鑒定保護(hù)單元對(duì)于瀕危物種的監(jiān)測(cè)和管理至關(guān)重要。群體的遺傳特征,包括群體遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性水平、基因交流、本地適應(yīng)性等,是保護(hù)單元制定的重要理論依據(jù)。遺傳多樣性是物種維持進(jìn)化潛力的重要因素。本文的研究對(duì)象松江鱸（Trachidermus fasciatus）隸屬于鲉形目、杜父魚科、松江鱸屬,是一種小型底棲降海產(chǎn)卵洄游性魚類。受人類活動(dòng)的影響,如修建水壩、過度捕撈、環(huán)境污染、產(chǎn)卵場(chǎng)破壞等,目前松江鱸群體數(shù)量已大大減少,其棲息地已呈片段化分布。鑒于此原因并考慮到其文化、生態(tài)及進(jìn)化學(xué)上的價(jià)值,在1988年中國(guó)政府將其列為國(guó)家二級(jí)保護(hù)動(dòng)物。闡明群體遺傳特征對(duì)于松江鱸保護(hù)措施的制定和實(shí)施具有重要意義,但是目前關(guān)于松江鱸保護(hù)遺傳學(xué)和群體遺傳學(xué)方面的研究仍然存在分歧,特別是關(guān)于中國(guó)松江鱸群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究結(jié)果并不清晰,更是缺乏基因組方面的研究,極大地限制了其管理和保護(hù)工作。本文采用了多態(tài)性的微衛(wèi)星分子標(biāo)記和更高分辨率的群體基因組學(xué)手段對(duì)松江鱸群體系統(tǒng)地開展了保護(hù)遺傳學(xué)研究,以期為其保護(hù)單元的劃分提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1、采用磁珠富集法開發(fā)了25個(gè)松江鱸高多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)。選取富陽(yáng)群體24個(gè)... 

【文章來源】：中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：137 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

磁珠富集法流程圖（Kantartzi，2013）

圖 1.2 三引物熒光標(biāo)記法擴(kuò)增原理（Schuelke，2000）Fig. 1.2 Amplification scheme for tailed PCR（Schuelke，2000）微衛(wèi)星的出現(xiàn)和應(yīng)用促使了保護(hù)遺傳學(xué)的革新。高度多態(tài)的（通常具有多個(gè)等位基因）微衛(wèi)星標(biāo)記更適合用于瓶頸效應(yīng)（bottleneck）的檢測(cè)，近交衰退及有效群體大小的估計(jì)等。微衛(wèi)星標(biāo)記亦可用于個(gè)體的歸群（assignment）分析，從而可檢測(cè)群體間個(gè)體的擴(kuò)散情況（Berryetal.，2004）、追溯個(gè)體的來源（Roqueset al.，1999）、入侵生物學(xué)分析（Gotzek et al.，2015）以及親緣關(guān)系的鑒定（Quelleret al.，1993）等。大部分的微衛(wèi)星位于基因組的非編碼區(qū)域內(nèi)，主要存在于基因間區(qū)域或基因內(nèi)含子區(qū)域，通常被認(rèn)為在選擇上處于中性（Ellegren，2004）。因此微衛(wèi)星標(biāo)記常常被應(yīng)用于管理單元的劃分等保護(hù)遺傳學(xué)研究中（Moritz，1999）。隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，越來越多基于高通量測(cè)序技術(shù)的微衛(wèi)星開發(fā)手段

松江鱸遺傳標(biāo)記開發(fā)與保護(hù)遺傳學(xué)研究位點(diǎn)關(guān)聯(lián)的序列進(jìn)行測(cè)序（亦稱為 RAD-tag過隨機(jī)打斷（如利用超聲波）后進(jìn)行選擇，故統(tǒng)的 RAD-seq 主要步驟包括：限制性內(nèi)切酶標(biāo)簽用以區(qū)分個(gè)體），混樣，隨機(jī)打斷，片集，上機(jī)測(cè)序。傳統(tǒng) RAD 文庫(kù)構(gòu)建流程如圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]松江鱸（Trachidermus fasciatus）種群的形態(tài)學(xué)與遺傳學(xué)研究[D]. 畢瀟瀟.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[2]玉筋魚和松江鱸微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及群體遺傳學(xué)研究[D]. 任桂靜.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
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本文編號(hào)：3105199