櫛孔扇貝(Chlamys farreri)性腺發(fā)育相關基因的篩選及Cf-phb2在精巢中的表達分析
發(fā)布時間:2021-05-27 13:06
性腺發(fā)育是發(fā)育生物學研究的重要領域之一,這是一個多基因參與調控的過程。PHB(Prohibitin)被認為參與多種生物過程,包括抑制某些轉錄因子的轉錄活性、對細胞周期的負調控作用以及抑制腫瘤和細胞凋亡等。本研究采用半定量RT-PCR技術對櫛孔扇貝(Chlamys farreri)增殖期精、卵巢差異表達譜中的10個兩性差異表達序列標簽進行了驗證;RACE技術獲得phb2全長cDNA序列,采用半定量RT-PCR、real-time PCR和原位雜交技術分析了該基因在櫛孔扇貝中的空間表達以及各發(fā)育階段精巢中的表達特征。主要結果如下:半定量RT-PCR檢測,確定櫛孔扇貝10個兩性差異表達序列標簽中3個為卵巢高表達,4個為精巢高表達,一致率為40%。以其中一個精巢高表達標簽(>F0BWI0G01A0M8X)序列為基礎,RACE技術獲得一個全長為2122bp的cDNA序列,該序列含有開放閱讀框882bp,編碼293個氨基酸;經過序列比對及同源性分析初步判定其為櫛孔扇貝phb2基因,定名為Cf-phb2。櫛孔扇貝phb2的半定量RT-PCR檢測結果顯示,其在各器官中均有表達,以精巢中表達量最高...
【文章來源】:中國海洋大學山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:59 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1 性腺發(fā)育相關基因的研究進展
1.1 脊椎動物性腺發(fā)育相關基因
1.2 無脊椎動物性腺發(fā)育相關基因
2 PHB 家族基因的研究進展
2.1 PHB 家族基因的序列特征
2.2 PHB 家族成員的功能
3 本研究的目的和意義
第二章 櫛孔扇貝性腺發(fā)育相關基因的篩選
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 工具酶、試劑盒及儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 總 RNA 的提取
1.2.2 雌雄性腺 cDNA 模板的合成
1.2.3 半定量 RT-PCR
1.2.3.1 設計 RT-PCR 引物
1.2.3.2 雌雄性腺模板量的調平
1.2.3.3 RT-PCR 分析各基因在雌雄性腺中表達的差異
2 結果與分析
2.1 總 RNA 的質量
2.2 櫛孔扇貝增殖期精卵巢差異表達序列的檢驗
3 討論
第三章 櫛孔扇貝 phb2 基因 cDNA 全長的克隆及表達
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 工具酶、試劑盒及儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 性腺組織學切片的制備和性腺分期
1.2.2 總 RNA 提取和 cDNA 模板的合成
1.2.3 目的基因的 RACE 擴增
1.2.3.1 引物設計
1.2.3.2 RACE-Ready cDNA 的合成
1.2.3.3 RACE 擴增及序列的生物信息學分析
1.2.3.3.1 5’-RACE 擴增
1.2.3.3.2 3’-RACE 擴增
1.2.4 目的基因的全長 cDNA 獲得生物信息學分析
1.2.5 半定量 RT-PCR
1.2.6 相對定量 qRT-PCR 分析
1.2.7 原位雜交
1.2.7.1 探針的的制備
1.2.7.2 組織原位雜交
2 結果與分析
2.1 目的基因全長 cDNA 的克隆及其序列的生物信息學分析
2.2 櫛孔扇貝 phb2 基因的時空表達特征
3 討論
3.1 Cf-phb2 基因序列結構及同源性分析
3.2 Cf-phb2 基因的時空表達規(guī)律及其在精子發(fā)生中的作用
3.3 Cf-phb2 基因潛在的抑制細胞增殖的作用
總結
參考文獻
個人簡歷
待發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Foxl2基因在櫛孔扇貝發(fā)育過程中的表達圖式[J]. 劉曉玲,劉建國,王丹,張子炎,張志峰. 中國水產科學. 2013(01)
[2]單環(huán)刺螠生殖腺的發(fā)生及雌體的生殖周期[J]. 李昀,王航寧,邵明瑜,張志峰. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2012(06)
[3]櫛孔扇貝Cf-dmrt4-like基因的克隆、序列特征及表達分析[J]. 馮政夫,邵明瑜,孫大鵬,張志峰. 中國水產科學. 2010(05)
[4]Research Progress in the Structure and Functions of Prohibitin[J]. Jia-xian OU, Si-fei HUANG, Hong CHEN Department of Anatomy & Histo-Embryology, Shanghai Medical School, Fudan University, Shanghai 200032, China. Journal of Reproduction and Contraception. 2010(02)
[5]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp (Fenneropenaeus chinensis)[J]. 周倩如,邵明瑜,秦貞奎,康慶浩,張志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[6]馬氏珠母貝Dmrt5基因的克隆及時序表達模式分析[J]. 于非非,桂建芳,周莉,王梅芳,余祥勇. 水生生物學報. 2009(05)
[7]Sox基因家族功能的研究進展[J]. 江玲霞,李紀委,賀彧,李美麗,方威,李貴強,徐銀學. 生物技術通報. 2008(06)
[8]Prohibitin研究現狀與人類疾病[J]. 史雨,黃文彥,徐虹. 國際兒科學雜志. 2008 (05)
[9]哺乳動物性別決定機理與SRY基因調控性腺分化的研究進展[J]. 楊宇,馬恒東. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2007(03)
[10]稀有鮈鯽Dmrt基因家族13個成員的克隆與序列分析[J]. 張小艷,孫立偉,查金苗,王子健. 生態(tài)毒理學報. 2007(01)
博士論文
[1]性別發(fā)育基因P450c17、DMY和Dmrt1的克隆、表達及選擇性剪接研究[D]. 余紅仕.武漢大學 2003
碩士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)性別分化相關基因的篩選以及兩個相關基因的表達分析[D]. 秦貞奎.中國海洋大學 2011
[2]櫛江珧繁殖生物學及人工苗種繁育技術研究[D]. 張紅云.集美大學 2010
本文編號:3207624
【文章來源】:中國海洋大學山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:59 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1 性腺發(fā)育相關基因的研究進展
1.1 脊椎動物性腺發(fā)育相關基因
1.2 無脊椎動物性腺發(fā)育相關基因
2 PHB 家族基因的研究進展
2.1 PHB 家族基因的序列特征
2.2 PHB 家族成員的功能
3 本研究的目的和意義
第二章 櫛孔扇貝性腺發(fā)育相關基因的篩選
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 工具酶、試劑盒及儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 總 RNA 的提取
1.2.2 雌雄性腺 cDNA 模板的合成
1.2.3 半定量 RT-PCR
1.2.3.1 設計 RT-PCR 引物
1.2.3.2 雌雄性腺模板量的調平
1.2.3.3 RT-PCR 分析各基因在雌雄性腺中表達的差異
2 結果與分析
2.1 總 RNA 的質量
2.2 櫛孔扇貝增殖期精卵巢差異表達序列的檢驗
3 討論
第三章 櫛孔扇貝 phb2 基因 cDNA 全長的克隆及表達
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 工具酶、試劑盒及儀器
1.2 實驗方法
1.2.1 性腺組織學切片的制備和性腺分期
1.2.2 總 RNA 提取和 cDNA 模板的合成
1.2.3 目的基因的 RACE 擴增
1.2.3.1 引物設計
1.2.3.2 RACE-Ready cDNA 的合成
1.2.3.3 RACE 擴增及序列的生物信息學分析
1.2.3.3.1 5’-RACE 擴增
1.2.3.3.2 3’-RACE 擴增
1.2.4 目的基因的全長 cDNA 獲得生物信息學分析
1.2.5 半定量 RT-PCR
1.2.6 相對定量 qRT-PCR 分析
1.2.7 原位雜交
1.2.7.1 探針的的制備
1.2.7.2 組織原位雜交
2 結果與分析
2.1 目的基因全長 cDNA 的克隆及其序列的生物信息學分析
2.2 櫛孔扇貝 phb2 基因的時空表達特征
3 討論
3.1 Cf-phb2 基因序列結構及同源性分析
3.2 Cf-phb2 基因的時空表達規(guī)律及其在精子發(fā)生中的作用
3.3 Cf-phb2 基因潛在的抑制細胞增殖的作用
總結
參考文獻
個人簡歷
待發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Foxl2基因在櫛孔扇貝發(fā)育過程中的表達圖式[J]. 劉曉玲,劉建國,王丹,張子炎,張志峰. 中國水產科學. 2013(01)
[2]單環(huán)刺螠生殖腺的發(fā)生及雌體的生殖周期[J]. 李昀,王航寧,邵明瑜,張志峰. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2012(06)
[3]櫛孔扇貝Cf-dmrt4-like基因的克隆、序列特征及表達分析[J]. 馮政夫,邵明瑜,孫大鵬,張志峰. 中國水產科學. 2010(05)
[4]Research Progress in the Structure and Functions of Prohibitin[J]. Jia-xian OU, Si-fei HUANG, Hong CHEN Department of Anatomy & Histo-Embryology, Shanghai Medical School, Fudan University, Shanghai 200032, China. Journal of Reproduction and Contraception. 2010(02)
[5]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp (Fenneropenaeus chinensis)[J]. 周倩如,邵明瑜,秦貞奎,康慶浩,張志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[6]馬氏珠母貝Dmrt5基因的克隆及時序表達模式分析[J]. 于非非,桂建芳,周莉,王梅芳,余祥勇. 水生生物學報. 2009(05)
[7]Sox基因家族功能的研究進展[J]. 江玲霞,李紀委,賀彧,李美麗,方威,李貴強,徐銀學. 生物技術通報. 2008(06)
[8]Prohibitin研究現狀與人類疾病[J]. 史雨,黃文彥,徐虹. 國際兒科學雜志. 2008 (05)
[9]哺乳動物性別決定機理與SRY基因調控性腺分化的研究進展[J]. 楊宇,馬恒東. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2007(03)
[10]稀有鮈鯽Dmrt基因家族13個成員的克隆與序列分析[J]. 張小艷,孫立偉,查金苗,王子健. 生態(tài)毒理學報. 2007(01)
博士論文
[1]性別發(fā)育基因P450c17、DMY和Dmrt1的克隆、表達及選擇性剪接研究[D]. 余紅仕.武漢大學 2003
碩士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)性別分化相關基因的篩選以及兩個相關基因的表達分析[D]. 秦貞奎.中國海洋大學 2011
[2]櫛江珧繁殖生物學及人工苗種繁育技術研究[D]. 張紅云.集美大學 2010
本文編號:3207624
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