草魚TBK1基因的克隆及其參與IFN-Ⅰ信號(hào)通路調(diào)節(jié)的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-02 01:23
草魚(Ctenopharyngodon idella)是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)魚類之一。然而,草魚極易受到草魚呼腸孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)的感染。干擾素(interferon,IFN)是一種重要的細(xì)胞功能調(diào)節(jié)因子,具有抗病毒、抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)等功能。宿主細(xì)胞IFN的誘導(dǎo)產(chǎn)生及其后續(xù)信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制既是機(jī)體抗病毒的第一道防線更是免疫學(xué)研究的核心內(nèi)容之一。TANK結(jié)合激酶1(TANK-binding kinase 1,TBK1)是IKK相關(guān)激酶家族的一員,在機(jī)體抗病毒、抗菌免疫中發(fā)揮重要作用。TBK1可磷酸化下游的干擾素調(diào)節(jié)因子3/7(interferon regulatory factor 3/7,IRF3/7)誘導(dǎo)干擾素的表達(dá)。相對(duì)于哺乳類而言,TBK1信號(hào)通路在硬骨魚中研究較少。本試驗(yàn)通過本地EST數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和RACE技術(shù)克隆得到草魚TBK1(CiTBK1)序列;構(gòu)建啟動(dòng)子載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞分析啟動(dòng)子活性;用定量RT-PCR法檢測(cè)了CiTBK1的組織差異表達(dá)模式、病毒或細(xì)菌PAMPs刺激后的時(shí)序表達(dá)模式;構(gòu)建過表達(dá)載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞研究了CiTBK1介導(dǎo)的免疫反應(yīng)。取得...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 草魚與草魚出血病的概述
1.2 先天性免疫的模式識(shí)別受體
1.2.1 TLR家族
1.2.2 RLR家族
1.3 TBK1研究概述
1.3.1 TBK1的發(fā)現(xiàn)及結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 TBK1的功能
1.3.3 TBK1信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控機(jī)制
1.3.4 魚類TBK1基因的研究進(jìn)展
1.4 研究目的和意義
第二章 草魚TBK1基因的克隆及其參與IFN-I信號(hào)通路調(diào)節(jié)的功能研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 CiTBK1基因的cDNA序列獲得
2.2.3 CiTBK1基因組序列擴(kuò)增
2.2.4 CiTBK1基因序列的生物信息學(xué)分析
2.2.5 CiTBK1啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.2.6 CiTBK1基因體內(nèi)和體外的表達(dá)模式
2.2.7 CiTBK1過表達(dá)載體的構(gòu)建和轉(zhuǎn)染
2.2.8 GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激后CiTBK1、CiIRF3、CiIRF7、CiIFN-I、CiMx1定量檢測(cè)
2.2.9 CiTBK1基因的抗GCRV活性分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 CiTBK1基因組及序列分析
2.3.2 啟動(dòng)子預(yù)測(cè)和驗(yàn)證
2.3.3 CiTBK1基因的組織差異表達(dá)
2.3.4 CiTBK1在GCRV感染的脾臟和頭腎組織中的時(shí)序表達(dá)
2.3.5 CiTBK1在GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激的CIK細(xì)胞中的時(shí)序表達(dá)
2.3.6 GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激后CiTBK1、CiIRF3、CiIRF7、CiIFN-I和CiMx1定量檢測(cè)
2.3.7 CiTBK1基因的抗GCRV活性
2.4 討論
2.4.1 CiTBK1基因的結(jié)構(gòu)特征
2.4.2 CiTBK1啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.4.3 CiTBK1體內(nèi)外表達(dá)
2.4.4 CiTBK1參與IFN-I信號(hào)通路調(diào)節(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]草魚呼腸孤病毒分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李永剛,曾偉偉,王慶,殷亮,王英英,石存斌,吳淑勤. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(04)
[2]草魚呼腸孤病毒的致病機(jī)制及抗病毒新對(duì)策[J]. 郭帥,李家樂,呂利群. 漁業(yè)現(xiàn)代化. 2010(01)
[3]草魚呼腸孤病毒及其免疫防治研究進(jìn)展[J]. 肖波. 魯東大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(01)
本文編號(hào):2952371
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 草魚與草魚出血病的概述
1.2 先天性免疫的模式識(shí)別受體
1.2.1 TLR家族
1.2.2 RLR家族
1.3 TBK1研究概述
1.3.1 TBK1的發(fā)現(xiàn)及結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 TBK1的功能
1.3.3 TBK1信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控機(jī)制
1.3.4 魚類TBK1基因的研究進(jìn)展
1.4 研究目的和意義
第二章 草魚TBK1基因的克隆及其參與IFN-I信號(hào)通路調(diào)節(jié)的功能研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 CiTBK1基因的cDNA序列獲得
2.2.3 CiTBK1基因組序列擴(kuò)增
2.2.4 CiTBK1基因序列的生物信息學(xué)分析
2.2.5 CiTBK1啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.2.6 CiTBK1基因體內(nèi)和體外的表達(dá)模式
2.2.7 CiTBK1過表達(dá)載體的構(gòu)建和轉(zhuǎn)染
2.2.8 GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激后CiTBK1、CiIRF3、CiIRF7、CiIFN-I、CiMx1定量檢測(cè)
2.2.9 CiTBK1基因的抗GCRV活性分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 CiTBK1基因組及序列分析
2.3.2 啟動(dòng)子預(yù)測(cè)和驗(yàn)證
2.3.3 CiTBK1基因的組織差異表達(dá)
2.3.4 CiTBK1在GCRV感染的脾臟和頭腎組織中的時(shí)序表達(dá)
2.3.5 CiTBK1在GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激的CIK細(xì)胞中的時(shí)序表達(dá)
2.3.6 GCRV、poly I:C、LPS和PGN刺激后CiTBK1、CiIRF3、CiIRF7、CiIFN-I和CiMx1定量檢測(cè)
2.3.7 CiTBK1基因的抗GCRV活性
2.4 討論
2.4.1 CiTBK1基因的結(jié)構(gòu)特征
2.4.2 CiTBK1啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.4.3 CiTBK1體內(nèi)外表達(dá)
2.4.4 CiTBK1參與IFN-I信號(hào)通路調(diào)節(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]草魚呼腸孤病毒分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李永剛,曾偉偉,王慶,殷亮,王英英,石存斌,吳淑勤. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(04)
[2]草魚呼腸孤病毒的致病機(jī)制及抗病毒新對(duì)策[J]. 郭帥,李家樂,呂利群. 漁業(yè)現(xiàn)代化. 2010(01)
[3]草魚呼腸孤病毒及其免疫防治研究進(jìn)展[J]. 肖波. 魯東大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(01)
本文編號(hào):2952371
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