克氏原螯蝦（Procambarus clarkii）是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)甲殼類(lèi)之一，江蘇省是我國(guó)克氏原螯蝦的主要養(yǎng)殖省份之一。克氏原螯蝦種質(zhì)資源的研究對(duì)其保護(hù)和利用、提高養(yǎng)殖產(chǎn)量、良種選育等具有重要意義。本研究共收集了江蘇9個(gè)克氏原螯蝦天然群體（太湖群體3個(gè)、洪澤湖群體3個(gè)、駱馬湖群體1個(gè)、固城湖群體1個(gè)，長(zhǎng)江江心鎮(zhèn)群體1個(gè)）與1個(gè)克氏原螯蝦圈養(yǎng)群體（盱眙滿(mǎn)江紅群體）。開(kāi)發(fā)了12個(gè)克氏原螯蝦的EST-SSR標(biāo)記，分析了這些克氏原螯蝦群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)，主要內(nèi)容如下：1.克氏原螯蝦EST-SSR標(biāo)記篩選與分析篩選出12個(gè)克氏原螯蝦微衛(wèi)星標(biāo)記，對(duì)60個(gè)克氏原螯蝦基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增并分析其多態(tài)性水平，結(jié)果顯示：12對(duì)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因數(shù)在3⁹之間，平均觀測(cè)雜合度為0.556，平均期望雜合度值為0.745。經(jīng)Bonferroni校正后，12個(gè)位點(diǎn)均偏離Hardy-Weinberg平衡，多態(tài)信息含量（PIC）介于0.509⁰.875之間，所有位點(diǎn)均為高度多態(tài)位點(diǎn)，可較好地分析遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性，這些標(biāo)記用于克氏原螯蝦遺傳多樣性分析效果較... 

【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：50 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

克氏原螯蝦基因組DNA電泳圖

10圖 2-2 引物 PCSH0007、 PCSH0036、PCSH0038、PCSH0065、PCSH0077 擴(kuò)增的電泳圖譜Fig.4-2 Electrophoretogram of PCSH0007， PCSH0036， PCSH0038，PCSH0065， PCSH0077 locus

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文雜合度為 0.101~0.875，期望雜合度為 0.286~0.850，多態(tài)信息含量為 0.253~0.875。3 個(gè)群體中，江心鎮(zhèn)群體平均等位基因數(shù)最大(A=5.125)，盱眙群體最小(A=4.5)；江心鎮(zhèn)群體平均有效等位基因數(shù)最大(Ne=3.83)，盱眙群體最小(Ne=2.56)；江心鎮(zhèn)群體平均觀測(cè)雜合度(Ho=0.453)最大，西順河群體最小(Ho=0.581)；江心鎮(zhèn)群體平均期望雜合度(Ho=0.743)最大，盱眙群體最小(Ho=0.607)；多態(tài)信息含量均值以江心鎮(zhèn)群體為最高(PIC=0.608)；盱眙群體最低 (PIC=0.523)；西順河群體在兩者之間(PIC=0.545)。顯著性標(biāo)準(zhǔn)經(jīng) Bonferroni 校正后，利用 Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)對(duì) 3 個(gè)群體中所有 24 個(gè)位點(diǎn)基因平衡狀態(tài)進(jìn)行檢驗(yàn)，除西順河群體外的 PCSH0052，3 個(gè)群體的其余 23 個(gè)位點(diǎn)經(jīng)均偏離 Hardy-Weinberg 平衡此外，除盱眙群體的 PCSH0054位點(diǎn)外，其余位點(diǎn)組合均表現(xiàn)為雜合子缺失。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]24個(gè)泥蚶EST-SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)與分析[J]. 史松富,姚韓韓,林志華,周小龍,齊曉艷,董迎輝.  海洋科學(xué). 2013(08)
[2]翹嘴鱖養(yǎng)殖與野生群體及其家系的遺傳多樣性分析[J]. 楊凱,高銀愛(ài),丹成,曾可為,王青云,朱思華,夏儒龍,鄭翠華,羅峰,程穎紅,王輝,李波.  淡水漁業(yè). 2013(03)
[3]基于公共數(shù)據(jù)庫(kù)牙鲆EST-SSR的開(kāi)發(fā)及特征分析[J]. 劉奕,陳偉興,周丹,陳曉婷,王美玉,王桂興,劉海金.  海洋漁業(yè). 2013(02)
[4]泥蚶（Tegillarca granosa）基因組SSR和EST-SSR的開(kāi)發(fā)及比較研究[J]. 周小龍,朱靖華,董迎輝,林志華,富凱立,姚韓韓,齊曉艷.  海洋與湖沼. 2013(02)
[5]中華絨螯蟹國(guó)內(nèi)外群體遺傳變異與適應(yīng)性進(jìn)化分析[J]. 成起萱,周陸,王成輝.  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(02)
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[7]不同地區(qū)克氏原螯蝦遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 宋亮,韓曉磊,夏嬋,戴偉,張建平,葉元土,徐建榮.  江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(02)
[8]淮河安徽段日本沼蝦野生群體遺傳結(jié)構(gòu)的微衛(wèi)星分析[J]. 姜虎成,馮建彬,丁懷宇,汪桂玲,李家樂(lè).  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(02)
[9]我國(guó)克氏原螯蝦的進(jìn)出口貿(mào)易實(shí)證分析與研究[J]. 王慧慧,董彥嶺,蘇昕,李振興.  中國(guó)漁業(yè)經(jīng)濟(jì). 2012(01)
[10]長(zhǎng)江中下游地區(qū)6個(gè)克氏原螯蝦群體遺傳多樣性分析[J]. 黃羽,戴銀根,畢成武,胡成鈺.  南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(工科版). 2011(03)

博士論文
[1]基于EST數(shù)據(jù)庫(kù)和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的茶樹(shù)DNA分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)與應(yīng)用研究[D]. 王麗鴛.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[2]中國(guó)主要出口蝦類(lèi)的分子鑒定標(biāo)記研究[D]. 吳志剛.浙江工商大學(xué) 2010
[3]中國(guó)沼蝦屬分子系統(tǒng)學(xué)及日本沼蝦群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 楊頻.華東師范大學(xué) 2007

碩士論文
[1]泥蚶微衛(wèi)星分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用及生長(zhǎng)相關(guān)基因HDAC1的克隆[D]. 周小龍.上海海洋大學(xué) 2013
[2]鄱陽(yáng)湖流域克氏原螯蝦的資源狀況及長(zhǎng)江中下游克氏原螯蝦遺傳多樣性研究[D]. 黃羽.南昌大學(xué) 2012
[3]淮河流域日本沼蝦野生群體分子遺傳多樣性及系統(tǒng)演化分析[D]. 姜虎成.上海海洋大學(xué) 2012
[4]脊尾白蝦微衛(wèi)星引物篩選及群體遺傳多樣性分析[D]. 賈舒雯.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
[5]克氏原螯蝦（Procambarus clarkii）性選擇及遺傳多樣性研究[D]. 宋亮.蘇州大學(xué) 2012
[6]絨螯蟹的分子遺傳變異與進(jìn)化[D]. 成起萱.上海海洋大學(xué) 2011
[7]紅螯螯蝦（Cherax quadricarinatus）微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及群體遺傳學(xué)分析[D]. 謝雁南.華東師范大學(xué) 2011
[8]基于微衛(wèi)星標(biāo)記的克氏原螯蝦遺傳多樣性研究[D]. 曹玲亮.安徽大學(xué) 2010
[9]長(zhǎng)江中下游地區(qū)克氏原螯蝦群體遺傳多樣性分析[D]. 王長(zhǎng)忠.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[10]用線粒體分子標(biāo)記探討中國(guó)大陸絨螯蟹種群遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 張代臻.南京師范大學(xué) 2006



本文編號(hào)：3141730