雜色鮑在高溫和缺氧應(yīng)激下NF-κB信號(hào)通路相關(guān)基因的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-26 18:22
雜色鮑(Haliotis diversicolor)屬于腹足綱鮑科(Haliotidae)的單殼海生貝類。是我國(guó)東南沿海鮑科中最重要的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖種類之一。高水溫和缺氧,不僅會(huì)造成雜色鮑的大量死亡,同時(shí)也會(huì)對(duì)鮑魚養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展產(chǎn)生較大的影響。通常情況下,機(jī)體會(huì)通過自身的調(diào)節(jié)來(lái)適應(yīng)這些不利的環(huán)境條件的變化。由于雜色鮑缺乏獲得性免疫系統(tǒng),因此這一適應(yīng)的過程在很大程度上就依賴于機(jī)體的先天免疫系統(tǒng)。作為參與先天免疫調(diào)節(jié)的重要信號(hào)通路,NF-κB信號(hào)通路也必然在這一過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。本研究利用SMART-RACE技術(shù),同時(shí)依托于簡(jiǎn)并引物的擴(kuò)增以及轉(zhuǎn)錄組EST數(shù)據(jù)庫(kù)的查找成功克隆獲得4條參與到NF-κB信號(hào)通路中的先天免疫調(diào)控相關(guān)基因:核因子κB抑制因子(NF-kappa-B inhibitor,IκB)、Akirin2、酪氨酸3-加單氧酶/色氨酸5-加單氧酶激活蛋白ζ(Tyrosine 3/Tryptophan 5 monooxygenase activation protein zeta,14-3-3ζ)、腦富集的Ras蛋白同源體(Ras homologenriched in brai...
【文章來(lái)源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NF-κB/Rel和IκB蛋白家族(Haydenetal.,2008)
圖 1.2 NF-κB 信號(hào)通路的經(jīng)典途徑的和非經(jīng)典途徑(Bonizzi 等,2004)。(a) 經(jīng)典途徑;(b) 非經(jīng)典途徑。在靜息狀態(tài)下的細(xì)胞質(zhì)中,NF-κB 與其抑制蛋白 IκB 結(jié)合,由于核定位信號(hào)(NL掩蓋而處于非活性狀態(tài)。在經(jīng)典途徑中,外界的應(yīng)激源可以被位于細(xì)胞膜上的 Toll體(Toll-Like Receptor,TLR)所識(shí)別,此外,這些刺激信號(hào)也可以分別由腫瘤壞死 α(Tumor Necrosis Factor α,TNF-α)和白細(xì)胞介素-1(Interleukin-1,IL-1)來(lái)介導(dǎo)。類型的 TLRs 可以識(shí)別不同病原表面的病原體相關(guān)的分子模式(Pathogen Associaolecular Patterns,PAMPs),并將它們傳遞給接頭的髓樣細(xì)胞分化因子 88(Myeifferentiation Factor 88,MyD88)以及腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子 6(Tumor Necrosis Faeceptor-Associated Factor 6,TRAF6)[34];對(duì)于由 TNF-α 介導(dǎo)的信號(hào)傳遞過程,TNF-α與其特異的跨膜受體進(jìn)行結(jié)合,然后外界的刺激信號(hào)被傳遞給 TRAF2;與 TNF-α 相似L-1 的介導(dǎo)也是首先要與其特異的受體進(jìn)行結(jié)合,并以此來(lái)激活 MyD88,隨后再經(jīng) 1體連接酶的作用將刺激信號(hào)傳遞給 TRAF6。無(wú)論是 TRAF2 還是 TRAF6 均可以通過激F-κB 誘導(dǎo)激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 14,NIK)的方式來(lái)激[66]
但同時(shí)也存在著很大的局限性。以上這些研究都是局限在軟體動(dòng)物在抵御病及鹽度脅迫時(shí),NF-κB 信號(hào)通路的部分相關(guān)基因的調(diào)節(jié)機(jī)制。但是眾所周知,海陸地環(huán)境相比更為復(fù)雜,不僅病菌的感染,其他的一些應(yīng)激源,如:水體溫度過溶氧量過低等因素都會(huì)對(duì)海洋生物的生存產(chǎn)生很大威脅。因此,闡明在不同環(huán)境下 NF-κB 信號(hào)通路對(duì)海洋軟體動(dòng)物的免疫調(diào)節(jié)機(jī)制,不僅可以為我們研究海洋軟免疫相關(guān)基因提供重要的信息,還可以為研究海洋軟體動(dòng)物應(yīng)對(duì)不同環(huán)境因子應(yīng)機(jī)制提供重要的線索。 本研究的內(nèi)容和目的意義.1 研究的內(nèi)容)通過篩選雜色鮑 NF-κB信號(hào)通路相關(guān)的 ESTs,采用生物信息學(xué)方法分析 ESTs 數(shù) 21 個(gè)與其相關(guān)的基因。通過對(duì)相關(guān)文獻(xiàn)的參考繪制出雜色鮑中可能的 NF-κB 信(圖 1.3),并對(duì)其中的 14-3-3ζ、Akirin2 和 RHEB 采用 RACE 的方法克隆獲得其A。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雜色鮑同種移植炎癥因子1的克隆及其在應(yīng)激下的表達(dá)[J]. 黃貽濤,蔡秀紅,張子平,王國(guó)棟,鄒志華,王淑紅,王藝?yán)? 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]擬穴青蟹14-3-3基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 舒妙安,張龍韜,徐賓朋,胡杭嬌,郭曉令. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(08)
[3]溫度對(duì)雜色鮑不同群體生長(zhǎng)率與存活率的影響[J]. 游偉偉,林煥陽(yáng),駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺(tái)灣海峽. 2011(04)
[4]雜色鮑的遺傳育種研究進(jìn)展[J]. 柯才煥,游偉偉. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(02)
[5]中國(guó)海洋溢油污染現(xiàn)狀及其生態(tài)影響研究[J]. 王傳遠(yuǎn),賀世杰,李延太,侯西勇,楊翠云. 海洋科學(xué). 2009(06)
[6]雜色鮑對(duì)高溫和低鹽耐受力的初步研究[J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(04)
[7]14-3-3蛋白功能研究進(jìn)展[J]. 曾妍,鄭志紅,楊磊. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2008(07)
[8]東海赤潮高發(fā)區(qū)春季溶解氧和pH分布特征及影響因素探討[J]. 石曉勇,王修林,陸茸,孫霞. 海洋與湖沼. 2005(05)
[9]日本對(duì)蝦精巢和卵巢全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建[J]. 王藝?yán)?張子平. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2003(02)
[10]水體富營(yíng)養(yǎng)化及其防治技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 錢大富,馬靜穎,洪小平. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2002(01)
博士論文
[1]HPD、NLK調(diào)控NF-kB通路和TGFβ通路及機(jī)制研究[D]. 張力民.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2012
[2]刺參Apostichopus japonicus (Selenka)對(duì)溫度脅迫響應(yīng)分子機(jī)理的基礎(chǔ)研究[D]. 趙歡.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2011
本文編號(hào):3052982
【文章來(lái)源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NF-κB/Rel和IκB蛋白家族(Haydenetal.,2008)
圖 1.2 NF-κB 信號(hào)通路的經(jīng)典途徑的和非經(jīng)典途徑(Bonizzi 等,2004)。(a) 經(jīng)典途徑;(b) 非經(jīng)典途徑。在靜息狀態(tài)下的細(xì)胞質(zhì)中,NF-κB 與其抑制蛋白 IκB 結(jié)合,由于核定位信號(hào)(NL掩蓋而處于非活性狀態(tài)。在經(jīng)典途徑中,外界的應(yīng)激源可以被位于細(xì)胞膜上的 Toll體(Toll-Like Receptor,TLR)所識(shí)別,此外,這些刺激信號(hào)也可以分別由腫瘤壞死 α(Tumor Necrosis Factor α,TNF-α)和白細(xì)胞介素-1(Interleukin-1,IL-1)來(lái)介導(dǎo)。類型的 TLRs 可以識(shí)別不同病原表面的病原體相關(guān)的分子模式(Pathogen Associaolecular Patterns,PAMPs),并將它們傳遞給接頭的髓樣細(xì)胞分化因子 88(Myeifferentiation Factor 88,MyD88)以及腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子 6(Tumor Necrosis Faeceptor-Associated Factor 6,TRAF6)[34];對(duì)于由 TNF-α 介導(dǎo)的信號(hào)傳遞過程,TNF-α與其特異的跨膜受體進(jìn)行結(jié)合,然后外界的刺激信號(hào)被傳遞給 TRAF2;與 TNF-α 相似L-1 的介導(dǎo)也是首先要與其特異的受體進(jìn)行結(jié)合,并以此來(lái)激活 MyD88,隨后再經(jīng) 1體連接酶的作用將刺激信號(hào)傳遞給 TRAF6。無(wú)論是 TRAF2 還是 TRAF6 均可以通過激F-κB 誘導(dǎo)激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 14,NIK)的方式來(lái)激[66]
但同時(shí)也存在著很大的局限性。以上這些研究都是局限在軟體動(dòng)物在抵御病及鹽度脅迫時(shí),NF-κB 信號(hào)通路的部分相關(guān)基因的調(diào)節(jié)機(jī)制。但是眾所周知,海陸地環(huán)境相比更為復(fù)雜,不僅病菌的感染,其他的一些應(yīng)激源,如:水體溫度過溶氧量過低等因素都會(huì)對(duì)海洋生物的生存產(chǎn)生很大威脅。因此,闡明在不同環(huán)境下 NF-κB 信號(hào)通路對(duì)海洋軟體動(dòng)物的免疫調(diào)節(jié)機(jī)制,不僅可以為我們研究海洋軟免疫相關(guān)基因提供重要的信息,還可以為研究海洋軟體動(dòng)物應(yīng)對(duì)不同環(huán)境因子應(yīng)機(jī)制提供重要的線索。 本研究的內(nèi)容和目的意義.1 研究的內(nèi)容)通過篩選雜色鮑 NF-κB信號(hào)通路相關(guān)的 ESTs,采用生物信息學(xué)方法分析 ESTs 數(shù) 21 個(gè)與其相關(guān)的基因。通過對(duì)相關(guān)文獻(xiàn)的參考繪制出雜色鮑中可能的 NF-κB 信(圖 1.3),并對(duì)其中的 14-3-3ζ、Akirin2 和 RHEB 采用 RACE 的方法克隆獲得其A。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雜色鮑同種移植炎癥因子1的克隆及其在應(yīng)激下的表達(dá)[J]. 黃貽濤,蔡秀紅,張子平,王國(guó)棟,鄒志華,王淑紅,王藝?yán)? 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]擬穴青蟹14-3-3基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及組織表達(dá)分析[J]. 舒妙安,張龍韜,徐賓朋,胡杭嬌,郭曉令. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(08)
[3]溫度對(duì)雜色鮑不同群體生長(zhǎng)率與存活率的影響[J]. 游偉偉,林煥陽(yáng),駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺(tái)灣海峽. 2011(04)
[4]雜色鮑的遺傳育種研究進(jìn)展[J]. 柯才煥,游偉偉. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(02)
[5]中國(guó)海洋溢油污染現(xiàn)狀及其生態(tài)影響研究[J]. 王傳遠(yuǎn),賀世杰,李延太,侯西勇,楊翠云. 海洋科學(xué). 2009(06)
[6]雜色鮑對(duì)高溫和低鹽耐受力的初步研究[J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(04)
[7]14-3-3蛋白功能研究進(jìn)展[J]. 曾妍,鄭志紅,楊磊. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2008(07)
[8]東海赤潮高發(fā)區(qū)春季溶解氧和pH分布特征及影響因素探討[J]. 石曉勇,王修林,陸茸,孫霞. 海洋與湖沼. 2005(05)
[9]日本對(duì)蝦精巢和卵巢全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建[J]. 王藝?yán)?張子平. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2003(02)
[10]水體富營(yíng)養(yǎng)化及其防治技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 錢大富,馬靜穎,洪小平. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2002(01)
博士論文
[1]HPD、NLK調(diào)控NF-kB通路和TGFβ通路及機(jī)制研究[D]. 張力民.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2012
[2]刺參Apostichopus japonicus (Selenka)對(duì)溫度脅迫響應(yīng)分子機(jī)理的基礎(chǔ)研究[D]. 趙歡.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2011
本文編號(hào):3052982
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3052982.html
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