魚(yú)類作為出現(xiàn)最早的較為低等的脊椎動(dòng)物,已經(jīng)進(jìn)化出了與高等脊椎動(dòng)物相似的適應(yīng)性免疫反應(yīng)。雖然適應(yīng)性免疫反應(yīng)在魚(yú)類中應(yīng)答效率較低,但是他們似乎能夠充分利用發(fā)達(dá)的先天免疫系統(tǒng)來(lái)彌補(bǔ)它們?cè)诳贵w反應(yīng)中的不足。補(bǔ)體系統(tǒng)作為先天性免疫的一種,在魚(yú)類抵抗外來(lái)微生物入侵中發(fā)揮著極為重要的作用。本研究中我們利用本地blast選用近緣物種的基因作為目標(biāo)序列去搜索鮸魚(yú)轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)從而得到9種鮸魚(yú)補(bǔ)體基因,包括補(bǔ)體基因Bf/C2、C4、C5、C6、C7-1、C7-2、C8α、C8β和C8γ的序列全長(zhǎng),然后對(duì)基因在正常情況和感染后的表達(dá)進(jìn)行了研究,最后結(jié)合其他物種的這九種基因進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)和線性分析。對(duì)補(bǔ)體Bf/C2進(jìn)行的生物信息學(xué)研究表明,鮸魚(yú)補(bǔ)體Bf/C2序列全長(zhǎng)為2,301bp,編碼766個(gè)氨基酸,包含19個(gè)外顯子和18個(gè)內(nèi)含子,與其他魚(yú)類具有相似的基因結(jié)構(gòu)。基因線性分析表明,魚(yú)類補(bǔ)體Bf/C2具有相對(duì)較高的保守性。熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,補(bǔ)體Bf/C2雖然在鮸魚(yú)未感染組織中均有表達(dá),但是不同的組織表達(dá)具有差異性。而在感染鰻弧菌的組織中,補(bǔ)體Bf/C2在肝臟和腎臟中的表達(dá)是上調(diào)的,在脾臟中的表達(dá)是... 

【文章來(lái)源】：浙江海洋大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】：65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

鮸魚(yú)補(bǔ)體Bf/C2的核苷酸序列(A)和預(yù)測(cè)的蛋白結(jié)構(gòu)域(B)

第二章 鮸魚(yú)補(bǔ)體 Bf/C2 的分子結(jié)構(gòu)及表達(dá)2.2.2 補(bǔ)體 Bf/C2 基因系統(tǒng)樹(shù)的構(gòu)建所有補(bǔ)體 Bf/C2 基因序列比對(duì)之后用 jModeltest 計(jì)算最優(yōu)核苷酸替代模型為GTR+I+G 模型，用 MrBayes v3.2 軟件構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)。構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)如圖 2-3，除了極個(gè)別的分化枝節(jié)點(diǎn)具有不高的后驗(yàn)概率(pp 值)外，其余的節(jié)點(diǎn)的 pp 值都是 1，表明所構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)可信度較高。整個(gè)樹(shù)形分為三部分，處于樹(shù)形最外端的被定義為外群，而在處于里面的部分主要分為兩大類群：魚(yú)類和哺乳類，分別代表水生和陸生生物。其中鮸魚(yú)跟兩個(gè)鲀類聚祖先聚在一塊后再與三刺魚(yú)聚在一起，證明鮸魚(yú)與兩個(gè)鲀類具有較近的親緣關(guān)系。

16圖 2-4 幾種魚(yú)類補(bǔ)體 Bf/C2 的基因線性比較，相同的基因用相同顏色代表，箭頭代表了他們的轉(zhuǎn)錄方向。Fig 2.4 Genomic synteny of Bf/C2 among several fish. The same color represented the same genes andthe arrows indicated the transcriptional direction.2.2.3 基因線性分析利用魚(yú)類基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚(yú)與其他魚(yú)類補(bǔ)體 Bf/C2 進(jìn)行了共線性分析，見(jiàn)圖 2-4。鮸魚(yú)補(bǔ)體 Bf/C2 基因位于 scaffold111 上，它周圍的基因包括 fam115，pnkp、mfrp、nudt8、cbln20、tagln 和 pcsk7，其中 pnkp 基因沒(méi)有在紅鰭東方鲀和綠河鲀中發(fā)現(xiàn)，而且 trim29這個(gè)基因在其他魚(yú)類中都存在，唯獨(dú)沒(méi)有在鮸魚(yú)中發(fā)現(xiàn)。三刺魚(yú)和羅非魚(yú)補(bǔ)體 Bf/C2分別位于染色體 1 和 scaffoldGL831207 上，周圍除了具有與鮸魚(yú)相同的基因外，比鮸魚(yú)多了一個(gè) trim29，這個(gè)基因在其他魚(yú)類中也存在。青鳉的 Bf/C2 位于染色體 13 上，除了具有與鮸魚(yú)相同的基因外，青鳉中存在兩個(gè) cbln20 基因，其他魚(yú)類只存在一個(gè)cbln20 基因。紅鰭東方鲀補(bǔ)體 Bf/C2 位于 scaffold363 上，與其他魚(yú)類相比除了缺少

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)成分及補(bǔ)體特異性和功能的研究進(jìn)展[J]. 王志平,張士璀,王光鋒.  水生生物學(xué)報(bào). 2008(05)

博士論文
[1]草魚(yú)4個(gè)補(bǔ)體基因克隆表達(dá)和連鎖及與細(xì)菌性敗血癥的關(guān)聯(lián)分析[D]. 沈玉幫.上海海洋大學(xué) 2013
[2]文昌魚(yú)體液和魚(yú)類血清補(bǔ)體溶血系統(tǒng)比較研究[D]. 王長(zhǎng)法.中國(guó)海洋大學(xué) 2003

碩士論文
[1]牙鲆免疫系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)及其部分免疫細(xì)胞的功能研究[D]. 王衛(wèi)衛(wèi).中國(guó)海洋大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3041455