長(zhǎng)江上游中華紋胸鮡遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-22 22:04
為研究中華紋胸鮡(Glyptothorax sinensis)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),對(duì)長(zhǎng)江上游9個(gè)中華紋胸鮡群體(巴南、江津、合江、瀘州、南溪、犍為、巧家、寧南和攀枝花)的Cyt b基因和COI基因進(jìn)行分析。結(jié)果顯示:341條Cyt b序列共檢測(cè)出80個(gè)變異位點(diǎn),65個(gè)單倍型,平均單倍型多樣性(Hd)和平均核苷酸多樣性(Pi)分別為0.845和0.007。109條COI序列共檢測(cè)出31個(gè)變異位點(diǎn),23個(gè)單倍型,Hd指數(shù)和Pi指數(shù)分別為0.774和0.005。分子方差分析(AMOVA)顯示FST>0.5,說(shuō)明中華紋胸鮡采樣點(diǎn)群體間出現(xiàn)明顯分化。構(gòu)建的NJ樹(shù)和單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖顯示單倍型聚類形成三個(gè)高支持率的分支。
【文章來(lái)源】:淡水漁業(yè). 2020,50(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
中華紋胸鮡采樣位點(diǎn)
對(duì)Cyt b序列的9個(gè)群體以及Clade I、II(圖4)分別進(jìn)行Tajima′s D[25]和Fu′s Fs[26]中性檢驗(yàn),結(jié)果顯示Clade I(-59.18,-2.18)均為顯著負(fù)值,長(zhǎng)江上游群體也均為負(fù)值(表1)。堿基錯(cuò)配分析顯示,Clade I、Clade II呈多峰結(jié)構(gòu)(圖4)。BSP分析結(jié)果表明,Clade I群體在距今0.1~0.04 Ma(百萬(wàn)年)經(jīng)歷了擴(kuò)張事件。圖3 基于Cyt b序列的中華紋胸鮡群體Structure聚類分析
圖2 基于Cyt b序列(a)和COI序列(b)構(gòu)建的中華紋胸鮡單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖(右)和鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(左)圖4 基于Cyt b序列的中華紋胸鮡錯(cuò)配分布分析和BSP分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于CO I和Cytb DNA條形碼在鲌屬魚(yú)類物種鑒定中的應(yīng)用[J]. 王利華,羅相忠,王丹,李偉,李忠,鄒桂偉,梁宏偉. 淡水漁業(yè). 2019(04)
[2]長(zhǎng)江上游特有魚(yú)類紅唇薄鰍線粒體控制區(qū)遺傳多樣性研究[J]. 申紹祎,田輝伍,汪登強(qiáng),陳大慶,劉紹平. 淡水漁業(yè). 2017(04)
[3]長(zhǎng)江上游宜賓江段漁業(yè)資源現(xiàn)狀研究[J]. 熊飛,劉紅艷,段辛斌,劉紹平,陳大慶. 西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(11)
[4]基于線粒體COI基因部分序列的長(zhǎng)江口蝦虎魚(yú)科魚(yú)類系統(tǒng)分類[J]. 于亞男,宋超,侯俊利,王妤,莊平. 淡水漁業(yè). 2014(05)
[5]鮡科魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析及其分歧時(shí)間估算[J]. 于美玲,何舜平. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2012(04)
[6]基于線粒體細(xì)胞色素b基因序列分析的泉水魚(yú)遺傳多樣性研究[J]. 司從利,章群,馬奔,黃小彧,黎瑞寶,樂(lè)小亮. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(01)
[7]我國(guó)鮡科魚(yú)類種質(zhì)資源研究進(jìn)展[J]. 肖海,代應(yīng)貴,張曉杰,冉光鑫. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(08)
[8]怒江扎那紋胸鮡的遺傳多樣性和遺傳分化[J]. 劉紹平,王珂,袁希平,汪登強(qiáng),岳興建,陳大慶. 遺傳. 2010(03)
[9]涪江下游福建紋胸鮡可量性狀的初步研究[J]. 王汨,王懷林,劉明鏡,高梅,王志堅(jiān). 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(21)
[10]應(yīng)用形態(tài)度量學(xué)方法對(duì)中華紋胸鮡和福建紋胸鮡物種有效性的研究[J]. 謝仲桂,張鶚,何舜平. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(02)
博士論文
[1]長(zhǎng)江上游大規(guī)模水庫(kù)群綜合運(yùn)用聯(lián)合優(yōu)化調(diào)度研究[D]. 李純龍.華中科技大學(xué) 2016
碩士論文
[1]三種鮡科魚(yú)類線粒體全基因組的測(cè)定及鮡科魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 李博.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]瀾滄江老撾紋胸鮡遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 金菊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]長(zhǎng)江上游魚(yú)類資源現(xiàn)狀及早期資源調(diào)查研究[D]. 段辛斌.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3243605
【文章來(lái)源】:淡水漁業(yè). 2020,50(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
中華紋胸鮡采樣位點(diǎn)
對(duì)Cyt b序列的9個(gè)群體以及Clade I、II(圖4)分別進(jìn)行Tajima′s D[25]和Fu′s Fs[26]中性檢驗(yàn),結(jié)果顯示Clade I(-59.18,-2.18)均為顯著負(fù)值,長(zhǎng)江上游群體也均為負(fù)值(表1)。堿基錯(cuò)配分析顯示,Clade I、Clade II呈多峰結(jié)構(gòu)(圖4)。BSP分析結(jié)果表明,Clade I群體在距今0.1~0.04 Ma(百萬(wàn)年)經(jīng)歷了擴(kuò)張事件。圖3 基于Cyt b序列的中華紋胸鮡群體Structure聚類分析
圖2 基于Cyt b序列(a)和COI序列(b)構(gòu)建的中華紋胸鮡單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖(右)和鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(左)圖4 基于Cyt b序列的中華紋胸鮡錯(cuò)配分布分析和BSP分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[4]基于線粒體COI基因部分序列的長(zhǎng)江口蝦虎魚(yú)科魚(yú)類系統(tǒng)分類[J]. 于亞男,宋超,侯俊利,王妤,莊平. 淡水漁業(yè). 2014(05)
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[8]怒江扎那紋胸鮡的遺傳多樣性和遺傳分化[J]. 劉紹平,王珂,袁希平,汪登強(qiáng),岳興建,陳大慶. 遺傳. 2010(03)
[9]涪江下游福建紋胸鮡可量性狀的初步研究[J]. 王汨,王懷林,劉明鏡,高梅,王志堅(jiān). 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(21)
[10]應(yīng)用形態(tài)度量學(xué)方法對(duì)中華紋胸鮡和福建紋胸鮡物種有效性的研究[J]. 謝仲桂,張鶚,何舜平. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(02)
博士論文
[1]長(zhǎng)江上游大規(guī)模水庫(kù)群綜合運(yùn)用聯(lián)合優(yōu)化調(diào)度研究[D]. 李純龍.華中科技大學(xué) 2016
碩士論文
[1]三種鮡科魚(yú)類線粒體全基因組的測(cè)定及鮡科魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 李博.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]瀾滄江老撾紋胸鮡遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 金菊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]長(zhǎng)江上游魚(yú)類資源現(xiàn)狀及早期資源調(diào)查研究[D]. 段辛斌.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3243605
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3243605.html
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