為研究石鯛科中斑石鯛和條石鯛線粒體基因編碼序列密碼子的使用模式和特性,進(jìn)而探討這2種魚(yú)與其他水生動(dòng)物的親緣關(guān)系,以期為探討2種魚(yú)類間的近緣雜交育種、種質(zhì)資源等研究提供理論依據(jù)。在美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索并下載斑石鯛、條石鯛、斑馬魚(yú)、金鼓魚(yú)、黑鯛和真鯛6種魚(yú)線粒體基因序列,以CodonW、SPSS等軟件采用生物信息學(xué)方法對(duì)斑石鯛和條石鯛線粒體DNA編碼蛋白質(zhì)的基因序列進(jìn)行分析,通過(guò)相對(duì)密碼子使用度以及對(duì)密碼子的偏好性和基因序列進(jìn)行相關(guān)性和聚類分析,進(jìn)而探討其親緣關(guān)系。研究結(jié)果表明,斑石鯛和條石鯛線粒體DNA編碼蛋白質(zhì)的基因偏愛(ài)使用AC結(jié)尾的密碼子,UUC、ACC等密碼子為斑石鯛和條石鯛線粒體DNA編碼蛋白質(zhì)基因的偏好性密碼子。在基因序列及偏好密碼子聚類中,斑石鯛與條石鯛、黑鯛與真鯛均首先聚為一類,親緣關(guān)系最近,這與傳統(tǒng)分類學(xué)一致;斑石鯛和條石鯛與斑馬魚(yú)的遺傳距離最遠(yuǎn),親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。 

【文章來(lái)源】：水產(chǎn)科學(xué). 2020,39(05)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

斑石鯛和條石鯛各種氨基酸含量

斑石鯛和條石鯛線粒體編碼蛋白序列的因子相關(guān)性分析

斑石鯛、條石鯛與其他物種的mtDNA編碼蛋白質(zhì)的基因密碼子偏好性聚類

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]4月齡條石鯛形態(tài)性狀對(duì)體質(zhì)量的影響效果分析[J]. 黃偉卿,周瑞發(fā),謝友亮,周紹峰,夏道演,張藝,陳仕璽.  水產(chǎn)科學(xué). 2015(08)
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碩士論文
[1]小鯢科線粒體基因組密碼子偏好性及進(jìn)化關(guān)系的分析[D]. 姜艷.陜西師范大學(xué) 2016
[2]斑石鯛（Oplegnathus punctatus）早期生長(zhǎng)特征及消化系統(tǒng)發(fā)育的研究[D]. 王雨福.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2015



本文編號(hào)：3079208