刺參屬于棘皮動物門（Echinodermata）、海參綱（Holothuroidea）,是我國北方重要的海珍品之一。近年來,我國刺參養(yǎng)殖得以長足發(fā)展,規(guī)模拓展迅猛,直接經(jīng)濟產(chǎn)值約300億元,是我國海水養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)中單一產(chǎn)值最大的物種,為沿海漁業(yè)經(jīng)濟結(jié)構(gòu)的調(diào)整和漁民就業(yè)及增產(chǎn)增收提供了重要途徑。隨著刺參產(chǎn)業(yè)規(guī)模的逐漸擴大,種質(zhì)退化、生長緩慢、養(yǎng)殖周期長、抵御環(huán)境變化能力差、病害頻發(fā)等一系列制約或潛在制約產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸問題也日益凸顯,分子標記輔助育種是解決上述問題的有效手段。隨著分子技術的發(fā)展,構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,利用與目標性狀緊密連鎖的分子標記對性狀的遺傳改良是當今水產(chǎn)動物遺傳育種的研究熱點。但由于小樣本作圖QTL區(qū)間過大和易受環(huán)境影響的原因,導致QTL的檢測和對QTL效應評估發(fā)生偏離,因此對QTL進行驗證是實施MAS的前提。本研究在前期構(gòu)建的刺參高密度遺傳連鎖圖譜的基礎上篩選重要性狀相關的QTL位點并進行驗證和生產(chǎn)性應用實踐,利用SSR對刺參進行親子鑒定分析,以期為刺參分子標記輔助育種提供基礎數(shù)據(jù)。本文研究結(jié)果如下:1.刺參重要經(jīng)濟性狀相關SNP標記的篩選實驗室前期構(gòu)建了刺參高密度遺傳連鎖圖... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

QTL定位分析統(tǒng)計

刺參體長、體寬、體重、棘刺總數(shù)性狀相關QTL在連鎖圖譜上的分布

圖 2-3 刺參抗病力相關 QTL 在連鎖圖譜上的分布Fig.2-3 QTL in locus group associated with disease resistance參重要性狀相關 SNP 位點篩選結(jié)果用 Samtools 軟件上述獲得的 81 個 SLAF 標簽序列進行多態(tài)性分析， 841 個 SNP 位點。采用 SPSS20.0 軟件中的 GLM 模型對這些 SNP 位子代的 5 個性狀的測定數(shù)據(jù)進行相關性分析，篩選到 189 個與性狀相點。根據(jù)測序結(jié)果進行 SNP 基因分型數(shù)據(jù)統(tǒng)計，對相應位點的 SNP狀數(shù)據(jù)進行；對相應 SNP 位點在子代中的基因型分類統(tǒng)計后與表型關性分析，篩選可獲得性狀相關的優(yōu)勢基因型的 SNP 位點 79 個。型進行引物設計是需要SNP變異位點兩側(cè)有足夠的側(cè)翼序列，根據(jù)H法分型的條件和測序結(jié)果挑選在不同基因型之間在關聯(lián)性狀差異顯著序列大于 200bp、無不確定堿基并且突變頻率>1%的 SNP 位點，最終件的可用于后續(xù) SNP 位點分型驗證的位點共 26 個。


本文編號：2976509