斑馬魚（Danio rerio）作為重要的模式生物之一,在研究天然免疫應(yīng)答方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢,受精后的3-4周內(nèi)只具有天然免疫,不具有獲得性免疫。Notch信號通路在斑馬魚胚胎的發(fā)育過程中具有重要的作用,有研究發(fā)現(xiàn),Notch信號通路在獲得性免疫應(yīng)答中同樣行使功能。然而,關(guān)于Notch信號通路在天然免疫應(yīng)答過程的調(diào)控機(jī)制仍不明了。副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）是一種人獸共患的主要病原之一,既可以感染水生動物,又可以感染人類,造成的后果嚴(yán)重,但是關(guān)于其具體的致病機(jī)制還有待深入研究。本文用副溶血弧菌感染3 dpf（days post fertilization）的斑馬魚幼魚2h,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平差異表達(dá)基因的類型,初步研究了Notch1a信號通路在天然免疫應(yīng)答中的作用機(jī)制。首先通過比較浸泡感染與尾靜脈注射感染兩種感染方式下野生型斑馬魚的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)浸泡感染差異表達(dá)的基因為602個,其中427個基因下調(diào),175個基因上調(diào),已報道的參與天然免疫的基因15個,分別為il11a、ccl34、tnfb、ccl20a、cxcr4a、cxcl3、fosl1a、... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

Vp13的毒力基因的檢測Fig2.1DetectionofvirulencerelatedgenesofVp132%的瓊脂糖凝膠電泳檢測，DNAmaker為50-500bp

圖 2.2 A/T/G/C 堿基含量分布統(tǒng)計圖Fig 2.2 The statistics ofA/T/G/C bases注：橫坐標(biāo)堿基在所檢測序列中的位置；縱坐標(biāo)是堿基占比。質(zhì)量分布

圖 2.3 堿基質(zhì)量分布統(tǒng)計圖Fig 2.3 The statistics of quality of bases是堿基在所檢測序列中的位置；縱坐標(biāo)是reads的堿基質(zhì)量值（Q值， 15=Lowest），如果某堿基質(zhì)量值為30（Q30），則表示該堿基測序出0.001（10-3）。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：2959357