刺參（Apostichopus japonicus）屬于海參綱（Holothuroidea）、仿刺參屬（Apostichopus），是我國北方主要的食用海參，具有較高的食用、保健和藥用價值，被譽為“海味八珍”之首。由于需求量巨大，近幾年，刺參養(yǎng)殖業(yè)在山東和遼寧大力發(fā)展，刺參已成為我國北方大部分地區(qū)主要的海水養(yǎng)殖種類，取得了巨大的經(jīng)濟(jì)價值和社會價值。益生菌已經(jīng)在水產(chǎn)養(yǎng)殖中得到廣泛的應(yīng)用。本研究分析了刺參消化道內(nèi)含物及其周圍環(huán)境沉積物中的微生物組成，并對刺參消化道中菌群的產(chǎn)酶功能進(jìn)行了研究，為研發(fā)刺參養(yǎng)殖專用益生菌提供了理論依據(jù)。利用16S rDNA454高通量測序技術(shù)對刺參前腸、后腸內(nèi)含物及周圍沉積物中細(xì)菌組成進(jìn)行了研究。從10個腸道內(nèi)含物樣品和4個沉積物樣品中共獲得了188,623個優(yōu)化序列和15,527個OTUs。前腸和后腸內(nèi)含物以及周圍沉積物中的細(xì)菌分別可以歸為38.0±4.7、31.2±6.2和27.8±6.5個綱。刺參周圍沉積物中細(xì)菌的豐度及Shannon多樣性指數(shù)均高于刺參腸道。變形菌門（Proteobacteria）在刺參消化道內(nèi)含物和周圍沉積物中均占優(yōu)勢。前腸、后腸以及沉... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文答辯委員會成員名單
摘要
ABSTRACT
目錄
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 腸道微生物與宿主的關(guān)系
        1.1 腸道中微生物的作用
    2 腸道微生物研究方法
        2.1 傳統(tǒng)培養(yǎng)方法
        2.2 現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)
    3 刺參腸道微生物研究進(jìn)展
        3.1 刺參腸道微生物組成和多樣性研究
        3.2 影響刺參腸道微生物組成的因素
            3.2.1 季節(jié)變化對刺參腸道微生物的影響
            3.2.2 飼料添加劑與微生態(tài)制劑對刺參腸道微生物的影響
        3.3 刺參腸道微生物功能研究現(xiàn)狀
            3.3.1 產(chǎn)生消化酶
            3.3.2 抑菌作用
    4、益生菌在水產(chǎn)養(yǎng)殖中的應(yīng)用
    5 本研究的目的和意義
第二章 利用 16S rDNA 高通量測序技術(shù)對刺參腸道內(nèi)含物及周圍沉積物微生物組成的研究
    1 材料與方法
        1.1 樣品采集
        1.2 DNA 提取
        1.3 序列片段擴(kuò)增
        1.4 454 高通量測序
        1.5 數(shù)據(jù)及生物信息學(xué)分析
    2 實驗結(jié)果
        2.1 豐富度和多樣性分析
        2.2 刺參腸道內(nèi)含物和周圍沉積物中微生物組成
        2.3 刺參腸道內(nèi)含物和周圍沉積物中微生物組成的關(guān)系
    3 討論
    4、結(jié)論
第三章 刺參腸道產(chǎn)酶微生物的分離鑒定及產(chǎn)酶能力分析
    1 材料與方法
        1.1 樣品采集
        1.2 培養(yǎng)基
        1.3 微生物培養(yǎng)
        1.4 產(chǎn)酶微生物的篩選
            1.4.1 產(chǎn)淀粉酶微生物的篩選
            1.4.2 產(chǎn)纖維素酶微生物的篩選
            1.4.3 產(chǎn)蛋白酶微生物的篩選
        1.5 產(chǎn)酶微生物的分子生物學(xué)鑒定
            1.5.1 產(chǎn)酶微生物的 DNA 提取和 16S rDNA 擴(kuò)增
            1.5.2 限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）分析
        1.6 產(chǎn)酶微生物產(chǎn)酶能力分析
    2 實驗結(jié)果
        2.1 產(chǎn)酶微生物的分離與鑒定
        2.2 16S rDNA 擴(kuò)增結(jié)果
        2.3 限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）分析
        2.4 16S rDNA 測序和系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.5 刺參腸道產(chǎn)酶能力分析
    3 討論
    4 結(jié)論
第四章 刺參腸道微生物產(chǎn)胞外酶活性及抑菌活性研究
    1 材料與方法
        1.1 產(chǎn)酶菌株
        1.2 病原菌
        1.3 培養(yǎng)基
        1.4 粗酶液的制備
        1.5 產(chǎn)酶微生物產(chǎn)生的胞外酶活性測定
            1.5.1 蛋白酶活性的測定
            1.5.2 淀粉酶活性的測定
            1.5.3 纖維素酶活性的測定
        1.6 產(chǎn)酶微生物抑菌活性分析
    2 結(jié)果
        2.1 分離產(chǎn)酶菌株產(chǎn)酶活力測定
        2.2 產(chǎn)酶菌株體外抑菌實驗
    3 討論
    4 小結(jié)
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Bacterial Diversity of Gut Content in Sea Cucumber（Apostichopus japonicus） and Its Habitat Surface Sediment[J]. GAO Fei,TAN Jie,SUN Huiling,YAN Jingping.  Journal of Ocean University of China. 2014(02)
[2]羅非魚養(yǎng)殖系統(tǒng)中產(chǎn)淀粉酶菌株的篩選和鑒定[J]. 丁彥文,袁翠霖,李卓佳,楊鶯鶯,林小濤.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(18)
[3]用于PCR擴(kuò)增的細(xì)菌DNA提取方法比較[J]. 馮廣達(dá),陳美標(biāo),羊宋貞,朱紅惠.  華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(03)
[4]復(fù)合益生菌對草魚養(yǎng)殖水體水質(zhì)和菌群結(jié)構(gòu)的影響[J]. 鄭佳佳,彭麗莎,張小平,孫健棟,傅羅琴,王一冰,胡彩虹,李衛(wèi)芬.  水產(chǎn)學(xué)報. 2013(03)
[5]刺參腸道潛在產(chǎn)酶益生菌的篩選和鑒定[J]. 楊志平,孫飛雪,劉志明,張磊,曹為,馬悅欣.  大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2013(01)
[6]仿刺參相關(guān)微生物對致病燦爛弧菌的拮抗及機(jī)理研究[J]. 李虹宇,張公亮,侯紅漫,葛靜慧,孫名一.  食品工業(yè). 2012(09)
[7]仿刺參腸道可培養(yǎng)微生物多樣性研究[J]. 張文姬,侯紅漫,張公亮,李琴艷,杜晨萌.  食品工業(yè)科技. 2011(09)
[8]柞蠶腸道菌群分析及產(chǎn)酶菌的篩選與鑒定[J]. 鄒昌瑞,魏國清,劉朝良,朱保建,王在貴,楊文靜.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(12)
[9]來自大黃魚（Pseudosciaena crocea）腸道的弧菌拮抗菌的篩選與鑒定[J]. 王娟,封永輝,蔡立勝,王建,曲憲成,張慶華.  海洋與湖沼. 2010(05)
[10]益生菌的應(yīng)用對鰻鱺池塘水質(zhì)變化的影響[J]. 石和榮,林敏,馬江耀,杜君裕,蔡秩強.  水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2010(09)

碩士論文
[1]幾種微生態(tài)制劑對刺參（Apostichopus japonicus）養(yǎng)殖水體及刺參腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響[D]. 陽鋼.中國海洋大學(xué) 2012
[2]酶解海藻產(chǎn)物對刺參（Apostichopus japonicus）腸道菌群和免疫相關(guān)因子的影響[D]. 杜以帥.中國海洋大學(xué) 2010



本文編號：3165470