一種短開讀框編碼的核糖體蛋白S27在日本囊對蝦先天免疫中的功能研究
發(fā)布時間:2021-07-08 12:18
通過對基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的分析,顯示不同生物中存在數(shù)百至數(shù)千個翻譯但未注釋的短開放閱讀框(sORF)或稱小開放閱讀框(smORF)。短開放閱讀框(sORF)是指編碼少于100個密碼子多肽的核苷酸序列。研究發(fā)現(xiàn),許多sORF在機體的生命過程中發(fā)揮重要作用,例如生長發(fā)育,細胞凋亡和先天免疫等。我們在病毒刺激的日本囊對蝦(Marsupenaeus japonicus蝦的血細胞和消化道等轉(zhuǎn)錄組中發(fā)現(xiàn)了多種不同的sORFs,通過對這些sORFs進行的生物信息學分析,發(fā)現(xiàn)有多種sORFs屬于核糖體蛋白的組成成分。越來越多的研究表明,許多種核糖體蛋白除組成核糖體,參與蛋白質(zhì)的生物合成之外,還具有獨立于蛋白質(zhì)生物合成的作用,例如參與DNA修復、細胞發(fā)育調(diào)控和細胞分化等核糖體外功能;并且在胃癌、結(jié)直腸癌、食管癌和肝癌等腫瘤組織中一些核糖體蛋白基因高表達。這些sORFs及其編碼的多肽在對蝦免疫防御中有什么功能?為了回答這個問題,本論文開展了 sORFs在對蝦免疫反應中的功能研究。首先,我們通過組織分布以及表達模式對篩選的sORF進行分析,發(fā)現(xiàn)它們在所檢測的各種對蝦組織中均有分布,并在WSSV刺激后呈...
【文章來源】:山東大學山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?1對蝦和果蠅Toll通路的比較(Li?&?Xiang,2013)
2.?3抗菌肽??在對蝦中,AMP作為免疫反應的產(chǎn)物,在直接殺死或清除感染的病原面發(fā)揮重要作用(Bachereetal.,2004)。自從在凡納濱對蝦中發(fā)現(xiàn)了對革蘭性細菌和真菌具有抗菌活性的對4下素(penaeidins)以來(Destoumieux?et1997),到目前為止,對蝦中已有不同類型的抗微生物肽或蛋白質(zhì)被報道。penaeidins?之外,還有?Crustins?和抗脂多糖因子(Antilipopolysaccharide?factoALF)等。研究發(fā)現(xiàn),來自中國對蝦的重組Crustins可以在體外抑制革蘭氏菌的生長(Sunetal.,?2010)。??2.4酚氣化酶原級聯(lián)反應??黑化作用是無脊椎動物中宿主防御的重要方面,其由響應于病原性感染氧化酶活化系統(tǒng)控制。在對蝦中,黑化作用在防御多種包括鰻弧菌??
3.?3七種sORF的表達模式分析??為了檢測這七種sORF是否會在WSSV感染日本囊對蝦的過程中發(fā)揮作用,??我們用qPCR檢測了這七種基因在WSSV刺激的不同時間點的表達情況。圖2.3??表示的是這七種基因在血細胞中表達模式。由圖中可以看出,婦SUMO-1,??婦SUMO-3,邱'RPS28,均RPS27,功TIPL38,姆ACBD6?在?WSSV?刺激后有明??顯的上調(diào)表現(xiàn),表明這幾個基因?qū)τ冢祝樱樱指腥救毡灸覍ξr都有不同程度的響??應。而il^RPS27在WSSV刺激時,有明顯的上調(diào)表達及顯著性差異,因此我們??選定邱RPS27作為進一步研究的基因。??20??
本文編號:3271552
【文章來源】:山東大學山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?1對蝦和果蠅Toll通路的比較(Li?&?Xiang,2013)
2.?3抗菌肽??在對蝦中,AMP作為免疫反應的產(chǎn)物,在直接殺死或清除感染的病原面發(fā)揮重要作用(Bachereetal.,2004)。自從在凡納濱對蝦中發(fā)現(xiàn)了對革蘭性細菌和真菌具有抗菌活性的對4下素(penaeidins)以來(Destoumieux?et1997),到目前為止,對蝦中已有不同類型的抗微生物肽或蛋白質(zhì)被報道。penaeidins?之外,還有?Crustins?和抗脂多糖因子(Antilipopolysaccharide?factoALF)等。研究發(fā)現(xiàn),來自中國對蝦的重組Crustins可以在體外抑制革蘭氏菌的生長(Sunetal.,?2010)。??2.4酚氣化酶原級聯(lián)反應??黑化作用是無脊椎動物中宿主防御的重要方面,其由響應于病原性感染氧化酶活化系統(tǒng)控制。在對蝦中,黑化作用在防御多種包括鰻弧菌??
3.?3七種sORF的表達模式分析??為了檢測這七種sORF是否會在WSSV感染日本囊對蝦的過程中發(fā)揮作用,??我們用qPCR檢測了這七種基因在WSSV刺激的不同時間點的表達情況。圖2.3??表示的是這七種基因在血細胞中表達模式。由圖中可以看出,婦SUMO-1,??婦SUMO-3,邱'RPS28,均RPS27,功TIPL38,姆ACBD6?在?WSSV?刺激后有明??顯的上調(diào)表現(xiàn),表明這幾個基因?qū)τ冢祝樱樱指腥救毡灸覍ξr都有不同程度的響??應。而il^RPS27在WSSV刺激時,有明顯的上調(diào)表達及顯著性差異,因此我們??選定邱RPS27作為進一步研究的基因。??20??
本文編號:3271552
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