黃河裸裂尻魚（Schizopygopsis pylzovi）屬于鯉形目（Cypriniformes）裂腹魚屬,主要分布在青藏高原和黃河上游的干支流水域,是當(dāng)?shù)刂匾慕?jīng)濟(jì)魚類之一。本研究以我國(guó)西部黃河流域不同水域的黃河裸裂尻魚（Schizopygopsis pylzovi）種群為研究對(duì)象,應(yīng)用線粒體DNA控制區(qū)序列與細(xì)胞色素b基因（Cyt b）序列,分析不同生境或水系黃河裸裂尻魚種群的遺傳多樣性組成,初步探討了不同水域黃河裸裂尻魚種群間的遺傳組成和結(jié)構(gòu)。論文主要研究結(jié)果如下:采用細(xì)胞色素b基因序列對(duì)不同水域黃河裸裂尻魚種群進(jìn)行序列分析,研究不同水域黃河裸裂尻魚的遺傳組成和變異。合并NCBI下載的15尾黃河裸裂尻魚Cyt b序列進(jìn)行分析,比對(duì)后獲得Cyt b序列長(zhǎng)為1137bp。結(jié)果表明,所有序列中,共檢測(cè)到335個(gè)堿基替換位點(diǎn),替換比例為29.5%;簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)為304,占變異位點(diǎn)總數(shù)的85.6%;所有序列中,A、T、G和C的含量分別為25.5%、30.9%、17.0%、26.6%。在不同水域黃河裸裂尻魚種群個(gè)體中,共檢測(cè)到55種單倍型。除2種單倍型在超過2個(gè)種群間共享,5種單倍型在2... 

【文章來源】：武漢輕工大學(xué)湖北省

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

黃河裸裂尻魚基因組DNA瓊脂糖凝膠檢測(cè)結(jié)果

果樣品 DNA 的提取及線粒體 DNA Cyt b 序列的擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)酚/氯仿法提取黃河裸裂尻魚的基因組 DNA 并進(jìn)行凝膠電泳檢測(cè)。河裸裂尻魚種群部分 DNA 的瓊脂糖電泳圖。圖中所提取樣品的 DNA 條這表明所提取的 DNA 質(zhì)量較好。圖 3.2 是對(duì) TaqDNA 聚合酶濃度和退度優(yōu)化后獲得最佳反應(yīng)條件后進(jìn)行 DNA 樣品的 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖，0bp 左右。圖 3.1 黃河裸裂尻魚基因組 DNA 瓊脂糖凝膠檢測(cè)結(jié)果

Li's D*檢驗(yàn)值和 Fu and Li's F*檢驗(yàn)值統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果差異極顯著（P<0.01）。表 3.4 不同黃河裸裂尻魚種群 Cytb 序列單倍型分布的中性檢驗(yàn)中性檢驗(yàn) DTH GEM GTH DL LQ MDTajima’s D -2.269** -0.808 -2.011* 4.035** -0.552 3.094**Fu and Li's D* -3.396** -0.622 -2.617** 1.969** 1.469* 1.241Fu and Li's F* -3.564** -0.736 -2.803** 3.155** 0.920 2.257**注：*表示差異顯著(P< 0.05)，**表示差異極顯著(P < 0.01)3.2.5 單倍型堿基錯(cuò)位分布分析 Mismatch distribution基于單倍型數(shù)據(jù)，采用 DnaSP 軟件以恒定群體大小為期望模型（Constantpopulation size），生成 DTH 種群和 GTH 種群的單倍型堿基錯(cuò)位分布圖（圖 3.3 和圖3.4），結(jié)果表明，單倍型堿基錯(cuò)位分布呈現(xiàn)單峰，說明偏離原種群恒定假設(shè)模型；同時(shí)采用 Arlequin 生成 DTH 種群和 GTH 種群?jiǎn)伪缎蛪A基錯(cuò)位分布圖（圖 3.5 和 3.6），結(jié)果表明，參數(shù) SSD 和參數(shù) R 統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)均不顯著，即不能拒絕群體擴(kuò)張假說。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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