克氏原螯蝦兩種SOD基因克隆與功能研究
發(fā)布時間:2021-06-09 04:22
克氏原螯蝦(Procambarus clarkii)已發(fā)展成為最具特色、最具潛力的水產養(yǎng)殖新品種之一。但近些年暴發(fā)的螺原體疫病給克氏原螯蝦這一正處于高速發(fā)展期的養(yǎng)殖品種帶來了重大損失。中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma eriocheiris)作為一種新型的水產病原,除了引起中華絨螯蟹“顫抖病”外,還引起克氏原螯蝦的嚴重病害,已成為嚴重危害我國克氏原螯蝦等淡水蝦蟹養(yǎng)殖的重要病原,此外,嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)是水產常見病菌,開展此類病原微生物的研究不僅具有理論價值,而且可以為生產實際中的病害防治提供理論依據和實用技術,對我國水產養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。SOD(Superoxide Dismutase)的中文名稱超氧化物歧化酶,是生物體內重要的抗氧化物酶,廣泛分布于各種生物體內。本文從克氏原螯蝦血細胞中分別克隆得到的胞外型銅鋅超氧化物歧化酶和線粒體型錳超氧化物歧化酶兩種基因,并研究克氏原螯蝦在不同病原菌(中華絨螯蟹螺原體和嗜水氣單胞菌)刺激下這兩種SOD的mRNA轉錄水平上和蛋白水平上的變化,從而揭示克氏原螯蝦體內的SOD參與抗病菌的作用。1...
【文章來源】:南京師范大學江蘇省 211工程院校
【文章頁數】:66 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比對
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源對比和系統(tǒng)發(fā)育分析將獲得的基因的氨基酸序列與己知的其他物種的相對應的蛋白序列進行比對,發(fā)現克氏原螯奸的mtMnSOD與其余的已知物種的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶結構域(DVWEHAYY)和四個保守的氨基酸構成的猛離子結合位點(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(圖 3-2)?耸显閙tMnSOD的氨基酸序列與紅鰲螯奸、岸蟹、羅氏沼奸、鋸緣青蟹和中國明對好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次為87%,85%, 84%,83%和82%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明MnSODs也可以分為兩個不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD?耸显閙tMnSOD與其他的甲殼類動物的mtMnSOD是有點接近的,但與甲殼動物的cytMnSODs的親緣性比較遠。(圖3-3)
突光定量PCR分別檢測兩種SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神經、腸、肌肉、鰓和胃7個組織中的基因轉錄水平的變化,P-actin作為內參。如圖4.1示,兩種基因在七個組織中均有廣泛的表達,ecCuZnSOD在不同組織中表達趨勢與mtMnSOD是類似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血細胞和肝胰腺中高表達,而在肌肉、心、胃、腸和神經組織中表達水平相對較低。33
本文編號:3219918
【文章來源】:南京師范大學江蘇省 211工程院校
【文章頁數】:66 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比對
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源對比和系統(tǒng)發(fā)育分析將獲得的基因的氨基酸序列與己知的其他物種的相對應的蛋白序列進行比對,發(fā)現克氏原螯奸的mtMnSOD與其余的已知物種的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶結構域(DVWEHAYY)和四個保守的氨基酸構成的猛離子結合位點(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(圖 3-2)?耸显閙tMnSOD的氨基酸序列與紅鰲螯奸、岸蟹、羅氏沼奸、鋸緣青蟹和中國明對好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次為87%,85%, 84%,83%和82%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明MnSODs也可以分為兩個不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD?耸显閙tMnSOD與其他的甲殼類動物的mtMnSOD是有點接近的,但與甲殼動物的cytMnSODs的親緣性比較遠。(圖3-3)
突光定量PCR分別檢測兩種SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神經、腸、肌肉、鰓和胃7個組織中的基因轉錄水平的變化,P-actin作為內參。如圖4.1示,兩種基因在七個組織中均有廣泛的表達,ecCuZnSOD在不同組織中表達趨勢與mtMnSOD是類似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血細胞和肝胰腺中高表達,而在肌肉、心、胃、腸和神經組織中表達水平相對較低。33
本文編號:3219918
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