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仿刺參(Apostichopus japonicus)高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及生長(zhǎng)性狀QTL精細(xì)定位

發(fā)布時(shí)間:2021-07-09 11:52
  仿刺參Apostichopus japonicus (Selenka 1867)作為棘皮動(dòng)物門(mén)的代表性物種之一,是我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中商業(yè)價(jià)值較高的經(jīng)濟(jì)物種,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的發(fā)展,仿刺參養(yǎng)殖已逐漸成為我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)。本研究利用2b-RAD (2b-restriction site-associated DNA)技術(shù),對(duì)仿刺參雜交家系子一代個(gè)體進(jìn)行了高通量的SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)。構(gòu)建了高密度、高精度的仿剌參遺傳連鎖圖譜,進(jìn)行了生長(zhǎng)性狀的精細(xì)定位。為仿刺參全基因組測(cè)序以及其他基因組學(xué)和遺傳學(xué)研究提供了豐富的信息和理論基礎(chǔ)。同時(shí)也為仿刺參生長(zhǎng)機(jī)制和分子標(biāo)記輔助育種提供了理論和物質(zhì)基礎(chǔ)。1.作圖家系的選擇及仿刺參2b-RAD測(cè)序文庫(kù)車(chē)的構(gòu)建本研究中建立遺傳圖譜的家系的構(gòu)建方法采用“雙假擬測(cè)交”(double pseudo-testcross)策略,有目的地挑選了達(dá)到性成熟期的生長(zhǎng)性狀優(yōu)良的個(gè)體分別作為建立家系的父母本,構(gòu)建了9個(gè)“同父異母”的全同胞家系。在家系子代生長(zhǎng)到1齡的時(shí)間點(diǎn),進(jìn)行采樣和后期的家系鑒定,最終確定用于構(gòu)建遺傳圖譜的家系材料。以雜交家系兩個(gè)親本和子一代100個(gè)個(gè)體的基因組DN... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

仿刺參(Apostichopus japonicus)高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及生長(zhǎng)性狀QTL精細(xì)定位


圖2.6?仿刺參整合閣譜22個(gè)連鎖群對(duì)染色體中屯、粒的推斷??Figure??

正態(tài)分布,體重,區(qū)間


位于15.00-24.00g的區(qū)間范圍內(nèi)。其中在7.00-8.00g的體重值區(qū)間范圍內(nèi)的個(gè)體??數(shù)最多,表現(xiàn)出了明顯的峰值。分析結(jié)果顯示作闡個(gè)體的體重基本符合正態(tài)分布??(圖3.1),可用于后續(xù)的體重性狀Q化分析。??79??

遺傳連鎖圖譜,仿刺參,生長(zhǎng)性狀,連鎖群


.連鎖區(qū)間定位于構(gòu)建的仿刺參遺傳連鎖圖譜的第5號(hào)連鎖群上,包含了?3個(gè)與??仿刺參生長(zhǎng)性狀呈顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)。這3個(gè)QTL位點(diǎn)(SNP1135801,??SNP2336295,?SNP2336306)定位于第5號(hào)連鎖群的79.63-80.01?cM區(qū)間,共計(jì)??可W解釋?zhuān)保梗福サ姆麓虆⒆鲌D個(gè)體的生長(zhǎng)性狀表型差異。??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[8]刺參的趨光性以及對(duì)附著基顏色的感應(yīng)行為[J]. 張輝,王印庚,榮小軍,曹善茂,陳霞.  生態(tài)學(xué)雜志. 2009(03)
[9]夏眠對(duì)刺參(Apostichopus japonicus (Selenka))能量收支的影響[J]. 袁秀堂,楊紅生,王麗麗,周毅,張濤,劉鷹.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2007(08)
[10]刺參對(duì)筏式養(yǎng)殖海區(qū)生物沉積物清除作用的模擬研究[J]. 劉石林,楊紅生,周毅,張濤,袁秀堂.  海洋科學(xué). 2006(12)

博士論文
[1]刺參的幼體發(fā)育與遺傳育種學(xué)研究[D]. 孫秀俊.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[2]刺參遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及卵母細(xì)胞成熟過(guò)程研究[D]. 龐震國(guó).中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009

碩士論文
[1]仿刺參Apostichopus japonicus胚胎發(fā)育和主要系統(tǒng)的組織學(xué)研究[D]. 朱峰.中國(guó)海洋大學(xué) 2009
[2]刺參的性腺發(fā)育及受精細(xì)胞學(xué)研究[D]. 龐震國(guó).中國(guó)海洋大學(xué) 2006



本文編號(hào):3273694

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