí)時(shí)定量PCR檢測了其在無乳鏈球菌感染前后各組織和器官中的表達(dá),以了解γ-干擾素基因在尼羅羅非魚免疫防御過程中的作用;同時(shí)以斑馬魚作為轉(zhuǎn)基因研究模型,評(píng)估金魚Tgf2轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因魚研制上應(yīng)用的可行性,并應(yīng)用于構(gòu)建轉(zhuǎn)基因羅非魚。主要研究內(nèi)容如下:1.尼羅羅非魚γ-干擾素基因的克隆與表達(dá)特性分析。本研究從尼羅羅非魚脾臟組織中擴(kuò)增到γ-干擾素基因的cDNA,其大小為690bp,開放閱讀框?yàn)?21bp,推測編碼206個(gè)...
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
尼羅羅非魚γ-干擾素基因蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測與抗原性分析
根據(jù) γ-干擾素基因編碼氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,尼羅羅非魚先與斜帶石斑魚聚類,再與大西洋鮭魚和虹鱒聚類 (圖 1-3) 。圖1-3 尼羅羅非魚與其他魚類γ-干擾素基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.1-3 Phylogenetic tree based on γIFN gene of O.niloticus and other teleosts3.3 用于 qRT-PCR 的尼羅羅非魚內(nèi)參基因的篩選分別以正常和受感染的尼羅羅非魚的各組織 cDNA 為模板,檢測 18s rRNA、EF1α 和 β-actin 3 個(gè)內(nèi)參基因在各組織中的表達(dá)。分別用 normFinder 和 geNorm 軟件進(jìn)行分析,結(jié)果顯示 3 個(gè)內(nèi)參基因中,18s rRNA 基因的表達(dá)最穩(wěn)定,可作為下一步 qRT-PCR 分析的內(nèi)參基因(圖 1-4)。表1-4 尼羅羅非魚與其他魚類 γ- 干擾素基因氨基酸序列的相似性Tab.2-4 Amino acid identity of γIFNgenes of O. niloticusand other teleosts
上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文22圖1-4 尼羅羅非魚內(nèi)參基因的篩選Fig.1-4 Selection of reference gene of O.niloticus3.4 正常尼羅羅非魚γ-干擾素基因的組織表達(dá)實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析 γ-干擾素基因在正常尼羅羅非魚 9 個(gè)組織中的表達(dá)差異,結(jié)果顯示尼羅羅非魚 γ-干擾素的 mRNA 在脾臟中表達(dá)量最高,其次是腸、鰓和腎,在心臟、肌肉和皮膚組織中的表達(dá)量最低(圖 1-5)。圖 1-5 γ-干擾素基因 mRNAs 在不同組織中的差異表達(dá)以 18s rRNA 基因?yàn)閮?nèi)參基因,計(jì)算各組織表達(dá)量與表達(dá)量最低組織的表達(dá)量的倍數(shù):標(biāo)注相同字母的,表示柱間差異不顯著;標(biāo)注不同字母的,表示柱間差異顯著(P <0.05)。Fig. 1-5 Tissue distribution of the γIFN mRNAs of O.niloticus measured by qRT-PCR. Expressionvalues were normalized to those of 18s rRNA gene. Data are expressed as the mean fold change(means ±S.E., n = 6) from the calibrator group. Bars with different letters indicate statisticaldifferences (P < 0.05).3.5 感染無乳鏈球菌后尼羅羅非魚 γ-干擾素基因的組織表達(dá)變化qRT-PCR 檢測受無乳鏈球菌感染后,尼羅羅非魚 γ-干擾素基因在各組織中的表達(dá)差異。結(jié)果顯示,感染后 6h
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Tgf2轉(zhuǎn)座子在團(tuán)頭魴基因組中的插入效率[J]. 郭秀明,黃創(chuàng)新,沈睿杰,蔣霞云,陳杰,鄒曙明. 遺傳. 2013(08)
[2]轉(zhuǎn)基因魚的研究進(jìn)展與商業(yè)化前景[J]. 葉星,田園園,高風(fēng)英. 遺傳. 2011(05)
[3]金魚hAT家族轉(zhuǎn)座子Tgf2的克隆及其結(jié)構(gòu)[J]. 鄒曙明,杜雪地,袁劍,蔣霞云. 遺傳. 2010(12)
[4]干擾素-γ研究進(jìn)展[J]. 楊生海,殷宏,劉永生,張杰. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(08)
[5]利用Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的增強(qiáng)子誘捕技術(shù)獲得血管相關(guān)轉(zhuǎn)基因斑馬魚系(英文)[J]. 薛峪霖,肖安,文路,賈岳,高岳,朱作言,林碩,張博. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(07)
[6]魚類多倍體育種的研究進(jìn)展回顧[J]. 胡玲玲,李加兒. 水產(chǎn)科技. 2009(05)
[7]魚類干擾素系統(tǒng)基因研究進(jìn)展[J]. 李淑英,陳新華. 生物技術(shù)通報(bào). 2007(05)
[8]轉(zhuǎn)基因水生動(dòng)物的應(yīng)用研究[J]. 葉星,王海英,簡清,白俊杰,勞海華. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(01)
[9]斑馬魚Mylz2啟動(dòng)子的克隆與轉(zhuǎn)綠色熒光蛋白基因魚的構(gòu)建[J]. 簡清,白俊杰,葉星,夏仕玲,梁旭方,羅建仁. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2004(05)
[10]轉(zhuǎn)基因技術(shù)與動(dòng)物育種[J]. 楊秀芹,劉娣. 動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué). 2002(07)
本文編號(hào):3294327
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
尼羅羅非魚γ-干擾素基因蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測與抗原性分析
根據(jù) γ-干擾素基因編碼氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,尼羅羅非魚先與斜帶石斑魚聚類,再與大西洋鮭魚和虹鱒聚類 (圖 1-3) 。圖1-3 尼羅羅非魚與其他魚類γ-干擾素基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.1-3 Phylogenetic tree based on γIFN gene of O.niloticus and other teleosts3.3 用于 qRT-PCR 的尼羅羅非魚內(nèi)參基因的篩選分別以正常和受感染的尼羅羅非魚的各組織 cDNA 為模板,檢測 18s rRNA、EF1α 和 β-actin 3 個(gè)內(nèi)參基因在各組織中的表達(dá)。分別用 normFinder 和 geNorm 軟件進(jìn)行分析,結(jié)果顯示 3 個(gè)內(nèi)參基因中,18s rRNA 基因的表達(dá)最穩(wěn)定,可作為下一步 qRT-PCR 分析的內(nèi)參基因(圖 1-4)。表1-4 尼羅羅非魚與其他魚類 γ- 干擾素基因氨基酸序列的相似性Tab.2-4 Amino acid identity of γIFNgenes of O. niloticusand other teleosts
上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文22圖1-4 尼羅羅非魚內(nèi)參基因的篩選Fig.1-4 Selection of reference gene of O.niloticus3.4 正常尼羅羅非魚γ-干擾素基因的組織表達(dá)實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 分析 γ-干擾素基因在正常尼羅羅非魚 9 個(gè)組織中的表達(dá)差異,結(jié)果顯示尼羅羅非魚 γ-干擾素的 mRNA 在脾臟中表達(dá)量最高,其次是腸、鰓和腎,在心臟、肌肉和皮膚組織中的表達(dá)量最低(圖 1-5)。圖 1-5 γ-干擾素基因 mRNAs 在不同組織中的差異表達(dá)以 18s rRNA 基因?yàn)閮?nèi)參基因,計(jì)算各組織表達(dá)量與表達(dá)量最低組織的表達(dá)量的倍數(shù):標(biāo)注相同字母的,表示柱間差異不顯著;標(biāo)注不同字母的,表示柱間差異顯著(P <0.05)。Fig. 1-5 Tissue distribution of the γIFN mRNAs of O.niloticus measured by qRT-PCR. Expressionvalues were normalized to those of 18s rRNA gene. Data are expressed as the mean fold change(means ±S.E., n = 6) from the calibrator group. Bars with different letters indicate statisticaldifferences (P < 0.05).3.5 感染無乳鏈球菌后尼羅羅非魚 γ-干擾素基因的組織表達(dá)變化qRT-PCR 檢測受無乳鏈球菌感染后,尼羅羅非魚 γ-干擾素基因在各組織中的表達(dá)差異。結(jié)果顯示,感染后 6h
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Tgf2轉(zhuǎn)座子在團(tuán)頭魴基因組中的插入效率[J]. 郭秀明,黃創(chuàng)新,沈睿杰,蔣霞云,陳杰,鄒曙明. 遺傳. 2013(08)
[2]轉(zhuǎn)基因魚的研究進(jìn)展與商業(yè)化前景[J]. 葉星,田園園,高風(fēng)英. 遺傳. 2011(05)
[3]金魚hAT家族轉(zhuǎn)座子Tgf2的克隆及其結(jié)構(gòu)[J]. 鄒曙明,杜雪地,袁劍,蔣霞云. 遺傳. 2010(12)
[4]干擾素-γ研究進(jìn)展[J]. 楊生海,殷宏,劉永生,張杰. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(08)
[5]利用Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的增強(qiáng)子誘捕技術(shù)獲得血管相關(guān)轉(zhuǎn)基因斑馬魚系(英文)[J]. 薛峪霖,肖安,文路,賈岳,高岳,朱作言,林碩,張博. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(07)
[6]魚類多倍體育種的研究進(jìn)展回顧[J]. 胡玲玲,李加兒. 水產(chǎn)科技. 2009(05)
[7]魚類干擾素系統(tǒng)基因研究進(jìn)展[J]. 李淑英,陳新華. 生物技術(shù)通報(bào). 2007(05)
[8]轉(zhuǎn)基因水生動(dòng)物的應(yīng)用研究[J]. 葉星,王海英,簡清,白俊杰,勞海華. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(01)
[9]斑馬魚Mylz2啟動(dòng)子的克隆與轉(zhuǎn)綠色熒光蛋白基因魚的構(gòu)建[J]. 簡清,白俊杰,葉星,夏仕玲,梁旭方,羅建仁. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2004(05)
[10]轉(zhuǎn)基因技術(shù)與動(dòng)物育種[J]. 楊秀芹,劉娣. 動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué). 2002(07)
本文編號(hào):3294327
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