金錢魚MHCⅠ類基因結(jié)構(gòu)、多態(tài)性與組織表達(dá)分析及其線粒體基因組全序列分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-11 05:50
以金錢魚為對象,利用RACE-PCR技術(shù),克隆獲得其主要組織相容性復(fù)合體I類α基因(Major histocompatibility complex,MHC I α)和β2m微球蛋白(β2m-microglobulin)基因的全長序列,并分析其基因結(jié)構(gòu)、組織表達(dá)情況及MHCI α的多態(tài)性;然后,運(yùn)用間隔PCR法,獲得了金錢魚的線粒體基因組全長序列。這些研究結(jié)果,既為今后探討MHC基因多態(tài)性和抗病性的關(guān)系積累了基礎(chǔ)資料,又豐富了魚類的線粒體基因庫。論文的主要研究結(jié)果如下:1金錢魚MHC I α基因結(jié)構(gòu)及組織表達(dá)分析運(yùn)用RACE技術(shù),首次成功克隆獲得長度為2020bp的金錢魚MHC I α基因的cDNA全長序列。該基因的開放閱讀框(Opening reading frame,ORF)長1068bp,編碼一個(gè)分子量為40.09KDa并由356個(gè)氨基酸組成的前體蛋白,其第119位為信號肽(SP);5’非編碼區(qū)(5’-Untranslated Region,UTR)為86bp;3’UTR為866bp,含有典型的多聚腺苷酸加尾信號AATAAA及PolyA尾巴。分析表明:該序列...
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
金錢魚
-2金錢魚總RNA提取電泳圖
經(jīng) 1%電泳檢測發(fā)現(xiàn)(圖1-1-3),DNA 條帶明亮清晰,拖尾狀況很少,表明 DNA 純度較高,適用后續(xù)的PCR 擴(kuò)增。圖 1-1-3 金錢魚基因組 DNA 的電泳圖Fig. 1-1-3 Electrophoresis results of genomic DNA extraction of the spotted scat2.3 金錢魚 MHC I α 基因 cDNA 全長、內(nèi)含子擴(kuò)增與基因結(jié)構(gòu)分析以金錢魚肝臟組織的 cDNA 為模板,根據(jù)設(shè)計(jì)的兼并引物 MHC I α-F/R,PCR擴(kuò)增獲得長度為 315bp 的核苷酸片段,克隆、測序后,經(jīng) NCBI 的 BLAST 進(jìn)行同源性分析,發(fā)現(xiàn)它與鱸(D. labrax L.)的 MHC I α 基因序列的同源性最高(88%)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金錢魚雌雄個(gè)體的形態(tài)差異分析[J]. 吳波,張敏智,鄧思平,師尚麗,李廣麗,朱春華. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[2]金錢魚性腺發(fā)育及其組織結(jié)構(gòu)觀察[J]. 崔丹,劉志偉,劉南希,張瑩瑩,張俊彬. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(05)
[3]溫度對金錢魚卵巢發(fā)育的影響[J]. 張敏智,鄧思平,朱春華,李廣麗. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2013(03)
[4]赤點(diǎn)石斑魚MHC IA基因的克隆與表達(dá)多態(tài)性分析[J]. 沈銘輝,鄭樂云,杜佳瑩,王軍. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(01)
[5]紅笛鯛主要組織相容性復(fù)合物Ⅰα抗原基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 張新中,魯義善,吳灶和,簡紀(jì)常. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(10)
[6]鰱長江群體與國外移居群體間遺傳變異的主要組織相容性復(fù)合體分析[J]. 馮維,劉至治,李思發(fā),李雪松,唐文喬,楊金權(quán). 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[7]金錢魚幼魚低溫耐受能力和餌料營養(yǎng)需求的研究[J]. 宋郁,蘇冒亮,劉南希,張俊彬. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]圓斑星鰈MHCⅠα基因的克隆與組織表達(dá)分析[J]. 王娟,王宏偉,劉星,李宏俊,蘇浩,高祥剛,赫崇波. 水產(chǎn)科學(xué). 2011(08)
[9]魚類線粒體DNA及其研究進(jìn)展[J]. 陳四海,區(qū)又君,李加兒. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(03)
[10]團(tuán)頭魴主要組織相容性復(fù)合體Ⅰ類基因全長cDNA的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 馬曉茜,劉至治,李思發(fā),唐文喬,楊金權(quán). 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
本文編號:3075971
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
金錢魚
-2金錢魚總RNA提取電泳圖
經(jīng) 1%電泳檢測發(fā)現(xiàn)(圖1-1-3),DNA 條帶明亮清晰,拖尾狀況很少,表明 DNA 純度較高,適用后續(xù)的PCR 擴(kuò)增。圖 1-1-3 金錢魚基因組 DNA 的電泳圖Fig. 1-1-3 Electrophoresis results of genomic DNA extraction of the spotted scat2.3 金錢魚 MHC I α 基因 cDNA 全長、內(nèi)含子擴(kuò)增與基因結(jié)構(gòu)分析以金錢魚肝臟組織的 cDNA 為模板,根據(jù)設(shè)計(jì)的兼并引物 MHC I α-F/R,PCR擴(kuò)增獲得長度為 315bp 的核苷酸片段,克隆、測序后,經(jīng) NCBI 的 BLAST 進(jìn)行同源性分析,發(fā)現(xiàn)它與鱸(D. labrax L.)的 MHC I α 基因序列的同源性最高(88%)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金錢魚雌雄個(gè)體的形態(tài)差異分析[J]. 吳波,張敏智,鄧思平,師尚麗,李廣麗,朱春華. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[2]金錢魚性腺發(fā)育及其組織結(jié)構(gòu)觀察[J]. 崔丹,劉志偉,劉南希,張瑩瑩,張俊彬. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(05)
[3]溫度對金錢魚卵巢發(fā)育的影響[J]. 張敏智,鄧思平,朱春華,李廣麗. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2013(03)
[4]赤點(diǎn)石斑魚MHC IA基因的克隆與表達(dá)多態(tài)性分析[J]. 沈銘輝,鄭樂云,杜佳瑩,王軍. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(01)
[5]紅笛鯛主要組織相容性復(fù)合物Ⅰα抗原基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 張新中,魯義善,吳灶和,簡紀(jì)常. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(10)
[6]鰱長江群體與國外移居群體間遺傳變異的主要組織相容性復(fù)合體分析[J]. 馮維,劉至治,李思發(fā),李雪松,唐文喬,楊金權(quán). 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[7]金錢魚幼魚低溫耐受能力和餌料營養(yǎng)需求的研究[J]. 宋郁,蘇冒亮,劉南希,張俊彬. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]圓斑星鰈MHCⅠα基因的克隆與組織表達(dá)分析[J]. 王娟,王宏偉,劉星,李宏俊,蘇浩,高祥剛,赫崇波. 水產(chǎn)科學(xué). 2011(08)
[9]魚類線粒體DNA及其研究進(jìn)展[J]. 陳四海,區(qū)又君,李加兒. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(03)
[10]團(tuán)頭魴主要組織相容性復(fù)合體Ⅰ類基因全長cDNA的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 馬曉茜,劉至治,李思發(fā),唐文喬,楊金權(quán). 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
本文編號:3075971
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