條斑紫菜PHB基因克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-13 00:02
抗增殖蛋白(prohibitin)最早在哺乳動(dòng)物中發(fā)現(xiàn),有研究表明,抗增殖蛋白是一種分布廣泛且高度保守的蛋白。因其具有抗細(xì)胞增殖,參與細(xì)胞衰老、凋亡等生物進(jìn)程等的功能,已經(jīng)引起研究者的廣泛關(guān)注。條斑紫菜是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)海藻之一,本論文以大型經(jīng)濟(jì)海藻為研究材料,克隆抗增殖蛋白基因,并對(duì)該基因的表達(dá)蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析。首先,從日本紫菜數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得抗增殖蛋白相關(guān)EST序列并進(jìn)行拼接,得到一條1167bp的抗增殖蛋白基因序列,據(jù)此序列設(shè)計(jì)特異性引物。對(duì)條斑紫菜絲狀體細(xì)胞總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。以cDNA為模版,采用PCR技術(shù)在特異性引物存在下對(duì)該序列進(jìn)行擴(kuò)增,獲得了序列長(zhǎng)度為1126bp的DNA片段。經(jīng)BLAST比對(duì)顯示該基因片段與其它物種的抗增殖蛋白基因編碼的氨基酸序列相似度最高達(dá)到83%,并且克隆得到的抗增殖蛋白基因包含一個(gè)完整的開(kāi)放閱讀框,長(zhǎng)度為894bp。其次,采用生物信息學(xué)方法和工具分析預(yù)測(cè)條斑紫菜抗增殖蛋白相應(yīng)氨基酸序列的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)特征。分析結(jié)果顯示:克隆得到的抗增殖蛋白基因是一個(gè)不穩(wěn)定的親水性蛋白,共含有297個(gè)氨基酸,分子量為32954.5Da,等電點(diǎn)為6.88...
【文章來(lái)源】:遼寧師范大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1條斑紫菜Fig1.1Porphyrayezoensis
圖 1.2 條斑紫菜生活史Fig.1.2 Life cycle of Porphyra yezoensis活環(huán)境條斑紫菜葉狀體,通常分布于沿海地區(qū)下帶巖礁上(如半葉紫菜)或在潮上帶是由單層細(xì)胞構(gòu)成的紫紅色和成簇生長(zhǎng)因種類、品系、生長(zhǎng)季節(jié)和生長(zhǎng)環(huán)境的因?yàn)樯钤诔遍g帶,低潮時(shí)經(jīng)常性地暴射陽(yáng)光和低溫具有很強(qiáng)的耐受力,生態(tài)養(yǎng)價(jià)值
ACCCAGCGTGAGCAGGTGTCGTGGACTTCAACATCGCCCTGGGAGTACACGGCGGCGGTGGGGCGCGGTTCCTGGTGGAGACGCGCAGGGTGAGGCCCGCTCCCGGGCTTTATCCAGCTCCGCATGTCCCGCTCGGCCAACCCTGGGGGAGGTTGCGTCCGACCGCGGCCAGAGGGGGAGGGCTCCGGCGGCGACTGCGACCCA據(jù)拼接后的片段,利用 primer5檢測(cè)
本文編號(hào):3280917
【文章來(lái)源】:遼寧師范大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1條斑紫菜Fig1.1Porphyrayezoensis
圖 1.2 條斑紫菜生活史Fig.1.2 Life cycle of Porphyra yezoensis活環(huán)境條斑紫菜葉狀體,通常分布于沿海地區(qū)下帶巖礁上(如半葉紫菜)或在潮上帶是由單層細(xì)胞構(gòu)成的紫紅色和成簇生長(zhǎng)因種類、品系、生長(zhǎng)季節(jié)和生長(zhǎng)環(huán)境的因?yàn)樯钤诔遍g帶,低潮時(shí)經(jīng)常性地暴射陽(yáng)光和低溫具有很強(qiáng)的耐受力,生態(tài)養(yǎng)價(jià)值
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本文編號(hào):3280917
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