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花鱸cox6a基因與相關(guān)miRNA的鑒定及其在鹽度適應(yīng)中的表達(dá)調(diào)控分析

發(fā)布時間:2021-03-06 00:51
  細(xì)胞色素c氧化酶(COX)是線粒體電子傳遞鏈的末端酶, COX6A是細(xì)胞色素c氧化酶的核編碼亞基之一。為豐富花鱸(Latolabrax maculatus)細(xì)胞色素c氧化酶的基礎(chǔ)研究,進(jìn)一步了解cox6a基因及相關(guān)miRNAs在花鱸滲透調(diào)節(jié)機(jī)制中的潛在作用,本研究開展了花鱸cox6a基因的全基因組鑒定及序列分析、cox6a基因的組織表達(dá)譜分析和急性鹽度轉(zhuǎn)換后的表達(dá)分析。此外,預(yù)測了可能靶定花鱸cox6a基因的miRNAs,并對其與cox6a基因的功能相關(guān)性進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,花鱸具有2個cox6a基因(cox6a1、cox6a2)。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析進(jìn)一步確認(rèn)了兩個花鱸cox6a基因命名的準(zhǔn)確性。多序列比對表明cox6a基因具有高度的保守性,尤其是C端。組織表達(dá)譜結(jié)果顯示,花鱸cox6a1在垂體、腦、肝臟和腎臟中的表達(dá)量較高, cox6a2在心臟和腎臟中的表達(dá)量較高。共獲得4個可能靶定cox6a2基因的miRNA:miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p和miR-155-5p,但沒有發(fā)現(xiàn)可能靶定cox6a1基因的miRNA。qRT-PCR的結(jié)果顯示,在花鱸適應(yīng)低鹽和高... 

【文章來源】:中國水產(chǎn)科學(xué). 2020,27(09)北大核心

【文章頁數(shù)】:12 頁

【部分圖文】:

花鱸cox6a基因與相關(guān)miRNA的鑒定及其在鹽度適應(yīng)中的表達(dá)調(diào)控分析


花鱸cox6a1(A)及cox6a2(B)基因在不同組織的mRNA相對表達(dá)量ep:小腦;gi:鰓;go:性腺;he:心臟;hki:頭腎;hyi:垂體;hyu:下丘腦;ki:腎;li:肝;me:延髓;mi:中腦;mu:肌肉;sp:脾;st:胃;te:端腦.

柱形圖,花鱸,端腦,基因


圖3 花鱸cox6a1(A)及cox6a2(B)基因在不同組織的mRNA相對表達(dá)量ep:小腦;gi:鰓;go:性腺;he:心臟;hki:頭腎;hyi:垂體;hyu:下丘腦;ki:腎;li:肝;me:延髓;mi:中腦;mu:肌肉;sp:脾;st:胃;te:端腦.2.5 預(yù)測靶向cox6a的miRNA

柱形圖,位點,趨勢,海水


本研究對4個cox6a2基因相關(guān)的miRNA進(jìn)行了qRT-PCR分析。結(jié)果顯示,miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p在FW-SW組、SW-FW組中均表現(xiàn)出了相似的表達(dá)變化趨勢:在FW-SW組中(圖6),相對于淡水對照組(0 h),miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p在處理12 h后表現(xiàn)出不同程度的上升趨勢,表達(dá)量分別為0 h的9.9、14.6、23.8倍。其中miR-30e-5p(圖6A)、miR-200a-3p(圖6C)在1 d仍維持高表達(dá),miR-223(圖6B)在1 d后表達(dá)量相對于12 h下降了50%。這3個miRNAs在3 d后都迅速下降為接近0 h的表達(dá)水平,但在7 d又出現(xiàn)小幅度的上升(0 h的2.7~3.5倍)。而miR-155-5p的表達(dá)呈現(xiàn)相反的趨勢:在處理12h后迅速下降了89.1%,并在3 d后回升為0 h的水平,在7 d時又下降為12 h的水平(圖6D)。在SW-FW組中(圖7),相對于海水對照組(0 h),miR-30e-5p(圖7A)、miR-223(圖7B)和miR-200a-3p(圖7C)均在處理12 h后表現(xiàn)出了顯著的上升趨勢,其表達(dá)量分別為0 h的12.2、8.5、19.9倍,并在處理7 d后分別下降為0 h的2.1、2.6、2.2倍,其中miR-200a-3p(圖7C)的表達(dá)變化最為顯著。而miR-155-5p(圖7D)在整個過程中沒有表現(xiàn)出明顯的變化趨勢。圖6 淡水轉(zhuǎn)海水處理組(FW→SW)花鱸鰓中miRNAs的表達(dá)A.miR-30e-5p;B.miR-223;C.miR-200a-3p;D.miR-155-5p.柱形圖上方字母不同表示差異顯著(P<0.05).


本文編號:3066154

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