鳊魴魚類微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構(gòu)建、遺傳結(jié)構(gòu)分析和團(tuán)頭魴fgfr1基因的克隆與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-05 12:09
團(tuán)頭魴(Megalobrama amblycephala)是我國(guó)特有的養(yǎng)殖魚類,在我國(guó)淡水養(yǎng)殖業(yè)及淡水捕撈業(yè)中占有重要的經(jīng)濟(jì)地位。團(tuán)頭魴具有養(yǎng)殖成本低、生長(zhǎng)快、成活率高、易捕撈,肉質(zhì)好等優(yōu)點(diǎn),在我國(guó)廣受青睞。發(fā)掘其生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)主效基因,培育優(yōu)良品種,是水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種基礎(chǔ)研究的重要內(nèi)容。然而,當(dāng)前以團(tuán)頭魴為首的鳊魴魚類天然資源已衰退嚴(yán)重,其基因庫(kù)也受到了威脅。另外,鳊魴魚類由于地理分布上的疊加,形態(tài)和生活習(xí)性較為相近,在自然條件下有可能相互交配,從而造成種質(zhì)混雜,原種鑒別日益迫切。成纖維生長(zhǎng)因子受體(fibroblast growth factor receptor 1,Fgfr1)屬于Fgfr家族,是一種酪氨酸激酶受體。它參與調(diào)控細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化、增殖和轉(zhuǎn)移,對(duì)動(dòng)物早期的胚胎發(fā)育和器官形成具有重要的作用。在哺乳動(dòng)物中,Fgfr1通常由2-3個(gè)Ig-like胞外配體結(jié)合域、一個(gè)富含絲氨酸的特異酸框、一個(gè)轉(zhuǎn)膜域和一個(gè)高度保守的酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域,這四個(gè)結(jié)構(gòu)域構(gòu)成。Fgfr1通過(guò)與其相應(yīng)的配體和HSPG的偶聯(lián),從而觸發(fā)一系列的信號(hào)調(diào)控(如:PKC信號(hào)通路、PI3K/PKB信號(hào)通路和Ras/E...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
鳊魴魚類微衛(wèi)星DNA指紋模式圖
圖 1-2 Mam03 (上圖) 和 EST37 (下圖) 引物在不同鳊魴魚類群體中的 PAGE 圖譜M: PBR322 DNA/MspΙ 標(biāo)準(zhǔn)分子量,m: 50 bp DNA Ladder;1~5:東江三角魴;6~10:長(zhǎng)春鳊;11~15:厚頜魴;16~20:廣東魴;21~25:錢塘江三角魴;26~30:團(tuán)頭魴。箭頭顯示為長(zhǎng)春鳊的特異性標(biāo)記。Fig. 1-2 PAGE analysis by primers Mam03 (upper) and EST37 (lower) among genus Megalobrama
上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文31圖2-1 團(tuán)頭魴fgfr1a(上)和fgfr1b(下)基因cDNA序列及推測(cè)的氨基酸序列編碼區(qū)用大寫字母表示,非編碼區(qū)用小寫字母表示;氨基酸序列在上,堿基序列在下,終止密碼子用*表示。Fig. 2-1 Nucleotide and deduced amino acid sequence of blunt snout bream fgfr1a (up) andfgfr1b (down) geneCapital letters indicate coding areas, small letters indicate the non-coding areas; Amino acidsequence and the nucleotide sequence are loacated up and down, respectively; termination codonuses * to express.2.3.2 團(tuán)頭魴 fgfr1a 和 fgfr1b 基因氨基酸序列同源性及分子進(jìn)化分析運(yùn)用生物學(xué)軟件,將團(tuán)頭魴 fgfr1a 和 fgfr1b 的 ORF 氨基酸序列與斑馬魚(Danio rerio)和人類(Homo sapiens)的氨基酸序列進(jìn)行相似性比較,結(jié)果如圖2-2 所示。團(tuán)頭魴 Fgfr1a 和 Fgfr1b 基因的成熟多肽有 82%的相似性,表現(xiàn)出高度的保守性。團(tuán)頭魴 Fgfr1a 與人 FGFR1 和斑馬魚 Fgfr1a 的相似度都分別為 72%和
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Southern雜交技術(shù)在農(nóng)作物遺傳轉(zhuǎn)化研究中的應(yīng)用[J]. 代軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(01)
[2]Tgf2轉(zhuǎn)座系統(tǒng)在轉(zhuǎn)RFP基因斑馬魚上的應(yīng)用[J]. 吳芳,葉星,鄒曙明,張莉莉,孫成飛,田園園,白俊杰. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2014(04)
[3]Tgf2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)鯉Fst1基因元件在鯉中的轉(zhuǎn)基因效率研究[J]. 閆學(xué)春,鐘莎莎,徐鵬,鄒曙明,孫效文. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[4]團(tuán)頭魴EST-SSR在厚頜魴中的跨種擴(kuò)增及雜交F1的鑒定[J]. 易少奎,高澤霞,羅偉,段曉克,李艷和,王衛(wèi)民. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]魴屬魚類形態(tài)差異分析[J]. 宋文,王藝舟,祝東梅,任瀧,王衛(wèi)民. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[6]Tgf2轉(zhuǎn)座子在團(tuán)頭魴基因組中的插入效率[J]. 郭秀明,黃創(chuàng)新,沈睿杰,蔣霞云,陳杰,鄒曙明. 遺傳. 2013(08)
[7]魚類活性DNA轉(zhuǎn)座子的發(fā)掘與應(yīng)用概況[J]. 鄒曙明,杜雪地,蔣霞云. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]大口黑鱸微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 樊佳佳,白俊杰,李勝杰,任坤,葉星. 水生生物學(xué)報(bào). 2012(04)
[9]魴屬魚類細(xì)胞色素b片段序列分析[J]. 謝楠,劉新軼,馮曉宇,郭水榮. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(01)
[10]鯉基因組中1個(gè)新Tc1類轉(zhuǎn)座子的發(fā)現(xiàn)與鑒定[J]. 王全樂(lè),冀培豐,徐鵬,孫效文. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]團(tuán)頭魴結(jié)締組織生長(zhǎng)因子的克隆和PB轉(zhuǎn)座子、PB-Tgf2復(fù)合轉(zhuǎn)座元件的構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因效率研究[D]. 王瑤.上海海洋大學(xué) 2014
[2]團(tuán)頭魴缺氧應(yīng)答相關(guān)基因的分子調(diào)控機(jī)制的研究[D]. 田玉梅.上海海洋大學(xué) 2012
[3]草魚肌肉生長(zhǎng)抑制素2的克隆、功能分析以及Tgf2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的魚類插入誘變研究[D]. 孫成飛.上海海洋大學(xué) 2012
[4]金魚Tgf2轉(zhuǎn)座子的研究及其轉(zhuǎn)基因應(yīng)用[D]. 杜雪地.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號(hào):3065176
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
鳊魴魚類微衛(wèi)星DNA指紋模式圖
圖 1-2 Mam03 (上圖) 和 EST37 (下圖) 引物在不同鳊魴魚類群體中的 PAGE 圖譜M: PBR322 DNA/MspΙ 標(biāo)準(zhǔn)分子量,m: 50 bp DNA Ladder;1~5:東江三角魴;6~10:長(zhǎng)春鳊;11~15:厚頜魴;16~20:廣東魴;21~25:錢塘江三角魴;26~30:團(tuán)頭魴。箭頭顯示為長(zhǎng)春鳊的特異性標(biāo)記。Fig. 1-2 PAGE analysis by primers Mam03 (upper) and EST37 (lower) among genus Megalobrama
上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文31圖2-1 團(tuán)頭魴fgfr1a(上)和fgfr1b(下)基因cDNA序列及推測(cè)的氨基酸序列編碼區(qū)用大寫字母表示,非編碼區(qū)用小寫字母表示;氨基酸序列在上,堿基序列在下,終止密碼子用*表示。Fig. 2-1 Nucleotide and deduced amino acid sequence of blunt snout bream fgfr1a (up) andfgfr1b (down) geneCapital letters indicate coding areas, small letters indicate the non-coding areas; Amino acidsequence and the nucleotide sequence are loacated up and down, respectively; termination codonuses * to express.2.3.2 團(tuán)頭魴 fgfr1a 和 fgfr1b 基因氨基酸序列同源性及分子進(jìn)化分析運(yùn)用生物學(xué)軟件,將團(tuán)頭魴 fgfr1a 和 fgfr1b 的 ORF 氨基酸序列與斑馬魚(Danio rerio)和人類(Homo sapiens)的氨基酸序列進(jìn)行相似性比較,結(jié)果如圖2-2 所示。團(tuán)頭魴 Fgfr1a 和 Fgfr1b 基因的成熟多肽有 82%的相似性,表現(xiàn)出高度的保守性。團(tuán)頭魴 Fgfr1a 與人 FGFR1 和斑馬魚 Fgfr1a 的相似度都分別為 72%和
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Southern雜交技術(shù)在農(nóng)作物遺傳轉(zhuǎn)化研究中的應(yīng)用[J]. 代軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(01)
[2]Tgf2轉(zhuǎn)座系統(tǒng)在轉(zhuǎn)RFP基因斑馬魚上的應(yīng)用[J]. 吳芳,葉星,鄒曙明,張莉莉,孫成飛,田園園,白俊杰. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2014(04)
[3]Tgf2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)鯉Fst1基因元件在鯉中的轉(zhuǎn)基因效率研究[J]. 閆學(xué)春,鐘莎莎,徐鵬,鄒曙明,孫效文. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[4]團(tuán)頭魴EST-SSR在厚頜魴中的跨種擴(kuò)增及雜交F1的鑒定[J]. 易少奎,高澤霞,羅偉,段曉克,李艷和,王衛(wèi)民. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]魴屬魚類形態(tài)差異分析[J]. 宋文,王藝舟,祝東梅,任瀧,王衛(wèi)民. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[6]Tgf2轉(zhuǎn)座子在團(tuán)頭魴基因組中的插入效率[J]. 郭秀明,黃創(chuàng)新,沈睿杰,蔣霞云,陳杰,鄒曙明. 遺傳. 2013(08)
[7]魚類活性DNA轉(zhuǎn)座子的發(fā)掘與應(yīng)用概況[J]. 鄒曙明,杜雪地,蔣霞云. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]大口黑鱸微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 樊佳佳,白俊杰,李勝杰,任坤,葉星. 水生生物學(xué)報(bào). 2012(04)
[9]魴屬魚類細(xì)胞色素b片段序列分析[J]. 謝楠,劉新軼,馮曉宇,郭水榮. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(01)
[10]鯉基因組中1個(gè)新Tc1類轉(zhuǎn)座子的發(fā)現(xiàn)與鑒定[J]. 王全樂(lè),冀培豐,徐鵬,孫效文. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]團(tuán)頭魴結(jié)締組織生長(zhǎng)因子的克隆和PB轉(zhuǎn)座子、PB-Tgf2復(fù)合轉(zhuǎn)座元件的構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因效率研究[D]. 王瑤.上海海洋大學(xué) 2014
[2]團(tuán)頭魴缺氧應(yīng)答相關(guān)基因的分子調(diào)控機(jī)制的研究[D]. 田玉梅.上海海洋大學(xué) 2012
[3]草魚肌肉生長(zhǎng)抑制素2的克隆、功能分析以及Tgf2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的魚類插入誘變研究[D]. 孫成飛.上海海洋大學(xué) 2012
[4]金魚Tgf2轉(zhuǎn)座子的研究及其轉(zhuǎn)基因應(yīng)用[D]. 杜雪地.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號(hào):3065176
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