錢塘江三角魴線粒體基因組測序及其結(jié)構(gòu)特征分析
發(fā)布時間:2021-04-21 13:50
為了研究錢塘江流域三角魴(Megalobrama terminalis Richardson)線粒體基因組結(jié)構(gòu)特征及鲌亞科魚類的系統(tǒng)進化關(guān)系,通過PCR擴增、測序、軟件拼接獲得了錢塘江三角魴線粒體基因組全序列,GenBank登錄號為MN725725。結(jié)果表明,錢塘江三角魴線粒體基因組序列全長為16 621 bp,堿基組成分別為A(31.23%)、G(16.17%)、C(27.87%)和T(24.73%);共有13個蛋白編碼基因,22個tRNA基因,2個rRNA基因,NAD6、tRNA-Gln、tRNA-Ala、tRNA-Asn、tRNA-Cys、tRNA-Tyr、tRNA-Ser(UCN)、tRNA-Glu和tRNA-Pro等基因編碼在L鏈上,其余基因均在H鏈上編碼。錢塘江三角魴線粒體基因組全序列與蛋白編碼基因的A+T含量分別為55.97%和55.86%,具有明顯的AT偏好性。線粒體基因中存在2個散在重復序列,分別位于線粒體控制區(qū)中終止結(jié)合序列區(qū)的前端和控制區(qū)3′的末端。在22個tRNA基因中,除了tRNA-Ser(AGY)外,均具有典型的三...
【文章來源】:浙江農(nóng)業(yè)學報. 2020,32(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:18 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料及DNA提取
1.2 基因測序
1.3 序列拼接與分析
1.4 系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)與組成
2.2 rRNA與tRNA編碼基因結(jié)構(gòu)特征
2.3 非編碼區(qū)
2.4 蛋白編碼基因
2.5 不同流域三角魴線粒體基因組比較
2.6 線粒體基因組系統(tǒng)進化分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃條鰤線粒體全基因組測序及結(jié)構(gòu)特征分析[J]. 史寶,柳學周,劉永山,張言祥,高全義,徐永江,王濱,姜燕,宋雪松. 中國水產(chǎn)科學. 2019(03)
[2]魚類線粒體基因組研究進展[J]. 周傳江,馬愛喆,汪曦,楊長幸,李箏,張常青,朱國超,顧錢洪. 河南師范大學學報(自然科學版). 2019(02)
[3]太平洋鱈線粒體全基因組測序及結(jié)構(gòu)特征分析[J]. 毛明光,顧杰,劉瑞婷,陳雨,吳玲梅,姜志強,蔣潔蘭. 水生生物學報. 2019(01)
[4]基于第二代測序技術(shù)蘭州鲇線粒體基因組全序列測定與分析[J]. 連總強,滾雙寶,李力,張鋒,肖偉,吳旭東. 水生生物學報. 2017(02)
[5]黃鯽線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)及長度多態(tài)性分析[J]. 蔡珊珊,徐勝勇,宋娜,高天翔,張朝暉. 水生生物學報. 2014(05)
[6]不同鳊魴屬魚類群體的形態(tài)差異分析[J]. 陳杰,李福貴,黃創(chuàng)新,蔣霞云,鄒曙明. 上海海洋大學學報. 2014(03)
[7]不同鳊魴魚類群體微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 張倩倩,陳杰,蔣霞云,鄒曙明. 水產(chǎn)學報. 2014(01)
[8]魴屬魚類線粒體基因組的比較及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 賴瑞芳,張秀杰,李艷和,吳俊頡,楊東輝,王衛(wèi)民. 水產(chǎn)學報. 2014(01)
[9]RNA二級結(jié)構(gòu)預測及其在分子分類研究中的應用[J]. 楊澤民,謝數(shù)濤,章群,張俊彬. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2012(07)
[10]魴屬魚類細胞色素b片段序列分析[J]. 謝楠,劉新軼,馮曉宇,郭水榮. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(01)
本文編號:3151874
【文章來源】:浙江農(nóng)業(yè)學報. 2020,32(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:18 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料及DNA提取
1.2 基因測序
1.3 序列拼接與分析
1.4 系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)與組成
2.2 rRNA與tRNA編碼基因結(jié)構(gòu)特征
2.3 非編碼區(qū)
2.4 蛋白編碼基因
2.5 不同流域三角魴線粒體基因組比較
2.6 線粒體基因組系統(tǒng)進化分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃條鰤線粒體全基因組測序及結(jié)構(gòu)特征分析[J]. 史寶,柳學周,劉永山,張言祥,高全義,徐永江,王濱,姜燕,宋雪松. 中國水產(chǎn)科學. 2019(03)
[2]魚類線粒體基因組研究進展[J]. 周傳江,馬愛喆,汪曦,楊長幸,李箏,張常青,朱國超,顧錢洪. 河南師范大學學報(自然科學版). 2019(02)
[3]太平洋鱈線粒體全基因組測序及結(jié)構(gòu)特征分析[J]. 毛明光,顧杰,劉瑞婷,陳雨,吳玲梅,姜志強,蔣潔蘭. 水生生物學報. 2019(01)
[4]基于第二代測序技術(shù)蘭州鲇線粒體基因組全序列測定與分析[J]. 連總強,滾雙寶,李力,張鋒,肖偉,吳旭東. 水生生物學報. 2017(02)
[5]黃鯽線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)及長度多態(tài)性分析[J]. 蔡珊珊,徐勝勇,宋娜,高天翔,張朝暉. 水生生物學報. 2014(05)
[6]不同鳊魴屬魚類群體的形態(tài)差異分析[J]. 陳杰,李福貴,黃創(chuàng)新,蔣霞云,鄒曙明. 上海海洋大學學報. 2014(03)
[7]不同鳊魴魚類群體微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 張倩倩,陳杰,蔣霞云,鄒曙明. 水產(chǎn)學報. 2014(01)
[8]魴屬魚類線粒體基因組的比較及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 賴瑞芳,張秀杰,李艷和,吳俊頡,楊東輝,王衛(wèi)民. 水產(chǎn)學報. 2014(01)
[9]RNA二級結(jié)構(gòu)預測及其在分子分類研究中的應用[J]. 楊澤民,謝數(shù)濤,章群,張俊彬. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2012(07)
[10]魴屬魚類細胞色素b片段序列分析[J]. 謝楠,劉新軼,馮曉宇,郭水榮. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(01)
本文編號:3151874
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