基于DArT技術(shù)的大黃魚耐低溫性狀相關(guān)分子標(biāo)記的篩選
發(fā)布時(shí)間:2021-06-22 04:22
大黃魚(Larimichthyscrocea)隸屬于硬骨魚綱,鱸形目(Perciformes),石首魚科(Sciaenidae),黃魚屬。又名黃魚、大鮮、金龍、紅口等,寧波等地市1997年引進(jìn)福建大黃魚養(yǎng)殖后,發(fā)現(xiàn)冬季越冬水溫過不了8oC,年年有大黃魚被凍死,為此選育了大黃魚“東海1號”耐低溫和生長較快的新品種。通過以“東海1號”為實(shí)驗(yàn)材料,采用多樣性芯片技術(shù)(DiversityArraysTechnology,DArT)篩選了大黃魚耐低溫性狀相關(guān)分子標(biāo)記,為“東海1號”選育提供了理論依據(jù)。結(jié)果如下:對“東海1號”進(jìn)行低溫篩選試驗(yàn),得到了在水溫9oC以上有死亡征兆的七條對低溫敏感的“東海1號”大黃魚低溫敏感群體和在水溫6oC以下仍健康存活的七條耐低溫的“東海1號”大黃魚耐低溫群體。以低溫篩選實(shí)驗(yàn)中得到的低溫敏感群體和耐低溫群體作為實(shí)驗(yàn)材料。將低溫敏感群體和耐低溫群體的基因組DNA等量混合,選擇七種降低基因組復(fù)雜度方法(PstI/Alu I、Pst I/Ban II、Pst I/Bsp1286I、Pst I/BstN I、Pst I/Hae III、Pst I/Rsa I、Pst I/T...
【文章來源】:寧波大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大黃魚基因組DNA電泳圖
圖 2.1 大黃魚基因組 DNA 電泳圖Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DN4 DNA;2:X477 DNA;3:X456 DNA;4:X63X625 DNA DNA; 2: X477 DNA; 3: X456 DNA; 4: X633 DNADNA 的酶切X434、X477、X456”和“X633、X700、 Pst I/Rsa I、Pst I/Ban II、Pst I/Alu I、Pst I/BI 七組限制性內(nèi)切酶組合進(jìn)行酶切,結(jié)果 黃 魚 基 因 組 DNA 被 徹 底 切 開 , 酶說明酶切效果較好,符合實(shí)驗(yàn)要求。
圖 2.3 大黃魚基因組酶切 PCRg.2.3 Agarose electrophoresis of genomic restriction PM:1kb Marker;1:Pst I/Alu I 加接頭后 PCR;Ban II 加接頭后 PCR;3:Pst I/Bsp1286 I 加接頭/BstN I 加接頭后 PCR;5:Pst I/Hae III 加接頭st I/Rsa I 加接頭后 PCR;7:Pst I/Taq I 加接頭后:1kb Marker;1:Pst I/Alu I adding adapter PCI adding adapter PCR;3:Pst I/Bsp1286 I adding I adding adapter PCR;5:Pst I/Hae III adding sa I adding adapter PCR;7:Pst I/Taq I adding aOMA SPINTM+TE-400 Columns 柱后,并庫,庫容量≥105,隨機(jī)挑取部分克隆對然有個(gè)別片段大。500bp,但絕大部、Pst I/Alu I、Pst I/Bsp1286 I、Pst I/Hae II合插入片段大小平均值分別為 742.87
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]4種裸胸鱔的分子遺傳多樣性和親緣關(guān)系的RAPD分析[J]. 杜民,尹紹武,劉艷紅,牛寶珍,齊興柱,張本,廖經(jīng)球,霍蕊. 海洋通報(bào). 2013(03)
[2]鯽體重和體厚相關(guān)的EST-SSRs標(biāo)記篩選及同源基因分析[J]. 郭薇,鄭先虎,匡友誼,崔曉亮,曹頂臣,孫效文. 淡水漁業(yè). 2013(02)
[3]黃姑魚♀與大黃魚♂雜交試驗(yàn)與AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,劉穎,王志勇. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[4]草魚EST-SSRs標(biāo)記的篩選及其與生長性狀相關(guān)分析[J]. 王解香,白俊杰,于凌云. 淡水漁業(yè). 2012(01)
[5]鯉改良品系與體質(zhì)量、體長性狀相關(guān)的TRAP標(biāo)記篩選[J]. 董在杰,曲疆奇,袁新華,蘇勝彥,謝莊. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(04)
[6]鯉EST標(biāo)記與耐低溫性狀的相關(guān)性分析及定位[J]. 常玉梅,高國強(qiáng),徐麗華,劉金亮,劉春雷,梁利群. 動物學(xué)研究. 2010(06)
[7]半滑舌鰨雌魚基因組Fosmid文庫構(gòu)建及分析[J]. 孫曉華,張全啟,王旭波,翟騰,齊潔,王志剛,王興蓮,王亞楠. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(08)
[8]大黃魚♀與黃姑魚♂雜交F1家系初孵仔魚的AFLP分析[J]. 劉穎,蔡明夷,劉賢德,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(06)
[9]低溫選擇大黃魚(Pseudosciaena crocea)的肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,吳玉珍,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,羅海忠,柳敏海,傅榮兵. 海洋與湖沼. 2010(03)
[10]低溫脅迫下大黃魚肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,徐鎮(zhèn),徐萬土. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2010(02)
博士論文
[1]基于生物芯片標(biāo)記技術(shù)的五種瀕危冷杉保護(hù)遺傳學(xué)研究[D]. 饒龍兵.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2009
[2]中國紅鯉遺傳多樣性研究[D]. 王成輝.上海水產(chǎn)大學(xué) 2002
碩士論文
[1]香魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性的AFLP分析及性別相關(guān)標(biāo)記的篩選[D]. 范慧慧.寧波大學(xué) 2012
[2]白菜類作物DArT標(biāo)記體系的建立[D]. 馮艷麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
本文編號:3242109
【文章來源】:寧波大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大黃魚基因組DNA電泳圖
圖 2.1 大黃魚基因組 DNA 電泳圖Fig.2.1 Agarose electrophoresis of genomic DN4 DNA;2:X477 DNA;3:X456 DNA;4:X63X625 DNA DNA; 2: X477 DNA; 3: X456 DNA; 4: X633 DNADNA 的酶切X434、X477、X456”和“X633、X700、 Pst I/Rsa I、Pst I/Ban II、Pst I/Alu I、Pst I/BI 七組限制性內(nèi)切酶組合進(jìn)行酶切,結(jié)果 黃 魚 基 因 組 DNA 被 徹 底 切 開 , 酶說明酶切效果較好,符合實(shí)驗(yàn)要求。
圖 2.3 大黃魚基因組酶切 PCRg.2.3 Agarose electrophoresis of genomic restriction PM:1kb Marker;1:Pst I/Alu I 加接頭后 PCR;Ban II 加接頭后 PCR;3:Pst I/Bsp1286 I 加接頭/BstN I 加接頭后 PCR;5:Pst I/Hae III 加接頭st I/Rsa I 加接頭后 PCR;7:Pst I/Taq I 加接頭后:1kb Marker;1:Pst I/Alu I adding adapter PCI adding adapter PCR;3:Pst I/Bsp1286 I adding I adding adapter PCR;5:Pst I/Hae III adding sa I adding adapter PCR;7:Pst I/Taq I adding aOMA SPINTM+TE-400 Columns 柱后,并庫,庫容量≥105,隨機(jī)挑取部分克隆對然有個(gè)別片段大。500bp,但絕大部、Pst I/Alu I、Pst I/Bsp1286 I、Pst I/Hae II合插入片段大小平均值分別為 742.87
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]4種裸胸鱔的分子遺傳多樣性和親緣關(guān)系的RAPD分析[J]. 杜民,尹紹武,劉艷紅,牛寶珍,齊興柱,張本,廖經(jīng)球,霍蕊. 海洋通報(bào). 2013(03)
[2]鯽體重和體厚相關(guān)的EST-SSRs標(biāo)記篩選及同源基因分析[J]. 郭薇,鄭先虎,匡友誼,崔曉亮,曹頂臣,孫效文. 淡水漁業(yè). 2013(02)
[3]黃姑魚♀與大黃魚♂雜交試驗(yàn)與AFLP分析[J]. 隋班良,蔡明夷,劉穎,王志勇. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[4]草魚EST-SSRs標(biāo)記的篩選及其與生長性狀相關(guān)分析[J]. 王解香,白俊杰,于凌云. 淡水漁業(yè). 2012(01)
[5]鯉改良品系與體質(zhì)量、體長性狀相關(guān)的TRAP標(biāo)記篩選[J]. 董在杰,曲疆奇,袁新華,蘇勝彥,謝莊. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(04)
[6]鯉EST標(biāo)記與耐低溫性狀的相關(guān)性分析及定位[J]. 常玉梅,高國強(qiáng),徐麗華,劉金亮,劉春雷,梁利群. 動物學(xué)研究. 2010(06)
[7]半滑舌鰨雌魚基因組Fosmid文庫構(gòu)建及分析[J]. 孫曉華,張全啟,王旭波,翟騰,齊潔,王志剛,王興蓮,王亞楠. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(08)
[8]大黃魚♀與黃姑魚♂雜交F1家系初孵仔魚的AFLP分析[J]. 劉穎,蔡明夷,劉賢德,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(06)
[9]低溫選擇大黃魚(Pseudosciaena crocea)的肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,吳玉珍,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,羅海忠,柳敏海,傅榮兵. 海洋與湖沼. 2010(03)
[10]低溫脅迫下大黃魚肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,徐鎮(zhèn),徐萬土. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2010(02)
博士論文
[1]基于生物芯片標(biāo)記技術(shù)的五種瀕危冷杉保護(hù)遺傳學(xué)研究[D]. 饒龍兵.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2009
[2]中國紅鯉遺傳多樣性研究[D]. 王成輝.上海水產(chǎn)大學(xué) 2002
碩士論文
[1]香魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性的AFLP分析及性別相關(guān)標(biāo)記的篩選[D]. 范慧慧.寧波大學(xué) 2012
[2]白菜類作物DArT標(biāo)記體系的建立[D]. 馮艷麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
本文編號:3242109
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