海南后水灣深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)微生物多樣性及其養(yǎng)殖卵形鯧鲹“爛身
發(fā)布時間:2021-01-31 07:34
卵形鯧鲹(Trachinotus ovatus)是海南省深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖的主要品種,細菌性疾病是海南深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖的主要疾病,對深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖卵形鯧鰺造成了嚴重危害。本文利用基于宏基因組學(xué)16SrRNA基因測序的方法研究分析了海南臨高后水灣深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)的微生物群落組成及動態(tài)變化;并對該養(yǎng)殖區(qū)卵形鯧鰺主要疾病“爛身病”進行了病原分離鑒定和藥敏分析等研究;利用第三代測序?qū)υ撝虏【赀M行了基因組測序,并通過比較基因組分析了其相關(guān)毒力基因;同時,通過篩選特異性基因,建立了一種該病原的快速檢測新方法。主要研究結(jié)果如下:(1)利用基于宏基因組學(xué)16SrRNA基因測序的方法研究分析了海南臨高后水灣水體和患病魚類樣品微生物群落組成,結(jié)果顯示該區(qū)域微生物比較豐富,菌落多樣性水平較高,ACE和Chao1豐富度指數(shù)平均值分別為1517和1287,Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)平均值分別為3.78和0.08。(2)于2016年3月、5月、7月份、9月和11月分別對后水灣深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)的養(yǎng)殖網(wǎng)箱內(nèi)外及非養(yǎng)殖區(qū)(對照區(qū))微生物群落結(jié)構(gòu)特征分析,結(jié)果表明,雖然調(diào)查區(qū)域在不同月份的微生物群落豐富度和多樣性差異較大,...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]卵形鯧鲹刺激隱核蟲病組織病理學(xué)研究[J]. 陳福艷,梁萬文,陳明,黃婷,李莉萍,雷愛瑩,王瑞,楊學(xué)明,羅洪林,歐陽賢華. 漁業(yè)研究. 2017(03)
[2]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增聯(lián)合橫向流動試紙條可視化檢測哈維氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前進,陳炯. 生物技術(shù)通報. 2016(06)
[3]卵形鯧鲹主要致病鏈球菌多重PCR診斷技術(shù)的建立[J]. 熊向英,蔡小輝,彭銀輝,黃國強,梁志輝,王志成. 廣西科學(xué). 2016(01)
[4]應(yīng)用高通量測序技術(shù)分析北方刺參養(yǎng)殖池塘環(huán)境菌群結(jié)構(gòu)[J]. 竇妍,趙曉偉,丁君,何鵬. 海洋與湖沼. 2016(01)
[5]網(wǎng)箱養(yǎng)殖卵形鯧鲹魚體寄生蟲初步調(diào)查[J]. 熊向英,徐力文,董蘭芳,王志成,梁志輝,蔣偉添,黃國強. 廣西科學(xué)院學(xué)報. 2015(04)
[6]新一代測序技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 田李,張穎,趙云峰. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[7]PacBio Sequencing and Its Applications[J]. Anthony Rhoads,Kin Fai Au. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
[8]Nanopore-based Fourth-generation DNA Sequencing Technology[J]. Yanxiao Feng,Yuechuan Zhang,Cuifeng Ying,Deqiang Wang,Chunlei Du. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(01)
[9]單分子實時測序技術(shù)的原理與應(yīng)用[J]. 柳延虎,王璐,于黎. 遺傳. 2015(03)
[10]南海南部海域浮游細菌群落特征及影響因素研究[J]. 白潔,劉小沙,侯瑞,趙陽國,高會旺. 中國環(huán)境科學(xué). 2014(11)
博士論文
[1]我國黃、東海典型生態(tài)過程中的微生物群落結(jié)構(gòu)[D]. 劉敏.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2011
碩士論文
[1]廣東海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚類細菌和寄生蟲病原的分離、鑒定及流行病學(xué)調(diào)查[D]. 石章鎖.西南大學(xué) 2008
本文編號:3010456
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2.1水樣(A)和患病魚類組織樣品(B)細菌豐富度稀疏曲線分析圖??Figure?2.1?Richness?rarefraction?plot??
A?B??圖2.4基于屬水平水樣(A)和患病魚類組織樣品(B)相對豐度柱狀圖??Figure?2.4?Relative?abundance?of?genus-level?bacterial?communities?in?seawater??samples?and?tissue?samples?in?2016??3.?3.?1水體中微生物群落組成??3.3.?1.1不同月份水體中細菌群落結(jié)構(gòu)變化??22??
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]卵形鯧鲹刺激隱核蟲病組織病理學(xué)研究[J]. 陳福艷,梁萬文,陳明,黃婷,李莉萍,雷愛瑩,王瑞,楊學(xué)明,羅洪林,歐陽賢華. 漁業(yè)研究. 2017(03)
[2]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增聯(lián)合橫向流動試紙條可視化檢測哈維氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前進,陳炯. 生物技術(shù)通報. 2016(06)
[3]卵形鯧鲹主要致病鏈球菌多重PCR診斷技術(shù)的建立[J]. 熊向英,蔡小輝,彭銀輝,黃國強,梁志輝,王志成. 廣西科學(xué). 2016(01)
[4]應(yīng)用高通量測序技術(shù)分析北方刺參養(yǎng)殖池塘環(huán)境菌群結(jié)構(gòu)[J]. 竇妍,趙曉偉,丁君,何鵬. 海洋與湖沼. 2016(01)
[5]網(wǎng)箱養(yǎng)殖卵形鯧鲹魚體寄生蟲初步調(diào)查[J]. 熊向英,徐力文,董蘭芳,王志成,梁志輝,蔣偉添,黃國強. 廣西科學(xué)院學(xué)報. 2015(04)
[6]新一代測序技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 田李,張穎,趙云峰. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[7]PacBio Sequencing and Its Applications[J]. Anthony Rhoads,Kin Fai Au. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
[8]Nanopore-based Fourth-generation DNA Sequencing Technology[J]. Yanxiao Feng,Yuechuan Zhang,Cuifeng Ying,Deqiang Wang,Chunlei Du. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(01)
[9]單分子實時測序技術(shù)的原理與應(yīng)用[J]. 柳延虎,王璐,于黎. 遺傳. 2015(03)
[10]南海南部海域浮游細菌群落特征及影響因素研究[J]. 白潔,劉小沙,侯瑞,趙陽國,高會旺. 中國環(huán)境科學(xué). 2014(11)
博士論文
[1]我國黃、東海典型生態(tài)過程中的微生物群落結(jié)構(gòu)[D]. 劉敏.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2011
碩士論文
[1]廣東海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚類細菌和寄生蟲病原的分離、鑒定及流行病學(xué)調(diào)查[D]. 石章鎖.西南大學(xué) 2008
本文編號:3010456
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