條斑紫菜PHB基因克隆及生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-07-13 00:02
抗增殖蛋白(prohibitin)最早在哺乳動物中發(fā)現(xiàn),有研究表明,抗增殖蛋白是一種分布廣泛且高度保守的蛋白。因其具有抗細胞增殖,參與細胞衰老、凋亡等生物進程等的功能,已經(jīng)引起研究者的廣泛關(guān)注。條斑紫菜是我國重要的經(jīng)濟海藻之一,本論文以大型經(jīng)濟海藻為研究材料,克隆抗增殖蛋白基因,并對該基因的表達蛋白進行生物信息學分析。首先,從日本紫菜數(shù)據(jù)庫中獲得抗增殖蛋白相關(guān)EST序列并進行拼接,得到一條1167bp的抗增殖蛋白基因序列,據(jù)此序列設(shè)計特異性引物。對條斑紫菜絲狀體細胞總RNA進行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。以cDNA為模版,采用PCR技術(shù)在特異性引物存在下對該序列進行擴增,獲得了序列長度為1126bp的DNA片段。經(jīng)BLAST比對顯示該基因片段與其它物種的抗增殖蛋白基因編碼的氨基酸序列相似度最高達到83%,并且克隆得到的抗增殖蛋白基因包含一個完整的開放閱讀框,長度為894bp。其次,采用生物信息學方法和工具分析預測條斑紫菜抗增殖蛋白相應(yīng)氨基酸序列的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)特征。分析結(jié)果顯示:克隆得到的抗增殖蛋白基因是一個不穩(wěn)定的親水性蛋白,共含有297個氨基酸,分子量為32954.5Da,等電點為6.88...
【文章來源】:遼寧師范大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1條斑紫菜Fig1.1Porphyrayezoensis
圖 1.2 條斑紫菜生活史Fig.1.2 Life cycle of Porphyra yezoensis活環(huán)境條斑紫菜葉狀體,通常分布于沿海地區(qū)下帶巖礁上(如半葉紫菜)或在潮上帶是由單層細胞構(gòu)成的紫紅色和成簇生長因種類、品系、生長季節(jié)和生長環(huán)境的因為生活在潮間帶,低潮時經(jīng)常性地暴射陽光和低溫具有很強的耐受力,生態(tài)養(yǎng)價值
ACCCAGCGTGAGCAGGTGTCGTGGACTTCAACATCGCCCTGGGAGTACACGGCGGCGGTGGGGCGCGGTTCCTGGTGGAGACGCGCAGGGTGAGGCCCGCTCCCGGGCTTTATCCAGCTCCGCATGTCCCGCTCGGCCAACCCTGGGGGAGGTTGCGTCCGACCGCGGCCAGAGGGGGAGGGCTCCGGCGGCGACTGCGACCCA據(jù)拼接后的片段,利用 primer5檢測
本文編號:3280917
【文章來源】:遼寧師范大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1條斑紫菜Fig1.1Porphyrayezoensis
圖 1.2 條斑紫菜生活史Fig.1.2 Life cycle of Porphyra yezoensis活環(huán)境條斑紫菜葉狀體,通常分布于沿海地區(qū)下帶巖礁上(如半葉紫菜)或在潮上帶是由單層細胞構(gòu)成的紫紅色和成簇生長因種類、品系、生長季節(jié)和生長環(huán)境的因為生活在潮間帶,低潮時經(jīng)常性地暴射陽光和低溫具有很強的耐受力,生態(tài)養(yǎng)價值
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本文編號:3280917
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