近年來,隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的迅速發(fā)展,多品種混合養(yǎng)殖逐漸成為一種新興的養(yǎng)殖模式,其能夠改善長期單品種、高密度養(yǎng)殖帶來的水質(zhì)惡化、生長緩慢和病害多發(fā)等問題。微生物與水質(zhì)管理、飼料營養(yǎng)、病害防控等方面密切相關(guān),在混養(yǎng)生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮非常重要的作用。本研究采集“蝦貝混養(yǎng)”池塘中深泥（底泥表層以下20cm）、淺泥（底泥表層）、牡蠣、對蝦、浮游生物和水體共6種組分,利用16S和18S通用引物擴(kuò)增樣品中原核和真核微生物,構(gòu)建PCR文庫,進(jìn)行高通量測序,并對測序得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。為了研究混養(yǎng)環(huán)境中微生物多樣性,本研究采用了多種分析工具和方法,得到結(jié)果如下:1、凡納濱對蝦（Litopenaeus vannamei）和香港牡蠣（Crassostrea hongkongensis）體內(nèi)真核微生物研究方法的建立——用于抑制對蝦和牡蠣18S rDNA序列特異性擴(kuò)增的探針（blocking primer）的開發(fā):針對對蝦設(shè)計(jì)的阻斷探針（X-BP2-DPO）是一條可靠、簡便、高效的用于抑制對蝦和牡蠣宿主18S rDNA序列擴(kuò)增的修飾引物序列。X-BP2-DPO對于對蝦宿主18S rDNA基因擴(kuò)增抑制率高... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

（A—E）多物種 18S rDNA 序列比對

圖 2-3 不同濃度的針對對蝦宿主的阻斷探針對于對蝦（A）、真核微生物（B）、浮游動(dòng)物（C）序列擴(kuò)增的抑制效果。分別用濃度為 0.4 μM、0.8 μM、1.6 μM 的 6 種阻斷探針擴(kuò)增對蝦樣品（3 個(gè)不同的對蝦樣品）。抑制效果較好的探針用紅色矩形標(biāo)記。Fig. 2-3 Inhibitory effects of blocking primers at varying concentrations against shrimp sequenceamplification (A), eukaryotic microorganisms (B), zooplankton (C) templates. Samples wereamplified with six different blocking primers at concentrations of 0.4 μM, 0.8 μM, and 1.6 μM.

圖 2-4 不同濃度的針對對蝦宿主的阻斷探針對于牡蠣序列擴(kuò)增的抑制效果。Fig. 2-4 Inhibitory effects of the blocking primers against shrimp on oyster DNAamplification atvarious concentrations.


本文編號(hào)：3134851