河川沙塘鱧群體遺傳多樣性及其系統(tǒng)進化研究
發(fā)布時間:2021-05-19 06:43
河川沙塘鱧(Odontobutis potamophila)又被稱為沙塘鱧、虎頭鯊、呆子魚等。該魚作為長江中下游特色魚類,被稱為“上海世博第一魚”。目前為止,有關(guān)河川沙塘鱧的研究多集中于生物學(xué)、生理、營養(yǎng)代謝、毒理實驗等方面,而關(guān)于沙塘鱧屬魚類的種質(zhì)資源研究較少。本文采用線粒體D-loop分子標記技術(shù)并結(jié)合核基因SRAP標記研究我國河川沙塘鱧群體遺傳多樣性及5種蝦虎魚類的系統(tǒng)進化關(guān)系,在分子層次上探討其遺傳變異水平,對河川沙塘鱧種質(zhì)資源的遺傳多樣性進行評估,從而為河川沙塘鱧的遺傳多樣性監(jiān)測、不同地理群體之間的遺傳分化、物種保護及其人工繁殖等研究工作提供科學(xué)依據(jù)。本研究結(jié)果如下:1、基于線粒體D-loop基因序列研究不同群體河川沙塘鱧遺傳多樣性采用線粒體D-loop分子標記技術(shù)對河川沙塘鱧5個地理群體共150個個體(安徽省當涂(DT)30尾、江蘇省射陽(SY)30尾、江蘇省太湖東西山(DXS)30尾、浙江省余姚(YY)30尾、福建省閩江(MJ)30尾)進行遺傳多樣性分析。表明MJ群體與其他四個群體的遺傳距離(0.1186-0.1223)大于其他四個群體之間的遺傳距離(0.0015-0.0...
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 河川沙塘鱧的國內(nèi)外研究進展
1.1.1 河川沙塘鱧分布及其價值
1.1.2 河川沙塘鱧研究現(xiàn)狀
1.2 遺傳多樣性
1.2.1 表型水平
1.2.2 細胞學(xué)水平
1.2.3 生化(蛋白質(zhì))水平
1.2.4 分子水平
1.3 蝦虎魚類系統(tǒng)進化分析
1.3.1 中國常見的幾種蝦虎魚類介紹
1.3.2 中國產(chǎn)沙塘鱧屬魚類爭議
1.3.3 有關(guān)蝦虎魚系統(tǒng)進化關(guān)系
1.4 本研究內(nèi)容
1.5 本研究目的和意義
第二章 基于線粒體DNA控制區(qū)研究河川沙塘鱧的遺傳多樣性
2.1 實驗材料和方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 實驗所用試劑、儀器及其溶液配制
2.1.3 基因組DNA的提取
2.1.4 河川沙塘鱧引物的設(shè)計與合成
2.1.5 河川沙塘鱧D-loop區(qū)擴增和測序
2.1.6 實驗結(jié)果分析所用軟件
2.2 實驗結(jié)果
2.3 討論
第三章 利用SRAP分子標記研究河川沙塘鱧群體的遺傳多樣性
3.1 實驗材料和方法
3.1.1 實驗材料
3.1.2 基因組DNA提取
3.1.3 SRAP-PCR反應(yīng)
3.1.4 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 SRAP引物篩選及擴增圖譜
3.2.2 群體遺傳多樣性分析
3.2.3 群體遺傳距離和遺傳相似度
3.3 討論
第四章 基于線粒體D-loop基因序列研究我國5種蝦虎魚類的系統(tǒng)進化關(guān)系
4.1 實驗材料和方法
4.1.1 實驗材料來源
4.1.2 基因組DNA提取
4.1.3 線粒體D-loop區(qū)引物設(shè)計
4.1.4 PCR體系及反應(yīng)體系
4.1.5 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 D-loop序列及其變異
4.2.2 遺傳距離
4.2.3 系統(tǒng)樹的構(gòu)建
4.2.4 5種蝦虎魚線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)
4.3 討論
4.3.1 5種蝦虎魚類系統(tǒng)進化關(guān)系
4.3.2 5種蝦虎魚類線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)
第五章 小結(jié)
5.1 本論文結(jié)論
5.2 本論文不足之處
5.3 今后工作展望
參考文獻
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]人工配合飼料養(yǎng)殖河川沙塘鱧試驗[J]. 趙軍. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2013(02)
[2]太湖流域河川沙塘鱧線粒體12S和16S rRNA基因序列分析[J]. 郁建鋒,韓曉磊,郭倩林,徐建榮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[3]利用SRAP標記研究四個暗紋東方鲀?nèi)后w的遺傳多樣性[J]. 程長洪,張敏瑩,劉凱,徐東坡,段金榮,周彥鋒,施煒綱. 水生生物學(xué)報. 2012(05)
[4]生殖季節(jié)河川沙塘鱧雌魚親魚卵巢的脂類含量及脂肪酸組成變化[J]. 朱嘉潔,李加敏,楊崴,胡先成. 河北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(08)
[5]河川沙塘鱧的含肉率及肌肉營養(yǎng)價值分析[J]. 胡亞麗,朱曉平,尹紹武,祝斐. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[6]基于SNP分子標記的凹葉木蘭遺傳多樣性初步研究[J]. 王佳媛,吳傳芳,唐亞. 廣西植物. 2012(04)
[7]舟山小黃魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列變異的遺傳多樣性分析[J]. 鄭文娟,來育洪,尤昕煜,秦茜晗,朱世華. 動物學(xué)研究. 2012(03)
[8]云斑尖塘鱧微衛(wèi)星標記在兩種蝦虎魚亞目魚類群體間的適用性研究[J]. 祝斐,朱曉平,尹紹武,張麗娟,胡靜,侯新遠,胡亞麗. 海洋漁業(yè). 2012(02)
[9]毒死蜱(CPF)對河川沙塘鱧幼魚的急性毒性[J]. 丁正峰,薛暉,王曉豐,史陽白,李瀟軒. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(03)
[10]河川沙塘鱧的人工繁殖與集約化苗種培育技術(shù)[J]. 趙軍,盛勁東. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2011(06)
碩士論文
[1]河川沙塘鱧(Odontobutis potamophila)雌魚親魚營養(yǎng)代謝研究[D]. 朱嘉潔.重慶師范大學(xué) 2013
[2]基于線粒體DNA序列和微衛(wèi)星標記分析波紋唇魚不同地理群體的遺傳多樣性及遺傳分化[D]. 胡靜.海南大學(xué) 2012
[3]云斑尖塘鱧微衛(wèi)星分子標記的開發(fā)與初步應(yīng)用[D]. 朱曉平.海南大學(xué) 2012
[4]2種蝦虎魚線粒體cytb及CR基因克隆及序列分析[D]. 相瑜.浙江海洋學(xué)院 2012
[5]烏蘇里擬鲿(Pseudobagrus ussuriensis)不同群體間的遺傳多樣性比較研究[D]. 徐汗福.蘇州大學(xué) 2011
[6]大麻哈魚SRAP體系建立及其遺傳多樣性研究[D]. 張慧.東北林業(yè)大學(xué) 2011
[7]線紋尖塘鱧和云斑尖塘鱧的遺傳多樣性研究[D]. 陳建華.廣東海洋大學(xué) 2010
[8]河川沙塘鱧細胞培養(yǎng)及胚胎發(fā)育研究[D]. 張君.蘇州大學(xué) 2010
[9]黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)SRAP遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. 辛文婷.東北林業(yè)大學(xué) 2009
[10]基于形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)資料探討中國沿海10種蝦虎魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[D]. 孫希福.中國海洋大學(xué) 2009
本文編號:3195316
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 河川沙塘鱧的國內(nèi)外研究進展
1.1.1 河川沙塘鱧分布及其價值
1.1.2 河川沙塘鱧研究現(xiàn)狀
1.2 遺傳多樣性
1.2.1 表型水平
1.2.2 細胞學(xué)水平
1.2.3 生化(蛋白質(zhì))水平
1.2.4 分子水平
1.3 蝦虎魚類系統(tǒng)進化分析
1.3.1 中國常見的幾種蝦虎魚類介紹
1.3.2 中國產(chǎn)沙塘鱧屬魚類爭議
1.3.3 有關(guān)蝦虎魚系統(tǒng)進化關(guān)系
1.4 本研究內(nèi)容
1.5 本研究目的和意義
第二章 基于線粒體DNA控制區(qū)研究河川沙塘鱧的遺傳多樣性
2.1 實驗材料和方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 實驗所用試劑、儀器及其溶液配制
2.1.3 基因組DNA的提取
2.1.4 河川沙塘鱧引物的設(shè)計與合成
2.1.5 河川沙塘鱧D-loop區(qū)擴增和測序
2.1.6 實驗結(jié)果分析所用軟件
2.2 實驗結(jié)果
2.3 討論
第三章 利用SRAP分子標記研究河川沙塘鱧群體的遺傳多樣性
3.1 實驗材料和方法
3.1.1 實驗材料
3.1.2 基因組DNA提取
3.1.3 SRAP-PCR反應(yīng)
3.1.4 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 SRAP引物篩選及擴增圖譜
3.2.2 群體遺傳多樣性分析
3.2.3 群體遺傳距離和遺傳相似度
3.3 討論
第四章 基于線粒體D-loop基因序列研究我國5種蝦虎魚類的系統(tǒng)進化關(guān)系
4.1 實驗材料和方法
4.1.1 實驗材料來源
4.1.2 基因組DNA提取
4.1.3 線粒體D-loop區(qū)引物設(shè)計
4.1.4 PCR體系及反應(yīng)體系
4.1.5 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 D-loop序列及其變異
4.2.2 遺傳距離
4.2.3 系統(tǒng)樹的構(gòu)建
4.2.4 5種蝦虎魚線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)
4.3 討論
4.3.1 5種蝦虎魚類系統(tǒng)進化關(guān)系
4.3.2 5種蝦虎魚類線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)
第五章 小結(jié)
5.1 本論文結(jié)論
5.2 本論文不足之處
5.3 今后工作展望
參考文獻
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]人工配合飼料養(yǎng)殖河川沙塘鱧試驗[J]. 趙軍. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2013(02)
[2]太湖流域河川沙塘鱧線粒體12S和16S rRNA基因序列分析[J]. 郁建鋒,韓曉磊,郭倩林,徐建榮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[3]利用SRAP標記研究四個暗紋東方鲀?nèi)后w的遺傳多樣性[J]. 程長洪,張敏瑩,劉凱,徐東坡,段金榮,周彥鋒,施煒綱. 水生生物學(xué)報. 2012(05)
[4]生殖季節(jié)河川沙塘鱧雌魚親魚卵巢的脂類含量及脂肪酸組成變化[J]. 朱嘉潔,李加敏,楊崴,胡先成. 河北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(08)
[5]河川沙塘鱧的含肉率及肌肉營養(yǎng)價值分析[J]. 胡亞麗,朱曉平,尹紹武,祝斐. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[6]基于SNP分子標記的凹葉木蘭遺傳多樣性初步研究[J]. 王佳媛,吳傳芳,唐亞. 廣西植物. 2012(04)
[7]舟山小黃魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列變異的遺傳多樣性分析[J]. 鄭文娟,來育洪,尤昕煜,秦茜晗,朱世華. 動物學(xué)研究. 2012(03)
[8]云斑尖塘鱧微衛(wèi)星標記在兩種蝦虎魚亞目魚類群體間的適用性研究[J]. 祝斐,朱曉平,尹紹武,張麗娟,胡靜,侯新遠,胡亞麗. 海洋漁業(yè). 2012(02)
[9]毒死蜱(CPF)對河川沙塘鱧幼魚的急性毒性[J]. 丁正峰,薛暉,王曉豐,史陽白,李瀟軒. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(03)
[10]河川沙塘鱧的人工繁殖與集約化苗種培育技術(shù)[J]. 趙軍,盛勁東. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2011(06)
碩士論文
[1]河川沙塘鱧(Odontobutis potamophila)雌魚親魚營養(yǎng)代謝研究[D]. 朱嘉潔.重慶師范大學(xué) 2013
[2]基于線粒體DNA序列和微衛(wèi)星標記分析波紋唇魚不同地理群體的遺傳多樣性及遺傳分化[D]. 胡靜.海南大學(xué) 2012
[3]云斑尖塘鱧微衛(wèi)星分子標記的開發(fā)與初步應(yīng)用[D]. 朱曉平.海南大學(xué) 2012
[4]2種蝦虎魚線粒體cytb及CR基因克隆及序列分析[D]. 相瑜.浙江海洋學(xué)院 2012
[5]烏蘇里擬鲿(Pseudobagrus ussuriensis)不同群體間的遺傳多樣性比較研究[D]. 徐汗福.蘇州大學(xué) 2011
[6]大麻哈魚SRAP體系建立及其遺傳多樣性研究[D]. 張慧.東北林業(yè)大學(xué) 2011
[7]線紋尖塘鱧和云斑尖塘鱧的遺傳多樣性研究[D]. 陳建華.廣東海洋大學(xué) 2010
[8]河川沙塘鱧細胞培養(yǎng)及胚胎發(fā)育研究[D]. 張君.蘇州大學(xué) 2010
[9]黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)SRAP遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. 辛文婷.東北林業(yè)大學(xué) 2009
[10]基于形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)資料探討中國沿海10種蝦虎魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[D]. 孫希福.中國海洋大學(xué) 2009
本文編號:3195316
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