本文通過對新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)部分序列以及細胞色素b基因部分序列進行遺傳標記,結(jié)合線粒體DNA D-loop區(qū)存在的異質(zhì)性,對新疆開都河、鞏乃斯河、瑪納斯河以及喀什河四條河流4個野生新疆裸重唇魚群體進行遺傳多樣性研究,為新疆裸重唇魚種質(zhì)資源保護提供理論基礎(chǔ),結(jié)論如下:1.在鯉、細鱗裂腹魚已識別部分保守序列的基礎(chǔ)上,針對新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列測定后識別了其終止序列區(qū)TAS、中央保守區(qū)CD、保守序列區(qū)CSB以其界限。通過與鯉、細鱗裂腹魚之間對比,對這三者堿基組成進行了分析,在新疆裸重唇魚中新識別了三個串聯(lián)重復(fù)序列,與鯉、細鱗裂腹魚相比新疆裸重唇魚出現(xiàn)了較少的堿基缺失。2.對開都河、瑪納斯河、喀什河、鞏乃斯河4個新疆裸重唇魚群體,提取其線粒體DNA D-loop區(qū)部分序列,得到748 bp左右的同源序列74條。其中檢測到13個單倍型,變異位點20個。新疆裸重唇魚群體平均單倍型多樣性和平均核苷酸多樣性分別為Hd=0.864±0.196,Pi=0.03112±0.030475。群體間FST分析顯示,瑪納斯河群體與其他群體間存在較大分化（FST>0.... 

【文章來源】：石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
中英符號縮略詞表
第一章 文獻綜述
    1 新疆裸重唇魚資源及保護
        1.1 新疆裸重唇魚的分類地位及分布簡介
        1.2 形態(tài)特征
        1.3 生活環(huán)境
        1.4 新疆裸重唇魚研究概況
    2 遺傳多樣性研究概況
        2.1 遺傳多樣性概述
        2.2 魚類遺傳多樣性概述
        2.3 魚類遺傳多樣性的研究方法及應(yīng)用
            2.3.1 線粒體DNA D-loop區(qū)
                2.3.1.1 線粒體DNA D-loop區(qū)結(jié)構(gòu)特點
                2.3.1.2 線粒體DNA D-loop區(qū)分子多態(tài)性的研究
                    （1）RFLP技術(shù)（Restriction fragment length polymorphism, RFLP）
                    （2）RAPD技術(shù)（Randomly Amplified Polymorphic DNA， RAPD）
                    （3）微衛(wèi)星DNA（Microsatellite）
                    （4）PCR-SSCP技術(shù)
                2.3.1.3 魚類線粒體DNA D-loop區(qū)研究概況
            2.3.2 線粒體DNA細胞色素b研究概況
    3 線粒體異質(zhì)性研究概述
    4 研究目的與意義
第二章 基于線粒體DNA D-loop區(qū)序列的新疆裸重唇魚遺傳多樣性及差異研究
    前言
    1 實驗材料
        1.1 實驗設(shè)備
        1.2 實驗試劑
        1.3 實驗樣品采集
    2 研究方法
        2.1 新疆裸重唇魚基因組DNA的提取及檢測
            2.1.1 新疆裸重唇魚基因組DNA提取
            2.1.2 新疆裸重唇魚基因組DNA檢測
        2.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)單倍型篩選
            2.2.1 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)擴增
            2.2.2 SSCP-PCR篩選單倍型
                2.2.2.1 非變性聚丙烯酰胺凝膠制備
                2.2.2.2 銀染顯色
        2.3 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)部分序列擴增
        2.4 目的條帶純化回收
        2.5 目的條帶的連接和轉(zhuǎn)化
            2.5.1 大腸桿菌感受態(tài)細胞制備：
            2.5.2 連接
            2.5.3 轉(zhuǎn)化
            2.5.4 陽性克隆的檢測
            2.5.5 菌液測序
        2.6 數(shù)據(jù)處理
            2.6.1 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析
            2.6.2 新疆裸重唇魚不同群體線粒體DNA控制區(qū)遺傳多樣性分析
    3 結(jié)果分析
        3.1 新疆裸重唇魚總DNA提取與檢測
        3.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)單倍型篩選
            3.2.1 新疆裸重唇魚用于單倍型篩選的片段擴增
            3.2.2 新疆裸重唇魚不同群體線粒體DNA控制區(qū)PCR-SSCP單倍型分型
        3.3 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)堿基結(jié)構(gòu)分析
            3.3.1 新疆裸重唇魚、鯉和細鱗裂腹魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列差異比較
            3.3.2 新疆裸重唇魚、鯉和細鱗裂腹魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列分析
                3.3.2.1 終止序列區(qū)
                3.3.2.2 中央保守序列區(qū)
                3.3.4.3 保守序列區(qū)
        3.4 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)遺傳多樣性比較分析
            3.4.1 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)序列分析
            3.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)比較
            3.4.3 群體的種群擴張分析
            3.4.4 聚類分析結(jié)果
    4 討論
        4.1 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析
        4.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)遺傳多樣性比較分析
            4.2.1 新疆裸重唇魚四個群體的分子遺傳多樣性比較
            4.2.2 新疆裸重唇魚群體的遺傳分化
            4.2.3 群體的種群擴張分析
第三章 基于線粒體DNA細胞色素b基因部分序列的新疆裸重唇魚遺傳多樣性分析
    前言
    1 實驗材料和設(shè)備
        1.1 實驗材料
        1.2 主要儀器
        1.3 主要試劑
    2 研究方法
        2.1 新疆裸重唇魚線粒體基因組DNA提取及純度檢測
        2.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA細胞色素b基因PCR擴增測序
        2.3 數(shù)據(jù)處理
    3 結(jié)果分析
        3.1 新疆裸重唇魚不同群體線粒體DNA細胞色素b序列變異比較
        3.2 新疆裸重唇魚不同群體群體遺傳結(jié)構(gòu)比較
        3.3 新疆裸重唇魚不同群體聚類分析
    4 討論
第四章 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)異質(zhì)性初探
    前言
    1 實驗材料與方法
        1.1 實驗材料與儀器試劑
            1.1.1 實驗材料
            1.1.2 主要儀器
            1.1.3 主要試劑
        1.2 研究方法
            1.2.1 新疆裸重唇魚基因組DNA提取及檢測
            1.2.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)PCR-SSCP單倍型分型
                1.2.2.1 新疆裸重唇魚用于單倍型篩選的 500bp片段擴增
                1.2.2.2 新疆裸重唇魚線粒體DNA控制區(qū)篩選單倍型
                1.2.2.3 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū) 750bp序列擴增
        1.3 數(shù)據(jù)處理
    2 實驗結(jié)果分析
        2.1 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)點異質(zhì)性
        2.3 新疆裸重唇魚線粒體DNA D-loop區(qū)長度異質(zhì)性
第五章 新疆裸重唇魚不同群體遺傳多樣性及差異研究總述
創(chuàng)新點與展望
    6.1 創(chuàng)新點
    6.2 展望
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介
附件


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于線粒體DNA控制區(qū)序列的6個凡納濱對蝦（Litopenaeus vannamei）養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉紅,張海強,蔡生力,戴習(xí)林.  漁業(yè)科學(xué)進展. 2016(01)
[2]伊犁河三支流新疆裸重唇魚的生長特性研究[J]. 牛玉娟,任道全,陳生熬,蔡林剛,牛建功,謝從新.  水生態(tài)學(xué)雜志. 2015(06)
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[4]伊犁河兩種裂腹魚類基因安全和種群分布的關(guān)系[J]. 牛建功,蔡林鋼,李紅,馬徐發(fā).  水產(chǎn)學(xué)雜志. 2015(04)
[5]線粒體DNA分子技術(shù)在斑點叉尾鮰物種鑒定中的應(yīng)用[J]. 羅志萍,肖武漢,黃迎波,周慧平,袁曉芬,王華全.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(11)
[6]不同地理群體烏鱧線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析及遺傳多樣性[J]. 董新培,穆淑梅,周楠,康現(xiàn)江,羅青,白俊杰.  水產(chǎn)學(xué)報. 2014(09)
[7]黃鯽線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)及長度多態(tài)性分析[J]. 蔡珊珊,徐勝勇,宋娜,高天翔,張朝暉.  水生生物學(xué)報. 2014(05)
[8]基于線粒體COI和Cyt b基因序列對新疆兩水系斑重唇魚遺傳結(jié)構(gòu)的分析[J]. 楊天燕,孟瑋,馬燕武,蔡林鋼,郭焱.  淡水漁業(yè). 2014(04)
[9]基于線粒體DNA標記的長江中游草魚親本增殖放流的遺傳效果評估[J]. 李樹華,陳大慶,段辛斌,劉紹平,汪登強.  淡水漁業(yè). 2014(03)
[10]白洋淀烏鱧線粒體D-Loop區(qū)序列遺傳多樣性分析[J]. 董新培,穆淑梅,周楠,康現(xiàn)江,白俊杰.  河北大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(02)

博士論文
[1]斑鰶和青鱗小沙丁魚的種群遺傳結(jié)構(gòu)與分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 應(yīng)一平.中國海洋大學(xué) 2011
[2]中國紅鯉遺傳多樣性研究[D]. 王成輝.上海水產(chǎn)大學(xué) 2002

碩士論文
[1]伊犁河新疆裸重唇魚個體生物學(xué)研究[D]. 牛玉娟.塔里木大學(xué) 2015
[2]基于線粒體DNA序列和微衛(wèi)星標記分析波紋唇魚不同地理群體的遺傳多樣性及遺傳分化[D]. 胡靜.海南大學(xué) 2012
[3]新疆裸重唇魚染色體的核型及帶型研究[D]. 孔磊.石河子大學(xué) 2010
[4]牦牛GH基因多態(tài)性的PCR-SSCP分析[D]. 白晶晶.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]鰱鳙長江野生群體和養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析[D]. 田華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]青鱗小沙丁魚（Sardinella zunasi）種群形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)研究[D]. 楊天燕.中國海洋大學(xué) 2008



本文編號：3052598